BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technical Scheme
Mga bentaha sa BMKMANU S1000
1) Sub-cellular nga resolusyon: Ang matag lugar sa pagkuha adunay> 2 milyon nga spatial Barcoded Spots nga adunay diyametro nga 2.5 µm ug usa ka gilay-on nga 5 µm taliwala sa mga sentro sa lugar, nga makapahimo sa spatial transcriptome analysis nga adunay sub-cellular resolution (5 µm).
2) Multi-level resolution analysis: Flexible multi-level analysis gikan sa 100 μm ngadto sa 5 μm aron masulbad ang lain-laing bahin sa tissue sa kamalaumon nga resolusyon.
3) Comprehensive transcriptome profiling: Ang mga transcript nga nakuha gikan sa tibuok tissue slide mahimong analisahon, nga walay pagdili sa gidaghanon sa target nga mga gene ug target nga lugar.
Mga Detalye sa Serbisyo
| Library | Estratehiya sa pagkasunodsunod | Girekomenda ang Data Output |
| S1000 cDNA librarya | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/sampol |
Sample nga Kinahanglanon
| Sampol | Numero | Gidak-on | Kalidad sa RNA |
| OCT nga naka-embed nga tissue block | 2-3 ka bloke/sampol | Gibanabana.6.8x6.8x6.8 mm3 | RIN≥7 |
Alang sa dugang nga mga detalye sa giya sa pag-andam sa sample ug dagan sa serbisyo, palihug ayaw pagduhaduha sa pagpakigsulti sa aEksperto sa BMKGENE
Daloy sa Trabaho sa Serbisyo
Eksperimento nga disenyo
Sample nga paghatod
Pre-eksperimento
Spatial nga barcoding
Pagtukod sa librarya
Pagsunodsunod
Pagtuki sa datos
After-sale nga serbisyo
Ang datos nga nahimo sa BMKMANU S1000 gisusi gamit ang software nga "BSTMatrix", nga independente nga gidisenyo sa BMKGENE, lakip ang:
1) Gene expression matrix nga henerasyon
2) HE image processing
3) Nahiuyon sa downstream nga third-party nga software alang sa pagtuki
4) Ang online nga "BSTViewer" makatabang aron makuha ang mga resulta sa visualization sa lainlaing mga resolusyon.
1.Spot clustering
2.Spatial distribution
Note: Resolusyonlebel=13 (100 µm, sa wala); 7 (50 µm, tuo)
3. Marker nga ekspresyon kadagaya clustering heatmap
4. Inter-sample nga pagtuki sa datos
