-
BSA
La plataforma d'anàlisi segregant a granel consisteix en anàlisi estàndard d'un sol pas i anàlisi avançada amb paràmetres personalitzats.BSA és una tècnica emprada per identificar ràpidament marcadors genètics associats al fenotip.El flux de treball principal de BSA conté: 1. seleccionar dos grups d'individus amb fenotips extremadament oposats;2. agrupar l'ADN, l'ARN o SLAF-seq (desenvolupat per Biomarker) de tots els individus per formar dos massa d'ADN;3. Identificació de seqüències diferencials contra el genoma de referència o entremig, 4. Predicció de regions enllaçades candidates mitjançant algorisme ED i SNP-index;5. Anàlisi funcional i enriquiment de gens en regions candidates, etc. També hi ha disponibles mines més avançades en dades, incloent-hi el cribratge de marcadors genètics i el disseny d'imprimació.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
La plataforma Amplicon (16S/18S/ITS) es desenvolupa amb anys d'experiència en l'anàlisi de projectes de diversitat microbiana, que conté anàlisi bàsica estandarditzada i anàlisi personalitzada: l'anàlisi bàsica cobreix el contingut d'anàlisi principal de la investigació microbiana actual, el contingut de l'anàlisi és ric i complet, i els resultats de l'anàlisi es presenten en forma d'informes de projecte;El contingut de l'anàlisi personalitzada és divers.Es poden seleccionar mostres i els paràmetres es poden establir de manera flexible segons l'informe d'anàlisi bàsic i el propòsit de la investigació, per realitzar requisits personalitzats.Sistema operatiu Windows, senzill i ràpid.
-
Genètica evolutiva
La genètica evolutiva és un servei de seqüenciació complet dissenyat per proporcionar una interpretació completa de la informació evolutiva de materials donats basant-se en variacions genètiques, inclosos els SNP, InDels, SV i CNV.Proporciona totes les anàlisis fonamentals necessàries per descriure els canvis evolutius i les característiques genètiques de les poblacions, com ara l'estructura de la població, la diversitat genètica, les relacions filogèniques, etc. També conté estudis sobre el flux genètic, que permet estimar la mida efectiva de la població i el temps de divergència.
-
Genòmica Comparada
La genòmica comparada significa literalment comparar les seqüències completes del genoma i les estructures de diferents espècies.Aquesta disciplina té com a objectiu revelar l'evolució de les espècies, la funció gènica, el mecanisme regulador del gen a nivell del genoma mitjançant la identificació de les estructures de seqüències i els elements que es van conservar o es van diferenciar en diferents espècies.L'estudi típic de genòmica comparada inclou anàlisis en família de gens, desenvolupament evolutiu, duplicació del genoma sencer, pressió selectiva, etc.
-
Genètica evolutiva
La plataforma d'anàlisi genètica de la població i l'evolució s'estableix a partir de la gran experiència acumulada durant anys a l'equip d'R+D de BMK.És una eina fàcil d'utilitzar, especialment per als investigadors que no estan especialitzats en bioinformàtica.Aquesta plataforma permet anàlisis bàsiques relacionades amb la genètica evolutiva bàsica, incloent la construcció d'arbres filogenètics, l'anàlisi del desequilibri d'enllaços, l'avaluació de la diversitat genètica, l'anàlisi d'escombrat selectiu, l'anàlisi de parentiu, l'ACP, l'anàlisi de l'estructura de la població, etc.
