Mga produkto

circRNA sequencing-Illumina

Ang circular RNA sequencing (circRNA-seq) mao ang pag-profile ug pag-analisa sa mga circular RNA, usa ka klase sa mga molekula sa RNA nga nagporma og closed loops tungod sa non-canonical splicing nga mga panghitabo, nga naghatag niini nga RNA og dugang nga kalig-on.Samtang ang pipila ka mga circRNAs gipakita nga molihok isip mga microRNA nga espongha, nag-sequest sa mga microRNA ug nagpugong kanila sa pag-regulate sa ilang mga target nga mRNA, ang ubang mga circRNAs mahimong makig-uban sa mga protina, modulate sa gene expression, o adunay mga papel sa mga proseso sa cellular.Ang pag-analisa sa ekspresyon sa circRNA naghatag mga panan-aw sa mga papel sa regulasyon sa kini nga mga molekula ug ang ilang kamahinungdanon sa lainlaing mga proseso sa cellular, yugto sa pag-uswag, ug mga kondisyon sa sakit, nga nakatampo sa usa ka mas lawom nga pagsabut sa pagkakomplikado sa regulasyon sa RNA sa konteksto sa ekspresyon sa gene.

Kontaka Kami

Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta sa Demo

Gipili nga mga Publikasyon

Mga bahin

● rRNA depletion nga gisundan sa pag-andam sa direksyon sa librarya, nga makahimo sa sequencing data nga strand-specific.

● Ang bioinformatic workflow makahimo sa circRNA prediction ug expression quantification

Mga Bentaha sa Serbisyo

●Mas komprehensibo nga RNA library:gigamit namo ang rRNA depletion imbes nga linear RNA depletion sa among pre-library nga pag-andam, pagsiguro nga ang sequencing data naglakip dili lamang sa circRNA kondili usab sa mRNA ug lncRNA, nga makapahimo sa hiniusang pagtuki niini nga mga datasets.

●Opsyonal nga pagtuki sa kompetisyon nga endogenous RNA (ceRNA) nga mga network: paghatag ug mas lawom nga pagsabot sa cellular regulatory mechanisms

●Lapad nga Eksperto: nga adunay track record sa pagproseso sa labaw sa 20,000 nga mga sample sa BMK, nga naglangkob sa lain-laing mga sample type ug lncRNA nga mga proyekto, ang among team nagdala og daghang kasinatian sa matag proyekto.

●Hugot nga Pagkontrol sa Kalidad: gipatuman namo ang mga core control point sa tanang yugto, gikan sa sample ug pag-andam sa library ngadto sa sequencing ug bioinformatics.Kini nga makuti nga pag-monitor nagsiguro sa paghatud sa kanunay nga taas nga kalidad nga mga sangputanan.

● Post-Sales Support: Ang among pasalig molapas pa sa pagkompleto sa proyekto nga adunay 3 ka bulan nga human sa pagbaligya nga panahon sa serbisyo.Niining panahona, nagtanyag kami nga pag-follow-up sa proyekto, tabang sa pag-troubleshoot, ug mga sesyon sa Q&A aron matubag ang bisan unsang mga pangutana nga may kalabotan sa mga resulta.

Sample nga Kinahanglanon ug Paghatud

Library	Plataporma	Girekomenda nga datos	Data QC
Poly A gipadato	Illumina PE150	16-20 Gb	Q30≥85%

Sample nga Kinahanglanon:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Gidaghanon (μg)

Kaputli

Integridad

≥ 100

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Limitado o walay kontaminasyon sa protina o DNA nga gipakita sa gel.

Para sa mga tanom: RIN≥6.5;

Para sa mga mananap: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

limitado o walay baseline elevation

● Mga tanom:

Root, Stem o Petal: 450 mg

Dahon o Binhi: 300 mg

Mga prutas: 1.2 g

● Hayop:

Kasingkasing o Tinai: 450 mg

Viscera o Utok: 240 mg

Kaunoran: 600 mg

Mga bukog, Buhok o Panit: 1.5g

● Mga Arthropod:

Mga insekto: 9g

Crustacea: 450 mg

● Tibuok dugo:2 tubo

● Mga selula: 10⁶mga selula

● Serum ug Plasma: 6 mL

Girekomenda nga Sample Delivery

Kontainer: 2 ml centrifuge tube (Tin foil dili girekomendar)

Sample nga pag-label: Grupo+kopya eg A1, A2, A3;B1, B2, B3...

pagpadala:

1. Dry-ice: Ang mga sample kinahanglang ibutang sa mga bag ug ilubong sa dry-ice.

2. RNAstable tubes: Ang mga sample sa RNA mahimong mamala sa RNA stabilization tube(eg RNAstable®) ug ipadala sa temperatura sa lawak.

Daloy sa Trabaho sa Serbisyo

Eksperimento nga disenyo

Sample nga paghatod

Pagkuha sa RNA

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

After-sale nga serbisyo

Kaniadto: Tibuok nga transcriptome sequencing - Illumina

Sunod: Gamay nga RNA sequencing-Illumina

Bioinformatics

panagna sa circRNA: pag-apod-apod sa chromosomal

Differentially Expressed circRNAs - Plano sa bulkan

Differentially Expressed circRNAs - hierarchical clustering

Functional enrichment sa circRNA's host genes

Susihon ang mga pag-uswag sa panukiduki nga gipadali sa mga serbisyo sa pagsunud sa circRNA sa BMKGene pinaagi sa usa ka curated nga koleksyon sa mga publikasyon.

Wang, X. ug uban pa.(2021) 'Ang CPSF4 nag-regulate sa circRNA formation ug microRNA mediated gene silencing sa hepatocellular carcinoma', Oncogene 2021 40:25, 40(25), pp. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.

Xia, K. ug uban pa.(2023) 'Ang X oo-responsive transcriptome nagpadayag sa papel sa circular RNA133 sa resistensya sa sakit pinaagi sa pag-regulate sa ekspresyon sa OsARAB sa bugas', Phytopathology Research, 5(1), pp. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.

Y, H. ug uban pa.(2023) 'Gi-modulate sa CPSF3 ang balanse sa circular ug linear transcript sa hepatocellular carcinoma'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.

Zhang, Y. ug uban pa.(2023) 'Komprehensibo nga pagsusi sa mga circRNA sa cirrhotic cardiomyopathy sa wala pa ug pagkahuman sa pagbalhin sa atay', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.