উচ্চ মার্কার আবিষ্কার দক্ষতা- উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি SLAF-Seq কে পুরো জিনোমের মধ্যে কয়েক হাজার ট্যাগ আবিষ্কার করতে সহায়তা করে।
জিনোমের উপর কম নির্ভরতা- এটি একটি রেফারেন্স জিনোম সহ বা ছাড়া প্রজাতির ক্ষেত্রে প্রয়োগ করা যেতে পারে।
নমনীয় স্কিম নকশা- একক-এনজাইম, দ্বৈত-এনজাইম, মাল্টি-এনজাইম হজম এবং বিভিন্ন ধরনের এনজাইম, সবগুলিই বিভিন্ন গবেষণা লক্ষ্য বা প্রজাতির জন্য নির্বাচন করা যেতে পারে।সিলিকোতে প্রাক-মূল্যায়ন একটি সর্বোত্তম এনজাইম ডিজাইন নিশ্চিত করতে ব্যবহৃত হয়।
দক্ষ এনজাইমেটিক হজম- পূর্ব-পরীক্ষা করা হয়েছিল শর্তগুলিকে অপ্টিমাইজ করার জন্য, যা আনুষ্ঠানিক পরীক্ষাকে স্থিতিশীল এবং নির্ভরযোগ্য করে তোলে।ফ্র্যাগমেন্ট সংগ্রহের দক্ষতা 95% এর বেশি অর্জন করতে পারে।
সমানভাবে বিতরণ করা SLAF ট্যাগ- SLAF ট্যাগগুলি সমানভাবে সমস্ত ক্রোমোজোমে সর্বাধিক পরিমাণে বিতরণ করা হয়, প্রতি 4 kb-এ গড়ে 1 SLAF অর্জন করে।
পুনরাবৃত্তি কার্যকর পরিহার- SLAF-Seq ডেটাতে পুনরাবৃত্ত ক্রম 5%-এর কম হয়, বিশেষ করে উচ্চ স্তরের পুনরাবৃত্তির প্রজাতিগুলিতে, যেমন গম, ভুট্টা ইত্যাদি।
ব্যাপক অভিজ্ঞতা- গাছপালা, স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, কীটপতঙ্গ, জলজ-জীব ইত্যাদিকে আচ্ছাদনকারী শত শত প্রজাতির 2000 টিরও বেশি বন্ধ SLAF-Seq প্রকল্প।
স্ব-উন্নত বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো- চূড়ান্ত আউটপুটের নির্ভরযোগ্যতা এবং নির্ভুলতা নিশ্চিত করতে BMKGENE দ্বারা SLAF-Seq-এর জন্য একটি সমন্বিত বায়োইনফরম্যাটিক ওয়ার্কফ্লো তৈরি করা হয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম | Conc.(ng/gl) | মোট (ug) | OD260/280 |
ইলুমিনা নোভাসেক | >35 | >1.6(ভলিউম>15μl) | 1.6-2.5 |
সিকোয়েন্সিং ডেপথ: 10X/ট্যাগ
জিনোম সাইজ | প্রস্তাবিত SLAF ট্যাগ |
< 500 Mb | 100K বা WGS |
500 Mb- 1 গিগাবাইট | 100 কে |
1 জিবি -2 জিবি | 200 কে |
দৈত্য বা জটিল জিনোম | 300 - 400K |
অ্যাপ্লিকেশন
| প্রস্তাবিত জনসংখ্যা স্কেল
| সিকোয়েন্সিং কৌশল এবং গভীরতা
| |
গভীরতা
| ট্যাগ সংখ্যা
| ||
জিডব্লিউএএস
| নমুনা সংখ্যা ≥ 200
| 10X
|
অনুসারে জিনোমের আকার
|
জেনেটিক বিবর্তন
| প্রত্যেকের ব্যক্তি উপগোষ্ঠী ≥ 10; মোট নমুনা ≥ 30
| 10X
|
ধারক: 2 মিলি সেন্ট্রিফিউজ টিউব
বেশিরভাগ নমুনার জন্য, আমরা ইথানলে সংরক্ষণ না করার পরামর্শ দিই।
নমুনা লেবেলিং: নমুনা তথ্য ফর্ম জমা দিতে নমুনা পরিষ্কারভাবে লেবেল এবং অভিন্ন করা প্রয়োজন.
চালান: শুকনো বরফ: নমুনাগুলি প্রথমে ব্যাগে প্যাক করতে হবে এবং শুকনো বরফের মধ্যে কবর দিতে হবে।
1. মানচিত্রের ফলাফলের পরিসংখ্যান
2. SLAF মার্কার উন্নয়ন
3. পরিবর্তনের টীকা
বছর | জার্নাল | IF | শিরোনাম | অ্যাপ্লিকেশন |
2022 | প্রকৃতি যোগাযোগ | 17.694 | গিগা-ক্রোমোজোমের জিনোমিক ভিত্তি এবং গাছের পিওনির গিগা-জিনোম Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
2015 | নতুন ফাইটোলজিস্ট | 7.433 | গৃহপালিত পদচিহ্নগুলি কৃষিগত গুরুত্বের জিনোমিক অঞ্চলগুলিকে নোঙ্গর করে৷ সয়াবিন | SLAF-GWAS |
2022 | জার্নাল অফ অ্যাডভান্সড রিসার্চ | 12.822 | G. hirsutum-এ গসিপিয়াম বার্বাডেনসের জিনোম-ওয়াইড কৃত্রিম অনুপ্রবেশ তুলার ফাইবারের গুণমান এবং ফলনের একযোগে উন্নতির জন্য উচ্চতর অবস্থান প্রকাশ করুন বৈশিষ্ট্য | SLAF-বিবর্তনীয় জেনেটিক্স |
2019 | আণবিক উদ্ভিদ | 10.81 | পপুলেশন জিনোমিক অ্যানালাইসিস এবং ডি নভো অ্যাসেম্বলি উইডির উৎপত্তি প্রকাশ করে একটি বিবর্তনীয় খেলা হিসাবে ভাত | SLAF-বিবর্তনীয় জেনেটিক্স |
2019 | প্রকৃতি জেনেটিক্স | 31.616 | সাধারণ কার্প, সাইপ্রিনাস কার্পিওর জিনোম সিকোয়েন্স এবং জেনেটিক বৈচিত্র্য | SLAF-লিঙ্কেজ মানচিত্র |
2014 | প্রকৃতি জেনেটিক্স | 25.455 | চাষকৃত চিনাবাদামের জিনোম লেগুম ক্যারিওটাইপ, পলিপ্লয়েডের অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে বিবর্তন এবং শস্য গৃহপালন। | SLAF-লিঙ্কেজ মানচিত্র |
2022 | উদ্ভিদ বায়োটেকনোলজি জার্নাল | 9.803 | ST1-এর শনাক্তকরণ একটি নির্বাচনকে প্রকাশ করে যার মধ্যে বীজ রূপতত্ত্বের হিচহাইকিং জড়িত এবং সয়াবিন গৃহপালিত করার সময় তেলের পরিমাণ | SLAF-মার্কার উন্নয়ন |
2022 | ইন্টারন্যাশনাল জার্নাল অফ মলিকুলার সায়েন্সেস | 6.208 | একটি গম-লেমাস মলিস 2Ns (2D) এর জন্য সনাক্তকরণ এবং ডিএনএ মার্কার বিকাশ ডিসোমিক ক্রোমোজোম প্রতিস্থাপন | SLAF-মার্কার উন্নয়ন |