-
Seqüenciació del metatranscriptoma
La seqüenciació del metatranscriptoma identifica l'expressió gènica de microbis (tant eucariotes com procariotes) dins d'entorns naturals (és a dir, sòl, aigua, mar, femta i intestí.). Concretament, aquest servei us permet obtenir perfils d'expressió gènica completa de comunitats microbianes complexes, anàlisi taxonòmica. d'espècies, anàlisi d'enriquiment funcional de gens expressats de manera diferent i molt més.
Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq
-
Genoma fúngic
Les tecnologies de biomarcadors proporcionen estudis de genoma, genoma fi i genoma complet de fongs depenent de l'objectiu específic de la investigació.La seqüenciació, el muntatge i l'anotació funcional del genoma es poden aconseguir combinant la seqüenciació de la propera generació + la seqüenciació de la tercera generació per aconseguir un muntatge del genoma d'alt nivell.També es pot utilitzar la tecnologia Hi-C per facilitar el muntatge del genoma a nivell de cromosoma.
Plataforma:PacBio Seqüela II
Nanopore PromethION P48
Plataforma Illumina NovaSeq
-
Caixes d'eines
BMKCloud és una plataforma bioinformàtica líder que ofereix una solució única per a programes genòmics, en la qual els investigadors de diversos àmbits confien àmpliament, com ara la medicina, l'agricultura, el medi ambient, etc. BMKCloud es compromet a proporcionar serveis integrats, fiables i eficients, com ara plataformes i eines d'anàlisi bioinformàtica. , recursos informàtics, bases de dades públiques, cursos en línia bioinformàtics, etc. BMKCloud té diverses eines bioinformàtiques d'ús freqüent que inclouen anotació de gens, eines genètiques evolutives, ARNnc, control de qualitat de dades, muntatge, alineació, extracció de dades, mutacions, estadístiques, generador de figures, seqüència anàlisi, etc.
-
Genoma complet de bacteris
Biomarker Technologies ofereix un servei de seqüenciació per construir un genoma complet de bacteris amb zero gap.El flux de treball principal de la construcció completa del genoma dels bacteris inclou la seqüenciació de tercera generació, el muntatge, l'anotació funcional i l'anàlisi bioinformàtica avançada que compleixen objectius de recerca específics.Un perfil més complet del genoma dels bacteris permet revelar els mecanismes fonamentals subjacents als seus processos biològics, que també podrien proporcionar una referència valuosa per a investigacions genòmiques en espècies eucariotes superiors.
Plataforma:Nanopore PromethION P48 + Plataforma Illumina NovaSeq
PacBio Seqüela II
-
ARN petit
Els ARN petits són tipus d'ARN curt no codificant amb una longitud mitjana de 18-30 nt, incloent miRNA, siRNA i piRNA.S'ha informat massivament que aquests petits ARN estan implicats en diversos processos biològics com la degradació de l'ARNm, la inhibició de la traducció, la formació d'heterocromatina, etc. L'anàlisi de seqüenciació de petits ARN s'ha aplicat àmpliament en estudis sobre desenvolupament animal/planta, malalties, virus, etc. La plataforma d'anàlisi de seqüenciació consta d'anàlisi estàndard i mineria de dades avançada.A partir de les dades d'ARN-seq, l'anàlisi estàndard pot aconseguir la identificació i predicció de miRNA, predicció de gens objectiu de miRNA, anotació i anàlisi d'expressió.L'anàlisi avançada permet la cerca i l'extracció personalitzades de miRNA, la generació de diagrames de Venn, el miRNA i la creació de xarxes de gens objectiu.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS és una plataforma sencera d'anàlisi de reseqüenciació del genoma, que es desenvolupa a partir de la rica experiència en tecnologies de biomarcadors.Aquesta plataforma fàcil d'utilitzar permet l'enviament ràpid d'un flux de treball d'anàlisi integrat simplement establint uns quants paràmetres bàsics, que s'ajusten a les dades de seqüenciació d'ADN generades tant des de la plataforma Illumina com de la plataforma de seqüenciació BGI.Aquesta plataforma es desplega en un servidor informàtic d'alt rendiment, que permet una anàlisi de dades molt eficient en un temps molt limitat.La mineria de dades personalitzada està disponible a partir de l'anàlisi estàndard, inclosa la consulta de gens mutats, el disseny d'imprimació de PCR, etc.
