-
Sekvenciranje RNK sa jednim jezgrom
Napredak u hvatanju jedne ćelije i tehnici izgradnje individualne biblioteke u kombinaciji sa sekvenciranjem visoke propusnosti omogućava studije genske ekspresije na bazi ćelije po ćeliju.Omogućava dublju i potpuniju sistemsku analizu složenih ćelijskih populacija, u kojoj se u velikoj mjeri izbjegava maskiranje njihove heterogenosti uzimanjem prosjeka svih ćelija.
Međutim, neke ćelije nisu prikladne za pretvaranje u jednoćelijsku suspenziju, pa su potrebne druge metode pripreme uzoraka – ekstrakcija jezgra iz tkiva, odnosno, jezgro se direktno ekstrahuje iz tkiva ili ćelije i priprema u jednonukleusnu suspenziju za jednostruke ćelije. sekvenciranje ćelija.
BMK pruža 10× Genomics ChromiumTM uslugu sekvenciranja jednoćelijske RNK.Ova usluga je široko korištena u studijama vezanim za bolesti, kao što su diferencijacija imunoloških stanica, heterogenost tumora, razvoj tkiva itd.
Čip prostornog transkriptoma: 10× Genomika
Platforma: Illumina NovaSeq platforma
-
BMKMANU S1000 prostorni transkript
Prostorna transkriptomika stoji na čelu naučne inovacije, osnažujući istraživače da uđu u zamršene obrasce ekspresije gena unutar tkiva, istovremeno čuvajući njihov prostorni kontekst.Usred različitih platformi, BMKGene je razvio BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, koji se može pohvalitipoboljšana rezolucijaod 5µM, dostižući subćelijski opseg i omogućavajupostavke rezolucije na više nivoa.Čip S1000, koji ima približno 2 miliona tačaka, koristi mikro-jažice obložene kuglicama napunjenim prostorno barkodiranim sondama za hvatanje.Biblioteka cDNK, obogaćena prostornim bar kodovima, pripremljena je od S1000 čipa i potom sekvencirana na Illumina NovaSeq platformi.Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava tačnost i specifičnost generiranih podataka.Jedinstveni atribut BMKManu S1000 čipa leži u njegovoj svestranosti, nudeći postavke rezolucije na više nivoa koje se mogu fino podesiti prema različitim tkivima i nivoima detalja.Ova prilagodljivost pozicionira čip kao izvanredan izbor za različite studije prostorne transkriptomije, osiguravajući precizno prostorno grupiranje uz minimalan šum.
Koristeći BMKManu S1000 čip i druge tehnologije prostorne transkriptomike, istraživači mogu steći bolje razumijevanje prostorne organizacije ćelija i složenih molekularnih interakcija koje se javljaju unutar tkiva, pružajući neprocjenjiv uvid u mehanizme koji leže u osnovi bioloških procesa u širokom spektru polja, uključujući onkologiju, neuronauku, razvojnu biologiju, imunologiju i botaničke studije.
Platforma: BMKManu S1000 čip i Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium prostorni transkriptom
Prostorna transkriptomika je najsavremenija tehnologija koja omogućava istraživačima da istražuju obrasce ekspresije gena unutar tkiva uz očuvanje njihovog prostornog konteksta.Jedna moćna platforma u ovoj domeni je 10x Genomics Visium u kombinaciji sa Illumina sekvenciranjem.Princip 10X Visiuma leži na specijalizovanom čipu sa određenim područjem za hvatanje gde se postavljaju delovi tkiva.Ovo područje hvatanja sadrži mrlje sa crtičnim kodom, od kojih svaka odgovara jedinstvenoj prostornoj lokaciji unutar tkiva.Uhvaćeni RNA molekuli iz tkiva se zatim označavaju jedinstvenim molekularnim identifikatorima (UMI) tokom procesa reverzne transkripcije.Ove barkodirane tačke i UMI omogućavaju precizno prostorno mapiranje i kvantifikaciju ekspresije gena u rezoluciji jedne ćelije.Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava tačnost i specifičnost generiranih podataka.Koristeći ovu tehnologiju prostorne transkriptomike, istraživači mogu steći dublje razumijevanje prostorne organizacije ćelija i složenih molekularnih interakcija koje se javljaju unutar tkiva, nudeći neprocjenjiv uvid u mehanizme koji leže u osnovi bioloških procesa u više polja, uključujući onkologiju, neuronauku, razvojnu biologiju, imunologiju. i botaničke studije.
Platforma: 10X Genomics Visium i Illumina NovaSeq
