-
PacBio-Full-length Transcriptome (Dili Reference)
Ang plataporma sa Amplicon (16S/18S/ITS) gipalambo uban ang mga tuig nga kasinatian sa microbial diversity project analysis, nga naglangkob sa standardized basic analysis ug personalized analysis: basic analysis naglangkob sa mainstream analysis content sa kasamtangan nga microbial research, ang analysis content dato ug komprehensibo, ug ang mga resulta sa pagtuki gipresentar sa porma sa mga taho sa proyekto;Lainlain ang sulod sa personalized analysis.Ang mga sampol mahimong mapili ug ang mga parameter mahimong itakda nga flexible sumala sa sukaranan nga taho sa pagtuki ug katuyoan sa panukiduki, aron matuman ang mga personal nga kinahanglanon.Windows operating system, yano ug paspas.
-
PacBio-Full-length Transcriptome (Dili Reference)
Ang pagkuha sa Pacific Biosciences (PacBio) Isoform sequencing data isip input, kini nga App makahimo sa pag-ila sa bug-os nga gitas-on nga transcript sequences (nga walay assembly).Pinaagi sa pagmapa sa bug-os nga gitas-on nga mga han-ay batok sa reference genome, ang mga transcript mahimong ma-optimize sa nahibal-an nga mga gene, transcript, coding nga mga rehiyon, ug uban pa. Niini nga kaso, ang mas tukma nga pag-ila sa mga istruktura sa mRNA, sama sa alternatibong splicing, ug uban pa, mahimong makab-ot.Ang hiniusang pagtuki uban sa NGS transcriptome sequencing data makahimo sa mas komprehensibo nga annotation ug mas tukma nga quantification sa ekspresyon sa transcript level, nga kadaghanan nakabenepisyo sa downstream differential expression ug functional analysis.
-
Mga Toolkit
Ang BMKCloud usa ka nag-unang bioinformatic nga plataporma nga naghatag og one-stop nga solusyon alang sa genomic nga mga programa, nga kaylap nga gisaligan sa mga tigdukiduki sa nagkalain-laing arena lakip na ang medikal, agrikultura, kinaiyahan, ug uban pa. , computing resources, public database, bioinformtic online nga mga kurso, ug uban pa. Ang BMKCloud adunay lain-laing kanunay nga gigamit nga bioinformatic nga mga himan nga naglakip sa gene annotation, evolutionary genetic tools, ncRNA, data quality control, assembly, alignment, data extraction, mutations, statistics, figure generator, sequence pagtuki, ug uban pa.
-
gamay nga RNA
Ang gagmay nga RNA kay tipo sa mugbo nga non-coding RNA nga adunay average nga gitas-on nga 18-30 nt, lakip ang miRNA, siRNA ug piRNA.Kining gagmay nga mga RNA kay dako nga gitaho nga nalambigit sa nagkalain-laing biological nga proseso sama sa mRNA degradation, translation inhibition, heterochromatin formation, ug uban pa. SmallRNA sequencing analysis kaylap nga gigamit sa mga pagtuon sa animal/plant development, disease, virus, etc. Ang sequencing analysis platform naglangkob sa standard analysis ug advanced data mining.Sa base sa RNA-seq data, ang standard nga pag-analisa makab-ot ang miRNA identification ug prediction, miRNA target gene prediction, annotation ug expression analysis.Ang advanced nga pag-analisa makapahimo sa gipahiangay nga pagpangita ug pagkuha sa miRNA, paghimo sa diagram sa Venn, miRNA ug pagtukod sa target nga gene network.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Ang NGS-WGS usa ka tibuok genome re-sequencing analysis platform, nga gimugna base sa adunahang kasinatian sa Biomarker Technologies.Kining sayon gamiton nga plataporma nagtugot sa dali nga pagsumite sa usa ka hiniusa nga pag-analisa sa workflow pinaagi lamang sa pagtakda sa pipila ka batakang parameter, nga mohaum sa DNA sequencing data nga namugna gikan sa Illumina platform ug BGI sequencing platform.Kini nga plataporma gipakatap sa high performance computing server, nga naghatag ug gahom sa episyente kaayo nga pagtuki sa datos sa limitado kaayong panahon.Ang personalized data mining anaa sa base sa standard analysis, lakip ang mutated gene query, PCR primer design, etc.
