Highlights
U ovom dvosatnom webinaru, velika nam je čast što smo pozvali šest stručnjaka iz oblasti genomike useva.Naši govornici će dati detaljnu interpretaciju dvije studije o genomu raži, koje su nedavno objavljene naNature Genetics:
1. Sklapanje genoma na skali hromozoma pruža uvid u biologiju raži, evoluciju i agronomski potencijal
2. Visokokvalitetni sklop genoma naglašava karakteristike genoma raži i agronomski važne gene
Takođe, drago nam je što imamo višeg istraživača i razvojnog naučnika Biomarker Technologies da podijeli svoje iskustvo u de novo sklapanju genoma.
Dnevni red
09:00 po srednjeevropskom vremenu
Pozdravne napomene
Zheng Hong-kun
Osnivač i izvršni direktor Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Predsednik Škole za napredne poljoprivredne nauke Univerziteta u Pekingu
09:15 ujutro
Poboljšanje poboljšanja raži, tritikalea i pšenice korištenjem visokokvalitetne referentne sekvence genoma
Na ovom webinaru, prof. Wang nam je dao sveobuhvatna ažuriranja o trenutnom statusu istraživanja genoma triticeae i pokazao uspjeh i napredak dva izvanredna rada na studijama genoma raži, koja su nedavno objavljena na Nature Genetics i predstavljaju cijelo istraživanje grupe koje vode i doprinose radovima.
09:25 ujutro
Genomika žitarica @ IPK Gatersleben
Žitarice iz plemena Triticeae bile su glavni izvor hrane u umjerenim regijama, koje se dugo smatralo žarištem u poboljšanju usjeva i uzgoju.Među svim kultivisanim vrstama, ovo pleme je poznato po svojim izuzetno složenim genomskim karakteristikama uključujući velike veličine genoma, visok sadržaj TE, poliploidiju, itd. U ovoj sesiji, prof. Nils Stein nam je dao opšti uvod o IPK Gatersleben i trenutnom statusu žitarica genomic research@IPK Gatersleben.
09:35 ujutro
Sklapanje genoma na skali hromozoma pruža uvid u biologiju, evoluciju i agronomski potencijal raži
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz institut za biljnu genetiku i istraživanje plana usjeva (IPK)Raž (Secale cereale L.) je žitarica koja je izuzetno otporna na klimu, koja se intenzivno koristi za proizvodnju poboljšanih sorti pšenice putem introgresivne hibridizacije, i posjeduje cijeli repertoar gena neophodnih za omogućavanje hibridnog oplemenjivanja.Raž je alogamna i tek nedavno pripitomljena, što kultivisanoj raži daje pristup raznolikom i iskoristivom divljem genskom fondu.Kako bismo dodatno poboljšali agronomski potencijal raži, proizveli smo skup hromozomskih oznaka 7,9 Mbp genoma raži i opsežno potvrdili njegov kvalitet koristeći skup molekularno genetskih resursa.Mi demonstriramo primjenu ovog resursa širokim spektrom istraživanja.Predstavljamo nalaze o nepotpunoj genetskoj izolaciji kultivisane raži od divljih srodnika, mehanizmima strukturne evolucije genoma, otpornosti na patogene, toleranciji na niske temperature, sistemima kontrole plodnosti u hibridnom oplemenjivanju i prednostima prinosa od introgresije raži i pšenice.
10:05 ujutro
Visokokvalitetni sklop genoma naglašava karakteristike genoma raži i agronomski važne gene
Raž je vrijedna prehrambena i krmna kultura, važan genetski resurs za poboljšanje pšenice i tritikalea i nezamjenjiv materijal za efikasne komparativne genomičke studije trava.Ovdje smo sekvencirali genom Weining raži, elitne kineske sorte raži.Sakupljeni kontigi (7,74 Gb) činili su 98,47% procijenjene veličine genoma (7,86 Gb), sa 93,67% kontiga (7,25 Gb) dodijeljenih sedam hromozoma.Ponavljajući elementi su činili 90,31% sastavljenog genoma.U poređenju sa prethodno sekvenciranim genomima Triticeae, retrotranspozoni Daniela, Sumaya i Sumana pokazali su snažnu ekspanziju u raži.Dalje analize Weiningovog sklopa bacaju novo svjetlo na duplikacije gena u cijelom genomu i njihov utjecaj na gene biosinteze skroba, fizičku organizaciju složenih lokusa prolamina, karakteristike ekspresije gena koje su u osnovi rane osobine glave, i navodne hromozomske regije i lokuse u raži povezane sa pripitomljavanjem.Ova sekvenca genoma obećava da će ubrzati genomiku i studije oplemenjivanja raži i srodnih žitarica.
10:35 ujutro
Izazovi, rješenja i budućnost za sklapanje genoma de novo
Genom visokog kvaliteta je osnova genomske studije.Iako je brzi razvoj sekvenciranja i algoritma omogućio mnogo jednostavnije i efikasnije sastavljanje genoma, zahtjevi u pogledu tačnosti i potpunosti sklapanja također rastu sa produbljivanjem istraživačkih ciljeva.U ovom govoru ću razgovarati o trenutnim popularnim tehnologijama u sklapanju genoma s nekoliko uspješnih slučajeva i baciti uvid u budući razvoj.
Vrijeme objave: Jan-08-2022