Gljivični genom
Prednosti usluge
● Dostupne su višestruke strategije sekvenciranja za različite ciljeve istraživanja
● Visoko iskustvo u sastavljanju genoma gljiva sa preko 10.000 sastavljenih genoma sa penom.
● Profesionalni tim za tehničku podršku nakon prodaje koji ispunjava specifičnije potrebe istraživanja.
Specifikacije usluge
| Servis | Strategija sekvenciranja | Kvalitet zagarantovan | Procijenjeno vrijeme obrade |
| Fina karta gljivica | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 radnih dana |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Gljivična pene-kompletna karta | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Odnos sidrenja hromozoma >90% | 45 radnih dana |
Bioinformatičke analize
● Kontrola kvaliteta sirovih podataka
● Sklop genoma
● Analiza komponenti genoma
● Oznaka funkcije gena
● Komparativna genomska analiza
Zahtjevi za uzorke i dostava
Uzorci zahtjeva:
ZaDNK ekstrakti:
| Tip uzorka | Iznos | Koncentracija | Čistoća |
| DNK ekstrakti | ＞ 1,2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Za uzorke tkiva:
| Tip uzorka | Preporučeni tretman uzorka | Čuvanje i otprema uzoraka |
| Jednoćelijska gljiva | Posmatrajte kvasac pod mikroskopom i sakupite ih u eksponencijalnoj fazi Prenesite kulturu (koja sadrži približno 3-4,5e9 ćelija) u ependdorf od 1,5 ili 2 ml.(Zadrži na ledu) Centrifugirajte epruvetu 1 min na 14000 g da prikupite bakterije i pažljivo uklonite supernatant Zatvorite epruvetu i zamrznite bakterije u tečnom dušiku najmanje 1-3 h.Čuvajte tubu u frižideru na -80 ℃. | Zamrznite uzorke u tečnom azotu na 3-4 sata i čuvajte u tečnom azotu ili -80 stepeni na dugotrajnu rezervaciju.Potrebna je otprema uzorka sa suhim ledom. |
| Makro gljiva | Preporučuje se tkivo u fazi aktivnog rasta. Isperite tkivo vodom bez endotoksina, a zatim 70% ethonalom. Sačuvajte uzorak u krio-epruvetama. |
Tok rada usluge
Isporuka uzorka
Izgradnja biblioteke
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
1.Circos dijagram na genomskim komponentama gljivica
2.Komparativna genomička analiza: Filogenetsko stablo