-
ARNm (referència)
El transcriptoma és l'enllaç entre la informació genètica genòmica i el proteoma de la funció biològica.La regulació del nivell transcripcional és el mode de regulació més important i més àmpliament estudiat dels organismes.La seqüenciació del transcriptoma pot seqüenciar el transcriptoma en qualsevol moment o en qualsevol condició, amb una resolució precisa d'un únic nucleòtid. Pot reflectir dinàmicament el nivell de transcripció gènica, identificar i quantificar simultàniament transcripcions rares i normals i proporcionar la informació estructural de transcripcions específiques de mostra.
Actualment, la tecnologia de seqüenciació del transcriptoma s'ha utilitzat àmpliament en agronomia, medicina i altres camps d'investigació, com ara la regulació del desenvolupament animal i vegetal, l'adaptació ambiental, la interacció immune, la localització de gens, l'evolució genètica de les espècies i la detecció de tumors i malalties genètiques.
-
Metagenòmica (NGS)
Aquesta plataforma d'anàlisi està dissenyada per a l'anàlisi de dades metagenòmics d'escopeta a partir d'anys d'experiència.Consisteix en un flux de treball integrat que conté diverses anàlisis de metagenòmica que es necessiten habitualment, com ara el processament de dades, estudis a nivell d'espècie, estudis a nivell de funció gènica, agrupació de metagenomes, etc. , configuració de paràmetres, generació de figures personalitzades, etc.
-
LncRNA
Els ARN llargs no codificants (lncRNA) són un tipus de transcripcions amb una longitud superior a 200 nt, que no poden codificar proteïnes.L'evidència acumulada suggereix que la majoria dels lncRNA és molt probable que siguin funcionals.Les tecnologies de seqüenciació d'alt rendiment i les eines d'anàlisi bioinformàtica ens permeten revelar seqüències de lncRNA i informació de posicionament de manera més eficient i ens porten a descobrir lncRNAs amb funcions reguladores crucials.BMKCloud s'enorgulleix d'oferir als nostres clients una plataforma d'anàlisi de seqüenciació de lncRNA per aconseguir una anàlisi de lncRNA ràpida, fiable i flexible.
-
GWAS
L'estudi d'associació a tot el genoma (GWAS) té com a objectiu identificar variants genètiques (genotip) que s'associen a trets específics (fenotip).Els estudis de GWA investiguen marcadors genètics que creuen el genoma sencer d'un gran nombre d'individus i prediuen associacions genotip-fenotip mitjançant anàlisis estadístiques a nivell de població.La reseqüenciació del genoma sencer pot descobrir potencialment totes les variants genètiques.Juntament amb les dades fenotípiques, el GWAS es pot processar per identificar SNP, QTL i gens candidats relacionats amb el fenotip, que recolza fortament la millora moderna d'animals/plantes.SLAF és una estratègia de seqüenciació del genoma simplificada desenvolupada per si mateix, que descobreix marcadors distribuïts a tot el genoma, SNP.Aquests SNP, com a marcadors genètics moleculars, es poden processar per a estudis d'associació amb trets dirigits.És una estratègia rendible per identificar trets complexos associades a variacions genètiques.
-
Nanopore Transcriptòmica de llarga durada
Les isoformes alternatives complexes i variables en els organismes són mecanismes genètics importants per regular l'expressió gènica i la diversitat de proteïnes.La identificació precisa de les estructures de transcripció és la base per a l'estudi en profunditat dels patrons de regulació de l'expressió gènica.La plataforma de seqüenciació Nanopore ha portat amb èxit l'estudi transcriptòmic a nivell d'isoforme.Aquesta plataforma d'anàlisi està dissenyada per analitzar les dades d'ARN-Seq generades a la plataforma Nanopore a partir del genoma de referència, que aconsegueix anàlisis qualitatives i quantitatives tant a nivell de gens com a nivell de transcripcions.
-
ARN circ
L'ARN circular (circRNA) és un tipus d'ARN no codificant, que recentment s'ha trobat que juga un paper vital en xarxes reguladores implicades en el desenvolupament, la resistència ambiental, etc. els extrems del circRNA s'uneixen per formar una estructura circular, que els salva de la digestió de l'exonucleasa i són més estables que la majoria de l'ARN lineal.S'ha trobat que el CircRNA té diverses funcions en la regulació de l'expressió gènica.CircRNA pot actuar com a ceRNA, que s'uneix a miRNA de manera competitiva, coneguda com a esponja miRNA.La plataforma d'anàlisi de seqüenciació de CircRNA permet l'anàlisi de l'estructura i l'expressió del circRNA, la predicció d'objectius i l'anàlisi conjunta amb altres tipus de molècules d'ARN
