MICROBIA
La compatibilitat bacteriana i la immobilització amb biochar milloren la degradació del tebuconazol, la composició i el funcionament del microbioma del sòl
Seqüenciació d'amplicon 16S de longitud completa |PacBio HiFi |Diversitat alfa |Diversitat beta
En aquest estudi, Biomarker Technologies va proporcionar la seqüenciació d'amplicó 16S de longitud completa per PacBio i l'anàlisi bioinformàtica.
Destacats
Els bacteris degradants de tebuconazol immobilitzats amb biocarb Alcaligenes faecalis WZ-2 es van estudiar sobre l'eficiència de la biodegradació i els efectes sobre el sòl contaminat amb tebuconazol en comparació amb la soca de degradació lliure WZ-2.
1. El WZ-2 immobilitzat amb biochar va mostrar una degradació més eficient del tebuconazol en comparació amb el WZ-2 lliure en reduir la vida mitjana del tebuconazol al sòl de 18,7 dies a 13,3 dies.
2. El WZ-2 immobilitzat amb biochar va ser capaç de restaurar les activitats enzimàtiques microbianes natives del sòl, incloses la ureasa, la deshidrogenasa i la invertasa, etc.
3. El perfil microbià del sòl tractat amb WZ-2 immobilitzat amb biocarb determinat mitjançant una seqüenciació 16S de longitud completa va recolzar fermament que aquest sistema podria restaurar la salut del sòl millorant l'estructura de la comunitat bacteriana sota la contaminació per tebuconazol.
Experiència (relacionada amb la seqüenciació)
Agrupació: CK: Sòl natural;T: Sòl amb tebuconazol;S: Tebuconazol contenia sòl amb soca lliure WZ-2;BC: El tebuconazol contenia sòl amb biochar;BCS: Tebuconazol contenia sòl amb biocarb immobilitzat WZ-2.
Mostreig: Extracció total d'ADN del sòl amplificada per cebadors d'ADNr 16S
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) i 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),que representa l'ADNr 16S de longitud completa
Plataforma de seqüenciació: PacBio RS II
Estratègia de seqüenciació: lectura CCS HIFI
Anàlisi de dades:BMKCloudLes plataformes bioinformàtiques fan del peix daurat un excel·lent sistema de model genètic per a la fisiologia i l'evolució dels peixos.
Resultat
L'estructura de la comunitat microbiana del sòl es va determinar mitjançant la seqüenciació d'ADNr 16S.Es van avaluar l'índex de diversitat alfa i de riquesa OTU, inclosos els índexs Chao1, Ace, Shannon i Simpson per revelar la diversitat d'espècies a cada sistema.Després de 60 dies d'incubació, tots els índexs van mostrar una tendència similar, és a dir, el tebuconazol podria induir una reducció de la riquesa d'espècies i la diversitat del sòl.Tanmateix, afegint la soca WZ-2, la comunitat de bacteris del sòl es va recuperar parcialment tant pel que fa a la riquesa com a la diversitat.Es va observar una diferència limitada entre BC, BCS i CK, cosa que indica que el biochar i el WZ-2 immobilitzat amb biochar podrien restaurar eficaçment la salut biològica del sòl.
En aquest estudi es va aplicar el mètode de grups de parells no ponderats amb mitjanes aritmètiques (UPGMA) per mostrar la diversitat beta entre grups.Com es mostra a la figura següent, BC, BSC i CK compartien un patró de composició microbiana més similar en comparació amb el grup T i S, cosa que indicava a més que la introducció de biochar en la bioremediació del sòl contaminat amb tebuconazol podria facilitar en gran mesura la recuperació de la comunitat microbiana al sòl.
Figura.Agrupació UPGMA de comunitat bacteriana a nivell de fílum sota tractament diferent
Referència
Sun, Tong, et al."La compatibilitat bacteriana i la immobilització amb biochar van millorar la degradació del tebuconazol, la composició i el funcionament del microbioma del sòl".Revista de materials perillosos398 (2020): 122941.
Notícies i més destacats té com a objectiu compartir els últims casos d'èxit amb Biomarker Technologies, capturant nous èxits científics així com tècniques destacades aplicades durant l'estudi.
Hora de publicació: 08-gen-2022