Productes

Seqüenciació d'ARN d'un sol nucli

L'avenç en la captura de cèl·lules individuals i la tècnica de construcció de biblioteques individuals que es combinen amb la seqüenciació d'alt rendiment permeten estudis d'expressió gènica cèl·lula per cèl·lula.Permet una anàlisi del sistema més profunda i completa de poblacions cel·lulars complexes, en la qual evita en gran mesura l'emmascarament de la seva heterogeneïtat fent la mitjana de totes les cèl·lules.

No obstant això, algunes cèl·lules no són adequades per convertir-se en suspensió unicel·lular, de manera que es necessiten altres mètodes de preparació de mostres: l'extracció del nucli dels teixits, és a dir, el nucli s'extreu directament de teixits o cèl·lules i es prepara en suspensió d'un sol nucli per a un sol nucli. seqüenciació cel·lular.

BMK ofereix un servei de seqüenciació d'ARN unicel·lular basat en 10x Genomics ChromiumTM.Aquest servei s'ha utilitzat àmpliament en estudis sobre estudis relacionats amb malalties, com ara la diferenciació de cèl·lules immunitàries, heterogeneïtat del tumor, desenvolupament de teixits, etc.

Xip de transcriptoma espacial: 10× Genòmica

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq

Contacta amb nosaltres

Detalls del servei

Bioinformàtica

Resultats de demostració

Principi tècnic

L'aïllament dels nuclis s'aconsegueix mitjançant 10× Genomics ChromiumTM, que consta d'un sistema de microfluídica de vuit canals amb dobles encreuaments.En aquest sistema, s'encapsulen perles de gel amb codis de barres i imprimació, enzims i un únic nucli en una gota d'oli de la mida d'un nanolitre, generant perles de gel en emulsió (GEM).Un cop formats els GEM, es realitza la lisi cel·lular i l'alliberament de codis de barres a cada GEM.L'ARNm es transcriu inversament en molècules d'ADNc amb codis de barres 10 × i UMI, que estan subjectes a més a la construcció estàndard de la biblioteca de seqüenciació.

El teixit no és adequat per a la preparació de suspensió cel·lular

Cèl·lula / Teixit	Raó
Teixit congelat no fresc	No es poden obtenir organitzacions noves o desades des de fa temps
Cèl·lula muscular, megacariocit, greix...	El diàmetre de la cel·la és massa gran per entrar a l'instrument
fetge…	Massa fràgil per trencar-se, incapaç de distingir cèl·lules individuals
Cèl·lula neuronal, cervell...	Més sensible, fàcil d'estressar, canviarà els resultats de la seqüenciació
Pàncrees, tiroides...	Ric en enzims endògens, que afecten la producció de suspensió unicel·lular

Nucli únic vs unicel·lular

Nucli únic	Unicel·lular
Diàmetre cel·lular il·limitat	Diàmetre cel·lular: 10-40 μm
El material pot ser teixit congelat	El material ha de ser teixit fresc
Baix estrès de les cèl·lules congelades	El tractament enzimàtic pot provocar una reacció d'estrès cel·lular
No cal eliminar glòbuls vermells	Cal eliminar els glòbuls vermells
Nuclear expressa bioinformació	Tota la cèl·lula expressa bioinformació