Productes

Genoma fúngic

Biomarker Technologies ofereix l'enquesta del genoma, el genoma fi i el genoma complet dels fongs depenent de l'objectiu específic de la investigació.La seqüenciació, el muntatge i l'anotació funcional del genoma es poden aconseguir combinant la seqüenciació de la propera generació + la seqüenciació de la tercera generació per aconseguir un muntatge del genoma d'alt nivell.També es pot utilitzar la tecnologia Hi-C per facilitar el muntatge del genoma a nivell de cromosoma.

Plataforma:PacBio Seqüela II

Nanopore PromethION P48

Plataforma Illumina NovaSeq

Contacta amb nosaltres

Detalls del servei

Resultats de demostració

Avantatges del servei

● Múltiples estratègies de seqüenciació disponibles per a diferents objectius de recerca

● Molta experiència en l'assemblatge de genoma de fongs amb més de 10.000 genomes complets de pene muntats.

● Equip de suport tècnic postvenda professional que compleix amb necessitats de recerca més específiques.

Especificacions del servei

Servei	Estratègia de seqüenciació	Qualitat garantida	Temps estimat d'execució
Mapa fi de fongs	Illumina 50X+Nanopore 100X	Contig N50≥2 Mb	35 dies laborables
Mapa fi de fongs	PacBio HiFi 30X	Contig N50≥2 Mb	35 dies laborables
Mapa complet del pene de fongs	Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Relació d'ancoratge del cromosoma > 90%	45 dies laborables

Anàlisis bioinformàtics

● Control de qualitat de les dades en brut

● Muntatge del genoma

● Anàlisi de components del genoma

● Anotació de la funció gènica

● Anàlisi genòmica comparada

Requisits de mostra i lliurament

Requisits de mostra:

PerExtractes d'ADN:

Tipus de mostra	Import	Concentració	Puresa
Extractes d'ADN	＞ 1,2 μg	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Per a mostres de teixit:

Tipus de mostra

Tractament de mostra recomanat

Emmagatzematge i enviament de mostres

Fong unicel·lular

Observa els llevats al microscopi i recull-los en fase exponencial

Transfereix el cultiu (que conté aprox. 3-4,5e9 cèl·lules) a un eppendorf d'1,5 o 2 ml.(Continua amb gel)

Centrifugar el tub durant 1 min a 14000 g per recollir bacteris i eliminar el sobrenedant amb cura.

Tanqueu el tub i congeleu els bacteris en nitrogen líquid durant almenys 1-3 h.Emmagatzemeu el tub a la nevera -80 ℃.

Congeleu les mostres en nitrogen líquid durant 3-4 hores i emmagatzemeu-les en nitrogen líquid o -80 graus per reservar a llarg termini.Cal enviar mostres amb gel sec.

Macro fong

Es recomana teixit en fase de creixement actiu.

Esbandiu el teixit amb aigua sense endotoxines, després 70% ethonal.

Deseu la mostra en criotubs.