Mala RNK sekvenciranje-Illumina
Karakteristike
● Odabir veličine RNK prije pripreme biblioteke
● Bioinformatička analiza usredsređena na predviđanje miRNA i njihovih ciljeva
Prednosti usluge
●Sveobuhvatna bioinformatička analiza:omogućava identifikaciju poznatih i novih miRNA, identifikaciju meta miRNA i odgovarajuću funkcionalnu anotaciju i obogaćivanje sa više baza podataka (KEGG, GO)
●Rigorozna kontrola kvaliteta: implementiramo ključne kontrolne tačke u svim fazama, od pripreme uzoraka i biblioteke do sekvenciranja i bioinformatike.Ovaj pedantan nadzor osigurava isporuku konzistentno visokokvalitetnih rezultata.
●Podrška nakon prodaje: Naša posvećenost se proteže i dalje od završetka projekta uz period od 3 mjeseca nakon prodaje.Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i sesije pitanja i odgovora kako bismo odgovorili na sva pitanja u vezi s rezultatima.
●Extensive Expertise: sa evidencijom uspješnog zatvaranja višestrukih sRNA projekata koji pokrivaju preko 100 vrsta u različitim istraživačkim domenima, naš tim donosi bogato iskustvo u svaki projekat.
Zahtjevi za uzorke i dostava
| Biblioteka | Platforma | Preporučeni podaci | Podaci QC |
| Veličina odabrana | Illumina SE50 | 10M-20M očitavanja | Q30≥85% |
Uzorci zahtjeva:
nukleotidi:
| Konc. (ng/μl) | Količina (μg) | Čistoća | Integritet |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ograničena ili nikakva kontaminacija proteina ili DNK prikazana na gelu. | RIN≥6,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ograničeno ili nikakvo podizanje osnovne linije |
● Biljke:
Korijen, stabljika ili latica: 450 mg
List ili sjeme: 300 mg
Voće: 1,2 g
● Životinja:
Srce ili crijeva: 450 mg
Viscera ili mozak: 240 mg
Mišići: 600 mg
Kosti, kosa ili koža: 1,5 g
● Artropodi:
Insekti: 9g
Rakovi: 450 mg
● Puna krv: 2 cijevi
● Ćelije: 106 ćelije
● Serum i plazma:6 mL
Preporučena dostava uzorka
Kontejner:
2 ml epruveta za centrifugiranje (ne preporučuje se limena folija)
Označavanje uzorka: Grupa+replikacija npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
pošiljka:
1. Suhi led: Uzorci se moraju spakovati u vreće i zakopati u suvi led.
2. RNK stabilne epruvete: Uzorci RNK se mogu osušiti u RNA stabilizacijskoj epruveti (npr. RNAstable®) i poslati na sobnoj temperaturi.
Tok rada usluge
Dizajn eksperimenta
Isporuka uzorka
Ekstrakcija RNK
Izgradnja biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Bioinformatika
Identifikacija miRNA: struktura i dubina
Diferencijalna ekspresija miRNA – hijerarhijsko grupiranje
Funkcionalna oznaka cilja različito eksprimiranih miRNA
Istražite napredak u istraživanju koji omogućava BMKGene-ove usluge sekvenciranja sRNA kroz odabranu kolekciju publikacija.
Chen, H. et al.(2023) 'Virusne infekcije inhibiraju biosintezu i fotosintezu saponina u Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, str.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) 'Protein FREE1 koji sadrži domen FYVE biljke povezuje se s komponentama mikroprocesora radi suzbijanja biogeneze miRNA', izvještava EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'MikroRNA Ame-Bantam-3p kontrolira razvoj kukuljice larve ciljajući višestruke domene epidermalnog faktora rasta 8 gena (megf8) u medonosnoj pčeli, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), str. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Integrirana analiza MiRNA i gena povezanih s kvalitetom mesa otkriva da Gga-MiR-140-5p utječe na intramuskularno taloženje masti kod pilića', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), str. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
