●Plataformes:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten i BGI-DNB-T7
●Modes de seqüenciació:PE50, PE100, PE150, PE250
●Control de qualitat de les biblioteques abans de la seqüenciació
●Entrega de dades de seqüenciació i control de qualitat:lliurament d'informes de control de qualitat i dades en brut en format fastq després de demultiplexar i filtrar les lectures Q30.
●Versatilitat dels serveis de seqüenciació:el client pot optar per seqüenciar per carril, cel·la de flux o quantitat de dades.
●Versatilitat de plataformes:Les biblioteques DNB es poden transferir a les plataformes Illumina
●Àmplia experiència a la plataforma de seqüenciació Illumina:amb milers de projectes tancats amb espècies diverses.
●Lliurament de l'informe de control de qualitat de seqüenciació:amb mètriques de qualitat, precisió de les dades i rendiment global del projecte de seqüenciació.
●Procés de seqüenciació madur:amb un temps de retorn curt.
●Control de qualitat rigorós: implementem requisits estrictes de control de qualitat per garantir el lliurament de resultats d'alta qualitat constant.
Import de dades (X) | Concentració (qPCR/nM) | Volum |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Plataforma | Concentració (qPCR/nM) | Volum |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
A més de la concentració i la quantitat total, també es requereix un patró de pics adequat.
Es proporciona un informe sobre la qualitat de la biblioteca abans de la seqüenciació, l'avaluació de la quantitat de la biblioteca i la fragmentació.
Taula 1. Estadístiques de dades de seqüenciació.
Identificació de la mostra | BMKID | Lectures crues | Dades en brut (pb) | Lectures netes (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribució de la qualitat al llarg de les lectures de cada mostra
Figura 2. Distribució del contingut base
Figura 3. Distribució dels continguts llegits en dades de seqüenciació