BMKCloud Log in
条形 ব্যানার-03

পণ্য

স্পেসিফিক-লোকাস এমপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট সিকোয়েন্সিং (SLAF-Seq)

উচ্চ-থ্রুপুট জিনোটাইপিং, বিশেষ করে বড় আকারের জনসংখ্যার ক্ষেত্রে, জেনেটিক অ্যাসোসিয়েশন অধ্যয়নের একটি মৌলিক পদক্ষেপ, যা কার্যকরী জিন আবিষ্কার, বিবর্তনীয় বিশ্লেষণ ইত্যাদির জন্য জেনেটিক ভিত্তি প্রদান করে। গভীর সমগ্র জিনোম পুনঃক্রমের পরিবর্তে, কম প্রতিনিধিত্ব জিনোম সিকোয়েন্সিং (RGS)। জেনেটিক মার্কার আবিষ্কারে যুক্তিসঙ্গত দক্ষতা বজায় রাখার সময় নমুনা প্রতি সিকোয়েন্সিং খরচ কমানোর জন্য ) চালু করা হয়েছে।এটি সাধারণত প্রদত্ত আকারের সীমার মধ্যে সীমাবদ্ধতা খণ্ড নিষ্কাশন করে অর্জন করা হয়, যার নামকরণ করা হয় হ্রাসকৃত প্রতিনিধিত্ব লাইব্রেরি (RRL)।স্পেসিফিক-লোকাস এমপ্লিফাইড ফ্র্যাগমেন্ট সিকোয়েন্সিং (SLAF-Seq) হল একটি রেফারেন্স জিনোম সহ বা ছাড়া SNP জিনোটাইপিংয়ের জন্য একটি স্ব-উন্নত কৌশল।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম


পরিষেবার বিবরণ

ডেমো ফলাফল

বৈশিষ্ট্যযুক্ত প্রকাশনা

পরিষেবার বিবরণ

প্রযুক্তিগত স্কিম

111

কর্মধারা

流程图

পরিষেবার সুবিধা

উচ্চ মার্কার আবিষ্কার দক্ষতা- উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি SLAF-Seq কে পুরো জিনোমের মধ্যে কয়েক হাজার ট্যাগ আবিষ্কার করতে সহায়তা করে।

জিনোমের উপর কম নির্ভরতা- এটি একটি রেফারেন্স জিনোম সহ বা ছাড়া প্রজাতির ক্ষেত্রে প্রয়োগ করা যেতে পারে।

নমনীয় স্কিম নকশা- একক-এনজাইম, দ্বৈত-এনজাইম, মাল্টি-এনজাইম হজম এবং বিভিন্ন ধরনের এনজাইম, সবগুলিই বিভিন্ন গবেষণা লক্ষ্য বা প্রজাতির জন্য নির্বাচন করা যেতে পারে।সিলিকোতে প্রাক-মূল্যায়ন একটি সর্বোত্তম এনজাইম ডিজাইন নিশ্চিত করতে ব্যবহৃত হয়।

দক্ষ এনজাইমেটিক হজম- পূর্ব-পরীক্ষা করা হয়েছিল শর্তগুলিকে অপ্টিমাইজ করার জন্য, যা আনুষ্ঠানিক পরীক্ষাকে স্থিতিশীল এবং নির্ভরযোগ্য করে তোলে।ফ্র্যাগমেন্ট সংগ্রহের দক্ষতা 95% এর বেশি অর্জন করতে পারে।

সমানভাবে বিতরণ করা SLAF ট্যাগ- SLAF ট্যাগগুলি সমানভাবে সমস্ত ক্রোমোজোমে সর্বাধিক পরিমাণে বিতরণ করা হয়, প্রতি 4 kb-এ গড়ে 1 SLAF অর্জন করে।

পুনরাবৃত্তি কার্যকর পরিহার- SLAF-Seq ডেটাতে পুনরাবৃত্ত ক্রম 5%-এর কম হয়, বিশেষ করে উচ্চ স্তরের পুনরাবৃত্তির প্রজাতিগুলিতে, যেমন গম, ভুট্টা ইত্যাদি।

ব্যাপক অভিজ্ঞতা- গাছপালা, স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, কীটপতঙ্গ, জলজ-জীব ইত্যাদিকে আচ্ছাদনকারী শত শত প্রজাতির 2000 টিরও বেশি বন্ধ SLAF-Seq প্রকল্প।

স্ব-উন্নত বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো- চূড়ান্ত আউটপুটের নির্ভরযোগ্যতা এবং নির্ভুলতা নিশ্চিত করতে BMKGENE দ্বারা SLAF-Seq-এর জন্য একটি সমন্বিত বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো তৈরি করা হয়েছে।

 

পরিষেবা নির্দিষ্টকরণ

 

প্ল্যাটফর্ম

Conc.(ng/gl)

মোট (ug)

OD260/280

ইলুমিনা নোভাসেক

>35

>1.6(ভলিউম>15μl)

1.6-2.5

দ্রষ্টব্য: তিনটি নমুনা, প্রতিটি তিনটি এনজাইম স্কিম সহ, প্রাক-পরীক্ষার জন্য সঞ্চালিত হবে।

প্রস্তাবিত সিকোয়েন্সিং কৌশল

সিকোয়েন্সিং ডেপথ: 10X/ট্যাগ

জিনোম সাইজ

প্রস্তাবিত SLAF ট্যাগ

< 500 Mb

100K বা WGS

500 Mb- 1 গিগাবাইট

100 কে

1 জিবি -2 জিবি

200 কে

দৈত্য বা জটিল জিনোম

300 - 400K

 

অ্যাপ্লিকেশন

 

প্রস্তাবিত

জনসংখ্যা স্কেল

 

সিকোয়েন্সিং কৌশল এবং গভীরতা

 

গভীরতা

 

ট্যাগ সংখ্যা

 

জিডব্লিউএএস

 

নমুনা সংখ্যা ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

অনুসারে

জিনোমের আকার

 

জেনেটিক বিবর্তন

 

প্রত্যেকের ব্যক্তি

উপগোষ্ঠী ≥ 10;

মোট নমুনা ≥ 30

 

10X

 

প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ

ধারক: 2 মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব

বেশিরভাগ নমুনার জন্য, আমরা ইথানলে সংরক্ষণ না করার পরামর্শ দিই।

নমুনা লেবেলিং: নমুনা তথ্য ফর্ম জমা দিতে নমুনা পরিষ্কারভাবে লেবেল এবং অভিন্ন করা প্রয়োজন.

চালান: শুকনো বরফ: নমুনাগুলি প্রথমে ব্যাগে প্যাক করতে হবে এবং শুকনো বরফের মধ্যে কবর দিতে হবে।

পরিষেবা কর্মপ্রবাহ

নমুনা QC
পাইলট পরীক্ষা
SLAF পরীক্ষা
লাইব্রেরি প্রস্তুতি
সিকোয়েন্সিং
তথ্য বিশ্লেষণ
পরে বিক্রয় সেবা

নমুনা QC

পাইলট পরীক্ষা

SLAF- পরীক্ষা

লাইব্রেরি প্রস্তুতি

সিকোয়েন্সিং

তথ্য বিশ্লেষণ

পরে বিক্রয় সেবা


  • আগে:
  • পরবর্তী:

  • 1. মানচিত্রের ফলাফলের পরিসংখ্যান

    ইমেজ1

    A1

    2. SLAF মার্কার উন্নয়ন

    A2

    3. পরিবর্তনের টীকা

    A3

    বছর

    জার্নাল

    IF

    শিরোনাম

    অ্যাপ্লিকেশন

    2022

    প্রকৃতি যোগাযোগ

    17.694

    গিগা-ক্রোমোজোমের জিনোমিক ভিত্তি এবং গাছের পিওনির গিগা-জিনোম

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    নতুন ফাইটোলজিস্ট

    7.433

    গৃহপালিত পদচিহ্নগুলি কৃষিগত গুরুত্বের জিনোমিক অঞ্চলগুলিকে নোঙ্গর করে৷

    সয়াবিন

    SLAF-GWAS

    2022

    জার্নাল অফ অ্যাডভান্সড রিসার্চ

    12.822

    G. hirsutum-এ গসিপিয়াম বার্বাডেনসের জিনোম-ওয়াইড কৃত্রিম অনুপ্রবেশ

    তুলার ফাইবারের গুণমান এবং ফলনের একযোগে উন্নতির জন্য উচ্চতর অবস্থান প্রকাশ করুন

    বৈশিষ্ট্য

    SLAF-বিবর্তনীয় জেনেটিক্স

    2019

    আণবিক উদ্ভিদ

    10.81

    পপুলেশন জিনোমিক অ্যানালাইসিস এবং ডি নভো অ্যাসেম্বলি উইডির উৎপত্তি প্রকাশ করে

    একটি বিবর্তনীয় খেলা হিসাবে ভাত

    SLAF-বিবর্তনীয় জেনেটিক্স

    2019

    প্রকৃতি জেনেটিক্স

    31.616

    সাধারণ কার্প, সাইপ্রিনাস কার্পিওর জিনোম সিকোয়েন্স এবং জেনেটিক বৈচিত্র্য

    SLAF-লিঙ্কেজ মানচিত্র

    2014

    প্রকৃতি জেনেটিক্স

    25.455

    চাষকৃত চিনাবাদামের জিনোম লেগুম ক্যারিওটাইপ, পলিপ্লয়েডের অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে

    বিবর্তন এবং শস্য গৃহপালন।

    SLAF-লিঙ্কেজ মানচিত্র

    2022

    উদ্ভিদ বায়োটেকনোলজি জার্নাল

    9.803

    ST1-এর শনাক্তকরণ একটি নির্বাচনকে প্রকাশ করে যার মধ্যে বীজ রূপতত্ত্বের হিচহাইকিং জড়িত

    এবং সয়াবিন গৃহপালিত করার সময় তেলের পরিমাণ

    SLAF-মার্কার উন্নয়ন

    2022

    ইন্টারন্যাশনাল জার্নাল অফ মলিকুলার সায়েন্সেস

    6.208

    একটি গম-লেমাস মলিস 2Ns (2D) এর জন্য সনাক্তকরণ এবং ডিএনএ মার্কার বিকাশ

    ডিসোমিক ক্রোমোজোম প্রতিস্থাপন

    SLAF-মার্কার উন্নয়ন

    একটি উদ্ধৃতি পেতে

    এখানে আপনার বার্তা লিখুন এবং আমাদের পাঠান

    আমাদের কাছে আপনার বার্তা পাঠান: