BMKCloud Log in
条形banner-03

Mga produkto

DNA/RNA Sequencing – Nanopore Sequencer

Ang ONT sequencing usa ka molekula nga real-time nga electrical signal sequencing nga teknolohiya base sa nanopores, ang sequencing nga prinsipyo sa matag plataporma parehas.Ang double-stranded nga DNA/RNA mogapos sa nanoporous nga protina nga nasulod sa biofilm ug mag-unwinding ubos sa lead sa motor protein, ubos sa aksyon sa boltahe nga kalainan gikan sa duha ka kilid sa biofilm, ang DNA/RNA strands moagi sa nanopore channel protein sa usa ka piho. rate.Tungod sa mga kalainan sa kemikal nga mga kabtangan sa lain-laing mga base sa DNA/RNA strand, sa diha nga ang usa ka base o DNA molekula moagi sa nanopore channel, kini hinungdan sa kausaban sa lain-laing mga electrical signal.Pinaagi sa pag-ila ug katugbang niini nga mga signal, ang katugbang nga mga tipo sa base mahimong makalkulo, ug ang tinuod nga panahon nga pagkakita sa han-ay mahimong makompleto.


Mga Detalye sa Serbisyo

Resulta sa Demo

Mga Detalye sa Serbisyo

Plataporma

Gidak-on sa Library

Theoretical Data Yield (Kada Cell)

Single-base nga Katukma

Mga aplikasyon

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Cell

85-92%

SV nga pagtawag, De novo, Full-length sequencing, Iso-Seq, Gene annotation, Detection sa DNA methylation

Mga Bentaha sa Serbisyo

● Kapin sa 5 ka tuig nga kasinatian sa PacBio sequencing platform nga adunay liboan ka sirado nga mga proyekto nga adunay lain-laing mga espisye.
● Ang BMKGENE usa ka opisyal nga kauban sa Oxford Nanopore, nga adunay duha ka plataporma nga RNA/DNA nga sertipikasyon.
● Adunay mga mainstream nga mga modelo sa mga sequencer nga adunay kompleto nga kagamitan ug igo nga sequencing throughput.
● Pinasukad sa Nanopore nga plataporma, kapin sa 10 ka mananap ug tanom nga mga panukiduki sa Denovo ang napatik sa internasyonal nga inila nga mga journal.

Sample nga Kinahanglanon


Sample Type

kantidad

Konsentrasyon(Qubit®)

Tomo

Kaputli

Ang uban

Genomic nga DNA

Depende sa Data Requirement

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Tin-aw nga peak sa 260 nm, walay kontaminasyon

Ang konsentrasyon kinahanglang sukdon pinaagi sa Qubit ug Qubit/Nanopore ≤ 2

Kinatibuk-ang RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5;walay kontaminasyon

RIN bili ≥7.5

 

Pag-alagad sa Trabaho

pag-andam sa sample

Pagpangandam sa sample

Pagpangandam sa Library

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

Pagtuki sa datos

Sample nga QC

Paghatud sa proyekto


  • Kaniadto:
  • Sunod:

  • Data Quality Assessment sa DNA Sample

    Talaan 1. Estadistika sa limpyo nga datos.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    limpyoN50Len

    limpyoN90Len

    limpyoMeanLen

    limpyoMaxLen

    limpyoMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    Data Quality Assessment sa RNA Sample

    Talaan 1. Estadistika sa limpyo nga datos.

    Ngalan sa File

    ClientID

    BasahaNum

    BaseNum

    N50

    MeanLength

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Figure 1. Basaha ang gitas-on sa pag-apod-apod

    A3

    Figure 2. Quality score distribution sa limpyo nga datos

    A4

    Figure 3. Ang gitas-on ug kalidad nga pag-apod-apod sa marka sa limpyo nga datos

    A5

    pagkuha sa usa ka kinutlo

    Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

    Ipadala ang imong mensahe kanamo: