●Mga plataporma:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten ug BGI-DNB-T7
●Mga paagi sa pagkasunodsunod:PE50, PE100, PE150, PE250
●Pagkontrol sa kalidad sa mga librarya sa wala pa ang pagsunud
●Pagsunud sa pagpadala sa datos ug QC:paghatud sa QC report ug hilaw nga datos sa fastq format human sa demultiplexing ug pagsala sa Q30 reads.
●Pagkadaghan sa mga serbisyo sa Sequencing:ang kustomer mahimong mopili sa pagkasunodsunod pinaagi sa lane, flow cell o gidaghanon sa datos.
●Pagkadaku sa mga plataporma:Ang mga librarya sa DNB mahimong ibalhin sa mga plataporma sa Illumina
●Daghang kasinatian sa plataporma sa pagsunud sa Illumina:nga adunay libu-libo nga mga sirado nga proyekto nga adunay lainlaing mga espisye.
●Paghatud sa sequencing QC report:nga adunay kalidad nga mga sukatan, katukma sa datos ug kinatibuk-ang pasundayag sa pagsunud-sunod nga proyekto.
●Mature nga proseso sa pagkasunodsunod:uban sa mubo nga turn-around nga panahon.
●Hugot nga Pagkontrol sa Kalidad: gipatuman namo ang higpit nga mga kinahanglanon sa QC aron magarantiya ang paghatud sa makanunayon nga taas nga kalidad nga mga resulta.
Gidaghanon sa Data (X) | Konsentrasyon (qPCR/nM) | Tomo |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Plataporma | Konsentrasyon (qPCR/nM) | Tomo |
HiSeq X Napulo | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
Dugang sa konsentrasyon ug kinatibuk-ang kantidad, gikinahanglan usab ang angay nga peak pattern.
Ang usa ka taho sa kalidad sa librarya gihatag sa wala pa ang pagsunud-sunod, pagsusi sa kantidad sa librarya, ug pagkabahinbahin.
Talaan 1. Estadistika sa sequencing data.
Sample ID | BMKID | Hilaw nga pagbasa | Hilaw nga Data (bp) | Limpyo nga mga pagbasa (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figure 1. Ang kalidad nga pag-apod-apod sa mga pagbasa sa matag sample
Figure 2. Base nga content distribution
Figure 3. Distribusyon sa nabasa nga mga sulod sa sequencing data