BMKCloud Log in
条形banner-03

Productes

Seqüenciació d'ARNm eucariotes-Il·lumina

La seqüenciació d'ARNm permet el perfil de tots els ARNm transcrits de cèl·lules en condicions específiques.És una tecnologia potent per revelar el perfil d'expressió gènica, les estructures gèniques i els mecanismes moleculars de determinats processos biològics.Fins ara, la seqüenciació de l'ARNm s'ha utilitzat àmpliament en la investigació fonamental, el diagnòstic clínic, el desenvolupament de fàrmacs, etc.

Plataforma: Plataforma Illumina NovaSeq


Detalls del servei

Bioinformàtica

Resultats de demostració

Avantatges

● Molta experiència: s'han processat més de 200.000 mostres a BMK que cobreixen diversos tipus de mostres, com ara cultiu cel·lular, teixit, fluid corporal, etc. i més de 7.000 projectes d'ARNm-Seq tancats que cobreixen diverses àrees de recerca.

● Sistema de control de qualitat estricte: els punts bàsics de control de qualitat a través de tots els passos, com ara la preparació de mostres, la preparació de la biblioteca, la seqüenciació i la bioinformàtica, estan sota un estret seguiment per tal d'oferir resultats d'alta qualitat.

● Múltiples bases de dades disponibles per a l'anotació de funcions i estudis d'enriquiment per assolir diversos objectius de recerca.

● Serveis postvenda: serveis postvenda vàlids durant 3 mesos després de la finalització del projecte, inclòs el seguiment dels projectes, la resolució de problemes, les preguntes i respostes dels resultats, etc.

Requisits de mostra i lliurament

Biblioteca Estratègia de seqüenciació Dades recomanades Control de qualitat
Poly A enriquit Il·lumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Requisits de mostra:

Nucleòtids:

Conc. (ng/μl)

Quantitat (μg)

Puresa

Integritat

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Es mostra al gel una contaminació limitada o nul·la de proteïnes o ADN.

Per a plantes: RIN≥6,5;

Per a animals: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

elevació de referència limitada o nul·la

Teixit: pes (sec):≥1 g
* Per a teixits de menys de 5 mg, recomanem enviar una mostra de teixit congelada (en nitrogen líquid).

Suspensió cel·lular:Recompte de cel·les = 3×106- 1×107
* Recomanem enviar lisat cel·lular congelat.En cas que aquesta cel·la tingui un nombre inferior a 5×105.

Mostres de sang:Volum ≥1 ml

Microorganisme:Massa ≥ 1 g

Lliurament de mostres recomanat

Envàs: tub de centrífuga de 2 ml (no es recomana paper d'alumini)

Etiquetatge de la mostra: grup+rèplica, p. ex. A1, A2, A3;B1, B2, B3....

Enviament:

  1. Gel sec: les mostres s'han d'envasar en bosses i enterrar-les en gel sec.
  2. Tubs RNAstable: les mostres d'ARN es poden assecar al tub d'estabilització d'ARN (per exemple, RNAstable®) i enviar-se a temperatura ambient.

Flux de treball del servei

Mostra de control de qualitat

Disseny d'experiments

lliurament de mostres

Lliurament de la mostra

Experiment pilot

Extracció d'ARN

Preparació de la biblioteca

Construcció de la biblioteca

Seqüenciació

Seqüenciació

Anàlisi de dades

Anàlisi de dades

Serveis postvenda

Serveis postvenda


  • Anterior:
  • Pròxim:

  • Bioinformàtica

    wps_doc_10

    Eucariotes Flux de treball d'anàlisi de seqüenciació d'ARNm

    Bioinformàtica

    ØControl de qualitat de dades en brut

    ØAlineació del genoma de referència

    ØAnàlisi de l'estructura de la transcripció

    ØQuantificació de l'expressió

    ØAnàlisi de l'expressió diferencial

    ØAnotació i enriquiment de funcions

    1.Corba de saturació de dades d'ARNm

    3(1)

    2.Anàlisi de l'expressió diferencial-Gràfic del volcà

    4(1)

    3.Anotació KEGG en DEG

    5(1)

    4.Classificació GO en DEG

    6(1)

    obtenir un pressupost

    Escriu el teu missatge aquí i envia'ns-ho

    Envia'ns el teu missatge: