Plataporma | Gidak-on sa Library | Theoretical Data Yield (Kada Cell) | Single-base nga Katukma | Mga aplikasyon |
Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Cell | 85-92% | SV nga pagtawag, De novo, Full-length sequencing, Iso-Seq, Gene annotation, Detection sa DNA methylation |
● Kapin sa 5 ka tuig nga kasinatian sa PacBio sequencing platform nga adunay liboan ka sirado nga mga proyekto nga adunay lain-laing mga espisye.
● Ang BMKGENE usa ka opisyal nga kauban sa Oxford Nanopore, nga adunay duha ka plataporma nga RNA/DNA nga sertipikasyon.
● Adunay mga mainstream nga mga modelo sa mga sequencer nga adunay kompleto nga kagamitan ug igo nga sequencing throughput.
● Pinasukad sa Nanopore nga plataporma, kapin sa 10 ka mananap ug tanom nga mga panukiduki sa Denovo ang napatik sa internasyonal nga inila nga mga journal.
Sample Type | kantidad | Konsentrasyon(Qubit®) | Tomo | Kaputli | Ang uban |
Genomic nga DNA | Depende sa Data Requirement | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; Tin-aw nga peak sa 260 nm, walay kontaminasyon | Ang konsentrasyon kinahanglang sukdon pinaagi sa Qubit ug Qubit/Nanopore ≤ 2 |
Kinatibuk-ang RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5;walay kontaminasyon | RIN bili ≥7.5 |
Data Quality Assessment sa DNA Sample
Talaan 1. Estadistika sa limpyo nga datos.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | limpyoN50Len | limpyoN90Len | limpyoMeanLen | limpyoMaxLen | limpyoMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Data Quality Assessment sa RNA Sample
Talaan 1. Estadistika sa limpyo nga datos.
Ngalan sa File | ClientID | BasahaNum | BaseNum | N50 | MeanLength | MaxLength | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Figure 1. Basaha ang gitas-on sa pag-apod-apod
Figure 2. Quality score distribution sa limpyo nga datos
Figure 3. Ang gitas-on ug kalidad nga pag-apod-apod sa marka sa limpyo nga datos