MICROBIAL
Kompatibilnost bakterija i imobilizacija s biougljem poboljšala je razgradnju tebukonazola, sastav i funkcioniranje mikrobioma tla
Sekvenciranje 16S amplikona pune dužine |PacBio HiFi |Alfa raznolikost |Beta raznolikost
U ovoj studiji, sekvencioniranje 16S amplikona pune dužine od strane PacBio i bioinformatičke analize su obezbijeđene od strane Biomarker Technologies.
Highlights
Biougljevljene bakterije koje razgrađuju tebukonazol Alcaligenes faecalis WZ-2 proučavane su na efikasnost biorazgradnje i uticaj na tlo kontaminirano tebukonazolom u poređenju sa slobodnim degradirajućim sojem WZ-2.
1. WZ-2 imobiliziran biougljem pokazao je efikasniju degradaciju tebukonazola u poređenju sa slobodnim WZ-2 smanjenjem poluživota tebukonazola u tlu sa 18,7 dana na 13,3 dana.
2. WZ-2 imobiliziran biougljem uspio je obnoviti aktivnosti mikrobnih enzima u tlu, uključujući ureazu, dehidrogenazu i invertazu, itd.
3. Mikrobni profil u tlu tretiranom biougljem imobiliziranom WZ-2 određen sekvenciranjem pune dužine 16S snažno podržava da ovaj sistem može obnoviti zdravlje tla poboljšanjem strukture bakterijske zajednice pod kontaminacijom tebukonazolom.
Eksperiment (vezano za sekvenciranje)
Grupisanje: CK: Prirodno tlo;T: Tlo napunjeno tebukonazolom;S: Zemljište koje sadrži tebukonazol sa slobodnim sojem WZ-2;BC: Tebukonazol je sadržavao tlo sa biougljem;BCS: Tebukonazol je sadržavao tlo sa biougljenim imobiliziranim WZ-2.
Uzorkovanje: Ukupna ekstrakcija DNK tla pojačana 16S rDNA prajmerima
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) i 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),predstavlja 16S rDNK pune dužine
Platforma za sekvenciranje: PacBio RS II
Strategija sekvenciranja: CCS HIFI čita
Analiza podataka:BMKCloudBioinformatička platforma čini zlatnu ribicu odličnim genetskim modelom za fiziologiju i evoluciju riba.
Rezultat
Struktura mikrobne zajednice tla određena je sekvenciranjem 16S rDNA.OTU bogatstvo i indeks alfa raznolikosti, uključujući Chao1, Ace, Shannon i Simpson indekse su evaluirani kako bi se otkrila raznolikost vrsta u svakom sistemu.Nakon 60 dana inkubacije, svi indeksi su pokazali sličan trend, odnosno tebukonazol bi mogao izazvati smanjenje bogatstva vrsta i raznolikosti u tlu.Međutim, dodavanjem soja WZ-2, zajednica bakterija u tlu je djelomično oporavljena u smislu bogatstva i raznolikosti.Uočena je ograničena razlika između BC, BCS i CK, što ukazuje na to da biougljevlje i WZ-2 imobilizirani biougljem mogu efikasno obnoviti biološko zdravlje tla.
Metoda neponderisane grupe u paru sa aritmetičkim sredinama (UPGMA) je primenjena u ovoj studiji kako bi se pokazala beta raznolikost među grupama.Kao što je prikazano na sljedećoj slici, BC, BSC i CK dijele sličniji obrazac mikrobnog sastava u poređenju sa grupom T i S, što dalje ukazuje da bi uvođenje biouglja u bioremedijaciju tla kontaminiranog tebukonazolom moglo u velikoj mjeri olakšati oporavak mikrobne zajednice u tlu.
Slika.UPGMA grupisanje bakterijske zajednice na nivou tipa pod različitim tretmanom
Referenca
Sun, Tong, et al.“Bakterijska kompatibilnost i imobilizacija s biougljem poboljšali su razgradnju tebukonazola, sastav i funkcioniranje mikrobioma tla.”Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Vijesti i istaknuti detalji ima za cilj dijeljenje najnovijih uspješnih slučajeva sa Biomarker Technologies, bilježi nova naučna dostignuća, kao i istaknute tehnike primijenjene tokom studije.
Vrijeme objave: Jan-08-2022