-
mRNA(Reperensya)
Ang transcriptome mao ang sumpay tali sa genomic genetic nga impormasyon ug ang proteome sa biological function.Ang regulasyon sa lebel sa transkripsyon mao ang labing hinungdanon ug labing kaylap nga gitun-an nga mode sa regulasyon sa mga organismo.Ang transcriptome sequencing mahimong magsunodsunod sa transcriptome sa bisan unsang punto sa panahon o ubos sa bisan unsa nga kondisyon, nga adunay usa ka resolusyon nga tukma sa usa ka nucleotide.Kini mahimo nga dinamikong nagpakita sa lebel sa gene transcription, dungan nga pag-ila ug pag-ihap sa talagsaon ug normal nga mga transcript, ug paghatag sa istruktura nga impormasyon sa sample nga piho nga mga transcript.
Sa pagkakaron, ang teknolohiya sa transcriptome sequencing kay kaylap nga gigamit sa agronomy, medisina ug uban pang natad sa panukiduki, lakip na ang regulasyon sa pagpalambo sa mananap ug tanom, pagpahiangay sa kalikopan, interaksyon sa imyunidad, lokalisasyon sa gene, ebolusyon sa genetic sa espisye ug pagtuki sa tumor ug genetic nga sakit.
-
Metagenomics (NGS)
Kini nga plataporma sa pagtuki gidisenyo alang sa shotgun metagenomic data analysis base sa mga tuig nga kasinatian.Naglangkob kini sa integrated workflow nga naglangkob sa nagkalain-laing mga kasagarang gikinahanglan nga metagenomics analysis lakip na ang pagproseso sa datos, species-level nga pagtuon, gene function-level nga pagtuon, metagenome binning, ug uban pa. , setting sa parameter, personalized figure generating, etc.
-
LncRNA
Ang long non-coding RNAs (lncRNA) maoy usa ka matang sa mga transcript nga adunay gitas-on nga mas taas pa sa 200 nt, nga dili maka-code sa mga protina.Ang natipon nga ebidensya nagsugyot nga kadaghanan sa mga lncRNA lagmit nga magamit.Ang high-throughput sequencing technologies ug bioinformatic analysing tools naghatag ug gahom kanamo sa pagpadayag sa lncRNA sequence ug positioning information nga mas episyente ug mogiya kanamo sa pagdiskubre sa mga lncRNA nga adunay mahinungdanong regulatory functions.Mapasigarbuhon ang BMKCloud sa paghatag sa among mga kustomer nga lncRNA sequencing analysis platform aron makab-ot ang paspas, kasaligan ug flexible nga pagsusi sa lncRNA.
-
GWAS
Ang Genome-wide association study (GWAS) nagtumong sa pag-ila sa mga variant sa genetiko (genotype) nga nalangkit sa piho nga mga kinaiya (phenotype).Gisusi sa mga pagtuon sa GWA ang mga genetic marker nga nagtabok sa tibuuk nga genome sa daghang mga indibidwal ug nagtagna sa mga asosasyon sa genotype-phenotype pinaagi sa pagtuki sa istatistika sa lebel sa populasyon.Ang whole-genome resequencing posibling makadiskubre sa tanang genetic variants.Uban sa phenotypic data, ang GWAS mahimong maproseso aron mahibal-an ang mga SNP nga may kalabutan sa phenotype, QTL ug mga kandidato nga gene, nga kusganong nagpaluyo sa modernong pagpasanay sa hayop/tanom.Ang SLAF kay usa ka self-developed nga gipasimple nga genome sequencing strategy, nga nakadiskubre sa genome-wide distributed markers, SNP.Kini nga mga SNP, ingon nga molekula nga genetic marker, mahimong maproseso alang sa mga pagtuon sa asosasyon nga adunay gipunting nga mga kinaiya.Kini usa ka cost-effective nga estratehiya sa pag-ila sa mga komplikadong mga kinaiya nga may kalabutan sa genetic variation.
-
Nanopore Full-length transcriptomics
Ang komplikado ug lainlain nga alternatibo nga isoform sa mga organismo hinungdanon nga mekanismo sa genetic para sa pag-regulate sa ekspresyon sa gene ug pagkalainlain sa protina.Ang tukma nga pag-ila sa mga istruktura sa transcript mao ang sukaranan alang sa lawom nga pagtuon sa mga pattern sa regulasyon sa ekspresyon sa gene.Ang plataporma sa pagsunud sa Nanopore malampuson nga nagdala sa transcriptomic nga pagtuon sa lebel sa isoform.Kini nga plataporma sa pag-analisa kay gilaraw aron analisahon ang datos sa RNA-Seq nga namugna sa Nanopore nga plataporma base sa reference genome, nga nakab-ot ang qualitative ug quantitative analysis sa gene level ug transcripts level.