-
Muntatge del genoma basat en Hi-C
Hi-C és un mètode dissenyat per capturar la configuració del cromosoma combinant interaccions basades en la proximitat i la seqüenciació d'alt rendiment.Es creu que la intensitat d'aquestes interaccions està correlacionada negativament amb la distància física als cromosomes.Per tant, les dades d'Hi-C podrien guiar l'agrupació, l'ordenació i l'orientació de seqüències assemblades en un esborrany de genoma i ancorar-les a un nombre determinat de cromosomes.Aquesta tecnologia potencia un conjunt de genoma a nivell de cromosoma en absència de mapa genètic basat en la població.Cada genoma necessita un Hi-C.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Seqüenciació del genoma de planta/animal de nova
De NovoLa seqüenciació fa referència a la construcció del genoma sencer d'una espècie mitjançant tecnologies de seqüenciació, per exemple PacBio, Nanopore, NGS, etc., en absència d'un genoma de referència.La notable millora de la longitud de lectura de les tecnologies de seqüenciació de tercera generació ha aportat noves oportunitats en l'assemblatge de genomes complexos, com els que tenen una alta heterozigositat, una alta proporció de regions repetitives, poliploides, etc. Amb una longitud de lectura a nivell de desenes de quilobases, aquestes lectures de seqüenciació permeten resolució d'elements repetitius, regions amb continguts anormals de GC i altres regions altament complexes.
Plataforma: PacBio Sequel II/Nanopore PromethION P48/Illumina NovaSeq Platform
-
Seqüenciació de l'exoma sencer humà
La seqüenciació de l'exoma sencer (WES) es considera una estratègia de seqüenciació rendible per identificar mutacions que causen malalties.Tot i que els exons només ocupen aproximadament l'1,7% del genoma sencer, representa directament el perfil de les funcions totals de les proteïnes.En el genoma humà, s'ha informat que més del 85% de les mutacions relacionades amb la malaltia es produeixen a la regió codificant de proteïnes.
BMKGENE ofereix serveis complets i flexibles de seqüenciació de l'exoma complet humà amb diferents estratègies de captura d'exons disponibles per assolir diversos objectius de recerca.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Seqüenciació de fragments amplificats de locus específics (SLAF-Seq)
El genotipat d'alt rendiment, especialment en poblacions a gran escala, és un pas fonamental en els estudis d'associació genètica, que proporciona una base genètica per al descobriment de gens funcionals, l'anàlisi evolutiva, etc. ) s'introdueix per minimitzar el cost de seqüenciació per mostra, alhora que es manté una eficiència raonable en el descobriment de marcadors genètics.Això s'aconsegueix habitualment extraient fragments de restricció dins d'un interval de mida donat, que s'anomena biblioteca de representació reduïda (RRL).La seqüenciació de fragments amplificats de locus específics (SLAF-Seq) és una estratègia de desenvolupament propi per al genotipat SNP amb o sense un genoma de referència.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq -
Illumina i BGI
La tecnologia de seqüenciació Illumina, basada en la seqüenciació per síntesi (SBS), és una innovació de NGS adoptada a nivell mundial, responsable de generar més del 90% de les dades de seqüenciació del món.El principi de SBS consisteix a obtenir imatges de terminadors reversibles marcats fluorescentment a mesura que s'afegeix cada dNTP i, posteriorment, es divideix per permetre la incorporació de la següent base.Amb els quatre dNTP reversibles lligats al terminador presents a cada cicle de seqüenciació, la competència natural minimitza el biaix d'incorporació.Aquesta tecnologia versàtil admet biblioteques tant de lectura única com d'extrem aparellat, per a una sèrie d'aplicacions genòmiques.Les capacitats d'alt rendiment i la precisió de la seqüenciació d'Illumina la situen com una pedra angular en la investigació en genòmica, donant poder als científics per desentranyar les complexitats dels genomes amb un detall i una eficiència inigualables.
DNBSEQ, desenvolupat per BGI, és una altra tecnologia innovadora de NGS que ha aconseguit reduir encara més els costos de seqüenciació i augmentar el rendiment.La preparació de les biblioteques DNBSEQ implica la fragmentació de l'ADN, la preparació de ssDNA i l'amplificació del cercle rodant per obtenir les nanoboles d'ADN (DNB).A continuació, es carreguen sobre una superfície sòlida i posteriorment es seqüencian mitjançant la síntesi combinatòria de sonda-àncora (cPAS).
El nostre servei de seqüenciació de biblioteques prefabricats facilita als clients la preparació de les seves biblioteques de seqüenciació a partir de fonts diverses (ARNm, genoma sencer, amplicó, entre d'altres).Posteriorment, aquestes biblioteques es poden enviar als nostres centres de seqüenciació per al control de qualitat i la seqüenciació en plataformes Illumina o BGI.
