Jedna važna hortikulturna karakteristika koja razlikuje pupčane narandže od ostalih uobičajenih slatkih sorti narandže je prisustvo pupka na plodu.Ova karakteristika je također važan kriterij za klasifikaciju hortikulturnih sorti slatke naranče.
BMKGENE-ovi klijenti su koristili BMKGENE-ovu samorazvijenu SLAF tehnologiju sekvenciranja kako bi sproveli studiju pod nazivom “Geni za rudarenje povezani s kvalitetom voća u slatkim narančama na osnovu sekvenciranja specifičnih lokusnih pojačanih fragmenata.“
Studija je uključivala sekvencioniranje 240 izvora germplazme slatke narandže sa velikom genetskom raznolikošću i različitim geografskim porijeklom, što je rezultiralo sa 497,82 Mb kratko čitanih podataka.Analiza podataka je dala 1.467.968 SNP genotipova u cijelom genomu.Korištenjem Fst analize, studija je identificirala 6 gena kandidata koji se odnose na prisustvo pupka, masu ploda i titrabilnu kiselost, pružajući osnovu za ciljano poboljšanje sorti slatke narandže.
Za populacijsko sekvencioniranje velikih razmjera, sekvencioniranje fragmenata sa pojačanim lokusom (SLAF) je isplativije i efikasnije u poređenju sa sekvenciranjem cijelog genoma (WGS).
Klikniteovdjeda saznate više o ovoj studiji.
Vrijeme objave: 05.12.2023