প্ল্যাটফর্ম: NovaSeq প্ল্যাটফর্ম, PE150
লাইব্রেরির ধরন: 200-400bp ইনসার্ট বিসালফাইট ট্রিটেড ডিএনএ লাইব্রেরি
সিকোয়েন্সিং কৌশল: পেয়ারড-এন্ড 150 bp
ডেটা আউটপুট সুপারিশ করুন: 10 Gb কাঁচা ডেটা/নমুনা
DNA পরিমাণ: ≥ 2ug
DNA ঘনত্ব: ≥ 20ng/μl।
বিশুদ্ধতা: OD260/280 = 1.8 থেকে 2.0 অবনতি বা RNA দূষণ ছাড়াই
a.রেফারেন্স জিনোম প্রান্তিককরণ পরিসংখ্যান
Sসি সাইটের সিকোয়েন্সিং ডেপথ এবং কভারেজের পরিসংখ্যান
Aসঞ্চিত কভারেজ
Dপ্রতিটি নমুনার ইজেশন দক্ষতা
b.মিথিলেশন সাইট সনাক্তকরণ
সি সাইটে মেথিলেশন স্তরের তালিকা
Bএস রূপান্তর
c.মিথিলেশন মানচিত্র
Genome উপাদান
d.নমুনার মধ্যে মিথাইলেশন স্তরের তুলনা
Pসিজি মিথিলেশনের বায়ুমণ্ডিত পারস্পরিক সম্পর্ক
d.ভিন্নভাবে মিথিলেশন বিশ্লেষণ
SDMR এর পরিসংখ্যান