Dok sekvenciranje mRNA zasnovano na NGS-u služi kao svestran alat za kvantifikaciju ekspresije gena, njegovo oslanjanje na kratko čitanje ograničava njegovu efikasnost u složenim transkriptomskim analizama.PacBio sekvenciranje (Iso-Seq), s druge strane, koristi tehnologiju dugog čitanja, omogućavajući sekvenciranje mRNA transkripata pune dužine.Ovaj pristup olakšava sveobuhvatno istraživanje alternativnog spajanja, fuzije gena i poliadenilacije iako nije primarni izbor za kvantifikaciju genske ekspresije.Kombinacija 2+3 premošćuje jaz između Illumina i PacBio oslanjajući se na PacBio HiFi čitanja za identifikaciju kompletnog skupa izoforma transkripta i NGS sekvenciranja za kvantifikaciju istih izoforma.
Platforme: PacBio Sequel II i Illumina NovaSeq