-
Proteomika
Proteomika uključuje primjenu tehnologija za kvantificiranje ukupnog sadržaja proteina u ćeliji, tkivu ili organizmu.Tehnologije zasnovane na proteomici koriste se u različitim kapacitetima za različite istraživačke postavke kao što su otkrivanje različitih dijagnostičkih markera, kandidata za proizvodnju vakcine, razumijevanje mehanizama patogenosti, promjena obrazaca ekspresije kao odgovor na različite signale i interpretacija funkcionalnih puteva proteina u različitim bolestima.Trenutno su kvantitativne proteomičke tehnologije uglavnom podijeljene na TMT, Label Free i DIA kvantitativne strategije.
-
Metabolomics
Metabolom je krajnji nizvodni proizvod genoma i sastoji se od ukupnog komplementa svih niskomolekularnih molekula (metabolita) u ćeliji, tkivu ili organizmu.Metabolomika ima za cilj mjerenje široke širine malih molekula u kontekstu fizioloških podražaja ili bolesnih stanja.Metabolomske metodologije spadaju u dvije različite grupe: neciljana metabolomika, namijenjena sveobuhvatna analiza svih mjerljivih analita u uzorku uključujući hemijske nepoznate pomoću GC-MS/LC-MS, i ciljana metabolomika, mjerenje definiranih grupa kemijski okarakteriziranih i biohemijski označeni metaboliti.
-
Bulked Segregant analiza
Grupna segregantna analiza (BSA) je tehnika koja se koristi za brzu identifikaciju genetskih markera povezanih s fenotipom.Glavni tok rada BSA sadrži odabir dvije grupe pojedinaca s ekstremno suprotnim fenotipovima, udruživanje DNK svih pojedinaca kako bi se formirala dva dijela DNK, identificiranje diferencijalnih sekvenci između dva skupa.Ova tehnika se intenzivno koristi u identifikaciji genetskih markera koji su snažno povezani ciljanim genima u genomima biljaka/životinja.
-
DNK/RNA sekvenciranje – Nanopore sekvencer
ONT sekvenciranje je tehnologija sekvenciranja jednog molekula u realnom vremenu električnog signala zasnovana na nanoporama, princip sekvenciranja svake platforme je isti.Dvolančana DNK/RNA će se vezati za nanoporozni protein ugrađen u biofilm i odmotati se pod vodstvom motornog proteina, pod djelovanjem razlike napona s obje strane biofilma, DNK/RNA lanci prolaze kroz protein nanopornog kanala na određenom stopa.Zbog razlika u hemijskim svojstvima različitih baza na DNK/RNA lancu, kada jedna baza ili molekul DNK prođe kroz kanal nanopora, to će uzrokovati promjenu različitih električnih signala.Otkrivanjem ovih signala i odgovarajućim njima, mogu se izračunati odgovarajući bazni tipovi i može se završiti detekcija sekvence u realnom vremenu.
-
DNK/RNA sekvenciranje -PacBio Sequencer
PacBio platforma za sekvenciranje je platforma za sekvencioniranje dugog čitanja, koja je također poznata kao jedna od tehnologija sekvenciranja treće generacije (TGS).Osnovna tehnologija, jednomolekularna u realnom vremenu (SMRT), omogućava generisanje čitanja sa desetinama kilograma dužine.Na osnovu „Sekvenciranja po sintezi“, rezolucija jednog nukleotida se postiže pomoću nultog moda talasovoda (ZMW), gdje je osvijetljen samo ograničen volumen na dnu (mjestu sinteze molekula).Osim toga, SMRT sekvenciranje u velikoj mjeri izbjegava pristrasnost specifičnu za sekvencu u NGS sistemu, jer većina koraka PCR amplifikacije nije potrebna u procesu izgradnje biblioteke.
Platforma: Sequel II, Revio
