Destacats
En aquest seminari web de dues hores, és un gran honor haver convidat sis experts en genòmica de cultius.Els nostres ponents oferiran una interpretació en profunditat de dos estudis genòmics de Rye, que es van publicar recentment aGenètica de la natura:
1. El muntatge del genoma a escala cromosòmica proporciona informació sobre la biologia, l'evolució i el potencial agronòmic del sègol
2. Un conjunt de genoma d'alta qualitat destaca les característiques genòmiques del sègol i els gens importants agronòmicament
A més, ens complau comptar amb el científic sènior de R+D de Biomarker Technologies per compartir la seva experiència en l'assemblatge de genoma de novo.
Agenda
09:00 h CET
Observacions de benvinguda
Zheng Hong-kun
Fundador i CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
President de l'Escola de Ciències Agràries Avançades de la Universitat de Pequín
09:15h
Millora de la millora del sègol, el triticale i el blat mitjançant l'ús de seqüències del genoma de referència d'alta qualitat
En aquest seminari web, el Prof. Wang ens va donar una actualització general sobre l'estat actual de la investigació genòmica de triticeae i va demostrar l'èxit i els avenços dels dos treballs destacats sobre estudis del genoma del sègol, que es van publicar recentment a Nature Genetics i presenten tota la investigació. grups liderant i contribuint en les obres.
09:25 h
Genòmica de cereals @ IPK Gatesleben
Les gramínies de cereals de la tribu Triticeae han estat una font d'aliment important a les regions temperades, que durant molt de temps s'han considerat com un punt calent en la millora i la reproducció dels cultius.Entre totes les espècies cultivades, aquesta tribu és famosa per les seves característiques genòmiques extremadament complexes, com ara grans mides del genoma, alt contingut de TE, poliploïdia, etc. En aquesta sessió, el professor Nils Stein ens va fer una introducció general sobre IPK Gatesleben i l'estat actual del cereal. recerca genòmica@IPK Gatesleben.
09:35h
El muntatge del genoma a escala cromosòmica proporciona informació sobre la biologia, l'evolució i el potencial agronòmic del sègol
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Institut Leibniz de Genètica Vegetal i Recerca de Plans de Cultius (IPK)El sègol (Secale cereale L.) és un cultiu de cereals excepcionalment resistent al clima, utilitzat àmpliament per produir varietats de blat millorades mitjançant una hibridació introgressiva i que posseeix tot el repertori de gens necessaris per permetre la reproducció híbrida.El sègol és al·gàmic i només s'ha domesticat recentment, la qual cosa dóna als sègols conreats accés a una reserva genètica salvatge diversa i explotable.Per millorar encara més el potencial agronòmic del sègol, vam produir un conjunt anotat a escala cromosòmica del genoma del sègol de 7, 9 Mbp i vam validar àmpliament la seva qualitat mitjançant un conjunt de recursos genètics moleculars.Demostrem les aplicacions d'aquest recurs amb una àmplia gamma d'investigacions.Presentem troballes sobre l'aïllament genètic incomplet del sègol conreat de parents salvatges, mecanismes d'evolució estructural del genoma, resistència als patògens, tolerància a baixa temperatura, sistemes de control de fertilitat per a la cria híbrida i els beneficis de rendiment de les introgressions de blat de sègol.
10:05 h
Un conjunt de genoma d'alta qualitat destaca les característiques genòmiques del sègol i els gens importants agronòmicament
El sègol és un valuós cultiu d'aliments i farratge, un recurs genètic important per a la millora del blat i el triticale, i un material indispensable per a estudis de genòmica comparada eficient en herbes.Aquí, vam seqüenciar el genoma del sègol de Weining, una varietat de sègol xinesa d'elit.Els contigs muntats (7,74 Gb) representaven el 98,47% de la mida estimada del genoma (7,86 Gb), amb el 93,67% dels contigs (7,25 Gb) assignats a set cromosomes.Els elements repetitius constituïen el 90,31% del genoma muntat.En comparació amb els genomes de Triticeae seqüenciats anteriorment, els retrotransposons de Daniela, Sumaya i Sumana van mostrar una forta expansió al sègol.Anàlisis posteriors del conjunt de Weining aporten una nova llum sobre les duplicacions de gens a tot el genoma i el seu impacte en els gens de la biosíntesi del midó, les organitzacions físiques de loci complexos de prolamina, les característiques d'expressió gènica subjacents al tret d'encapçalament primerenc i les regions cromosòmiques associades a la domesticació i els loci del sègol.Aquesta seqüència del genoma promet accelerar els estudis de genòmica i millora de sègol i cultius de cereals relacionats.
10:35 h
Reptes, solucions i futur per a l'assemblatge de nou genoma
El genoma d'alta qualitat és la base de l'estudi genòmic.Tot i que el ràpid desenvolupament de la seqüenciació i l'algorisme ha permès un muntatge del genoma molt més senzill i eficient, els requisits de precisió i exhaustivitat del muntatge també augmenten amb l'aprofundiment dels objectius de recerca.En aquesta xerrada parlaré de les tecnologies populars actuals en l'assemblatge del genoma amb diversos casos d'èxit i donaré un cop d'ull al desenvolupament futur.
Hora de publicació: 08-gen-2022