BMKCloud Log in
条形banner-03

Vijesti

Sekvenciranje transkriptoma pune dužine zasnovano na nanoporama

Sekvenciranje nanopora razlikuje se od drugih platformi za sekvenciranje po tome što se nukleotidi čitaju direktno bez sinteze DNK i generiše duga očitavanja na desetinama kilobaza.Ovo omogućava direktno čitanje transkripta u punoj dužini i rješavanje izazova u transkriptomskim studijama.

√ Niska pristranost specifična za sekvencu

√ Čitanje cDNK pune dužine za studije strukture gena

√ Potrebno je manje podataka za pokrivanje istog broja transkripata

√ Identifikacija više izoforma po genu

√ Kvantifikacija ekspresije na nivou izoforme

nanopore-1

Tipični bioinformatički cjevovod

Trans-bix u punoj dužini-1024x254

Najnoviji uspješni slučajevi s Biomarker tehnologijama

1. Komparativna analiza transkriptoma pune dužine otkriva dinamiku razvoja stabljike Gnetum luofuense

Časopis: Frontiers in Genetics

Objavljeno: mart 2021

Ključne riječi: MinION |Alternativno spajanje |APA |lncRNA |Diferencijalno izraženi transkripti

Pročitajte cijeli tekst

2. Jednosmjerno kretanje malih RNK ​​od izdanaka do korijena u interspecifičnim heterograftama

Časopis: Priroda Biljke

Objavljeno: januar 2021

Ključne riječi: Nanopore |Illumina |detekcija mobilne mRNA pune dužine

3. Celokupna transkriptomska analiza korijena šparoga otkriva molekularni mehanizam tolerancije soli izazvan arbuskularnim mikoriznim gljivama

Časopis: Ekološka i eksperimentalna botanika

Objavljeno: januar 2021

Ključne riječi: MinION |Diferencijalno izraženi transkripti |Transkripcijski faktori |Alternativno spajanje

4. Promjene fizioloških karakteristika i cijeli transkriptom korijena i listova ruže (Rosa chinensis) kao odgovor na stres od suše

Časopis: Fiziologija biljaka i ćelija

Objavljeno: oktobar 2020

Ključne riječi: PromethION |Diferencijalno izraženi transkripti |Funkcionalno predviđanje |Spojene izoforme |TF i lncRNA

5. Analiza i sveobuhvatno poređenje PacBio i sekvenciranja RNA na bazi nanopora transkriptoma Arabidopsis

Časopis: Plant Method

Objavljeno: april 2020

Ključne riječi: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Poravnanje genoma |Identifikacija transkripta |Alternativno spajanje |SSR |LncRNA |Kvantifikacija izoforme

Vijesti i istaknuti detalji ima za cilj dijeljenje najnovijih uspješnih slučajeva sa Biomarker Technologies, bilježi nova naučna dostignuća, kao i istaknute tehnike primijenjene tokom studije.


Vrijeme objave: Jan-08-2022

Pošaljite nam svoju poruku: