● Regió de codificació de proteïnes dirigida: mitjançant la captura i seqüenciació de la regió de codificació de proteïnes, hWES s'utilitza per revelar variants relacionades amb l'estructura de la proteïna;
● Alta precisió: amb una gran profunditat de seqüenciació, hWES facilita la detecció de variants comunes i variants rares amb freqüències inferiors a l'1%;
● Rentable: hWES produeix aproximadament el 85% de les mutacions de malalties humanes a partir de l'1% del genoma humà;
● Cinc procediments estrictes de control de qualitat que cobreixen tot el procés amb Q30>85% garantit.
Plataforma
| Biblioteca
| Estratègia de captura d'exons
| Recomanar estratègia de seqüenciació
|
Plataforma Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Tipus de mostra
| Import(Qubit®)
| Volum
| Concentració
| Puresa (NanoDrop™) |
ADN genòmic
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1,8-2,0 sense degradació, sense contaminació
|
Per a trastorns mendelians/malalties rares: profunditat de seqüenciació efectiva per sobre de 50×
Per a mostres de tumor: profunditat de seqüenciació efectiva per sobre de 100 ×
1.Estadístiques d'alineació
Taula 1 Estadístiques del resultat del mapa
Taula 2 Estadístiques de captura d'exoma
2.Detecció de variacions
Figura 1 Estadístiques de SNV i InDel
3.Anàlisi avançada
Figura 2 Trama de Circos de SNV i InDel nocius a tot el genoma
Taula 3 Cribratge de gens causants de malalties