BMKCloud Log in
条形banner-03

Notícies

Seqüenciació de transcriptoma de longitud completa basada en nanopors

La seqüenciació de nanopores es distingeix d'altres plataformes de seqüenciació, ja que els nucleòtids es llegeixen directament sense síntesi d'ADN i genera lectures llargues a desenes de quilobases.Això permet la lectura directa de transcripcions completes i abordar els reptes dels estudis transcriptòmics.

√ Baix biaix específic de la seqüència

√ Lectura completa de l'ADNc per a estudis d'estructura gènica

√ Menys dades necessàries per cobrir el mateix nombre de transcripcions

√ Identificació de múltiples isoformes per gen

√ Quantificació de l'expressió a nivell d'isoforma

nanopor-1

Gasoducte bioinformàtic típic

Llargada-trans-bix-1024x254

Últims casos d'èxit amb tecnologies de biomarcadors

1. Les anàlisis comparatives de transcriptomes de longitud completa revelen la dinàmica de desenvolupament de la tija de Gnetum luofuense

Revista: Fronteres en Genètica

Publicació: març de 2021

Paraules clau: MinION |Empalmament alternatiu |APA |lncRNA |Transcripcions expressades de manera diferenciada

Llegir el text complet

2. Moviment unidireccional de petits ARN de brots a arrels en heteroempelts interespecífiques

Revista: Nature Plants

Publicat: gener de 2021

Paraules clau: Nanopore |Il·lumina |detecció d'ARNm mòbil de longitud completa

3. L'anàlisi del transcriptoma de llarga durada de les arrels d'espàrrecs revela el mecanisme molecular de la tolerància a la sal induïda pels fongs micorrízics arbusculars.

Revista: Botànica Ambiental i Experimental

Publicat: gener de 2021

Paraules clau: MinION |Transcripcions expressades de manera diferenciada |Factors de transcripció |Empalmament alternatiu

4. Canvis de característiques fisiològiques i transcriptoma de longitud completa de les arrels i fulles de rosa (Rosa chinensis) en resposta a l'estrès per sequera

Revista: Plant and Cell Physiology

Publicat: Octubre de 2020

Paraules clau: PromethION |Transcripcions expressades de manera diferenciada |Predicció funcional |Isoformes empalmades |TF i lncRNA

5. Anàlisi i comparació integral de PacBio i seqüenciació d'ARN basada en nanopors del transcriptoma Arabidopsis

Revista: Plant Method

Publicat: abril de 2020

Paraules clau: GridION |PromethION |PacBio Seqüela |Illumina NovaSeq |Alineació del genoma |Identificació de la transcripció |Empalmament alternatiu |SSR |LncRNA |Quantificació isoforme

Notícies i més destacats té com a objectiu compartir els últims casos d'èxit amb Biomarker Technologies, capturant nous èxits científics així com tècniques destacades aplicades durant l'estudi.


Hora de publicació: 08-gen-2022

Envia'ns el teu missatge: