BMKCloud Log in
条形banner-03

Proizvodi

Sekvenciranje RNK sa jednim jezgrom

Napredak u hvatanju jedne ćelije i tehnici izgradnje individualne biblioteke u kombinaciji sa sekvenciranjem visoke propusnosti omogućava studije genske ekspresije na bazi ćelije po ćeliju.Omogućava dublju i potpuniju sistemsku analizu složenih ćelijskih populacija, u kojoj se u velikoj mjeri izbjegava maskiranje njihove heterogenosti uzimanjem prosjeka svih ćelija.

Međutim, neke ćelije nisu prikladne za pretvaranje u jednoćelijsku suspenziju, pa su potrebne druge metode pripreme uzoraka – ekstrakcija jezgra iz tkiva, odnosno, jezgro se direktno ekstrahuje iz tkiva ili ćelije i priprema u jednonukleusnu suspenziju za jednostruke ćelije. sekvenciranje ćelija.

BMK pruža 10× Genomics ChromiumTM uslugu sekvenciranja jednoćelijske RNK.Ova usluga je široko korištena u studijama vezanim za bolesti, kao što su diferencijacija imunoloških stanica, heterogenost tumora, razvoj tkiva itd.

Čip prostornog transkriptoma: 10× Genomika

Platforma: Illumina NovaSeq platforma


Detalji usluge

Bioinformatika

Demo Results

Tehnički princip

Izolacija jezgara se postiže pomoću 10× Genomics ChromiumTM, koji se sastoji od osmokanalnog mikrofluidnog sistema sa dvostrukim ukrštanjima.U ovom sistemu, perle gela sa bar kodovima i prajmerom, enzimi i jedno jezgro su inkapsulirani u kapi ulja veličine nanolitara, stvarajući gel perle u emulziji (GEM).Kada se formira GEM, u svakom GEM-u se vrši liza ćelija i oslobađanje bar kodova.mRNA se reverzno transkribuju u molekule cDNK sa 10× bar kodovima i UMI, koji su dalje podložni konstrukciji standardne biblioteke sekvenciranja.

wps_doc_0
wps_doc_1

Tkivo nije pogodno za pripremu jednoćelijske suspenzije

Ćelija / tkivo

Razlog

Nesvježe smrznuto tkivo

Nije moguće dobiti svježe ili dugo sačuvane organizacije

Mišićne ćelije, megakariociti, masnoće…

Prečnik ćelije je prevelik za ulazak u instrument

Jetra…

Previše krhak da bi se slomio, nesposoban da razlikuje pojedinačne ćelije

Neuronska ćelija, mozak…

Osetljiviji, lakši za stres, promeniće rezultate sekvenciranja

Gušterača, štitna žlijezda…

Bogat endogenim enzimima koji utiču na proizvodnju jednoćelijske suspenzije

Jedno jezgro protiv jedne ćelije

Jedno jezgro

Jednoćelijska

Neograničen prečnik ćelije

Prečnik ćelije: 10-40 μm

Materijal može biti zamrznuto tkivo

Materijal mora biti svježa maramica

Nizak stres zamrznutih ćelija

Tretman enzimima može izazvati reakciju na stres ćelije

Ne moraju se uklanjati crvena krvna zrnca

Crvena krvna zrnca se moraju ukloniti

Nuklearna ekspresija bioinformacija

Cijela ćelija izražava bioinformaciju

Specifikacije usluge

Biblioteka

Strategija sekvenciranja

Obim podataka

Zahtjevi za uzorke

Tkivo

10× Genomics single-nuclei biblioteka

10x Genomics -Illumina PE150

100.000 čitanja po ćeliji pribl.100-200 Gb

Broj ćelije: >2× 105

Cell conc.na 700-1200 ćelija/μL

≥ 200 mg

Za više detalja o smjernicama za pripremu uzoraka i toku rada usluge, slobodno razgovarajte sa a

Tok rada usluge

Uzorak QC

Dizajn eksperimenta

dostava uzorka

Isporuka uzorka

nuklearna.ovjesa

Izolacija jezgara

Library Preparation

Izgradnja biblioteke

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

Usluge nakon prodaje

Usluge nakon prodaje


  • Prethodno:
  • Sljedeći:

  • wps_doc_9

    1. Spot klastering

    wps_doc_10

    2. Toplotna mapa obilja izraza markera

    wps_doc_113. Distribucija gena proizvođača u različitim klasterima

    wps_doc_12

    4. Analiza putanje ćelije/pseudovreme

    wps_doc_13

     

     

    dobiti citat

    Napišite svoju poruku ovdje i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: