BMKGENE je pružio usluge sekvenciranja prostornih transkriptoma za studiju „STEEL omogućava razgraničenje prostorno-vremenskih transkriptomskih podataka visoke rezolucije“, koja je objavljena u Briefings in Bioinformatics.
Ova studija je predložila nenadgledani i višestruki algoritam zasnovan na učenju, grupisanje tipE ćelija prostornog transkriptoma (STEEL), koji identifikuje domene iz prostornog transkriptoma grupisanjem perlica koje pokazuju i veoma slične profile ekspresije gena i blisku prostornu udaljenost na način na grafikonima.
Sveobuhvatna procena STEEL-a na skupovima prostornih transkriptomskih podataka sa platforme 10X Visium pokazuje da ne samo da postiže visoku rezoluciju za karakterizaciju finih struktura mozga miša, već takođe omogućava integraciju više slajdova tkiva pojedinačno analiziranih u veći.
Sa napretkom tehnologija prostornih transkriptoma, naša metoda će imati veliku primjenjivost u identifikaciji domena i rekonstrukciji atlasa ekspresije gena.
Klikniteovdjeda saznate više o ovoj studiji.
Vrijeme objave: 20.10.2023