-
মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং
মেটাট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং প্রাকৃতিক পরিবেশে (যেমন মাটি, জল, সমুদ্র, মল এবং অন্ত্রের) মধ্যে জীবাণুর (ইউক্যারিওট এবং প্রোক্যারিওটস উভয়) জিনের অভিব্যক্তি চিহ্নিত করে। বিশেষত, এই পরিষেবাগুলি আপনাকে জটিল জীবাণু সম্প্রদায়ের সম্পূর্ণ জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলিং পেতে দেয়, ট্যাক্সোনমিকেশন। প্রজাতির, ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিনের কার্যকরী সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ এবং আরও অনেক কিছু।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
ছত্রাকের জিনোম
বায়োমার্কার টেকনোলজি নির্দিষ্ট গবেষণা লক্ষ্যের উপর নির্ভর করে জিনোম জরিপ, সূক্ষ্ম জিনোম এবং ছত্রাকের পেন-সম্পূর্ণ জিনোম প্রদান করে।উচ্চ-স্তরের জিনোম সমাবেশ অর্জনের জন্য পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং + থার্ড জেনারেশন সিকোয়েন্সিং একত্রিত করে জিনোম সিকোয়েন্সিং, অ্যাসেম্বলি এবং কার্যকরী টীকা অর্জন করা যেতে পারে।ক্রোমোজোম স্তরে জিনোম সমাবেশের সুবিধার্থে হাই-সি প্রযুক্তিও নিযুক্ত করা যেতে পারে।
প্ল্যাটফর্ম:PacBio সিক্যুয়েল II
Nanopore PromethION P48
ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
টুলকিটস
BMKCloud হল একটি নেতৃস্থানীয় বায়োইনফরম্যাটিক প্ল্যাটফর্ম যা জিনোমিক প্রোগ্রামগুলির জন্য এক-স্টপ সমাধান প্রদান করে, যা চিকিৎসা, কৃষি, পরিবেশগত, ইত্যাদি সহ বিভিন্ন ক্ষেত্রের গবেষকদের দ্বারা ব্যাপকভাবে বিশ্বস্ত৷ , কম্পিউটিং রিসোর্স, পাবলিক ডাটাবেস, বায়োইনফরমটিক অনলাইন কোর্স, ইত্যাদি। BMKCloud-এ জিন টীকা, বিবর্তনীয় জেনেটিক টুল, ncRNA, ডেটা কোয়ালিটি কন্ট্রোল, সমাবেশ, সারিবদ্ধকরণ, ডেটা এক্সট্রাকশন, মিউটেশন, পরিসংখ্যান, ফিগার জেনারেটর, সিকোয়েন্স সহ বিভিন্ন ঘন ঘন ব্যবহৃত বায়োইনফরম্যাটিক টুল রয়েছে। বিশ্লেষণ, ইত্যাদি
-
ব্যাকটেরিয়া সম্পূর্ণ জিনোম
বায়োমার্কার টেকনোলজিস শূন্য ব্যবধানে ব্যাকটেরিয়ার সম্পূর্ণ জিনোম তৈরি করার জন্য সিকোয়েন্সিং পরিষেবা প্রদান করে।ব্যাকটেরিয়া সম্পূর্ণ জিনোম নির্মাণের প্রধান কার্যপ্রবাহের মধ্যে রয়েছে তৃতীয় প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং, সমাবেশ, কার্যকরী টীকা এবং উন্নত বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ যা নির্দিষ্ট গবেষণা লক্ষ্য পূরণ করে।ব্যাকটেরিয়া জিনোমের আরও বিস্তৃত প্রোফাইলিং তাদের জৈবিক প্রক্রিয়াগুলির অন্তর্নিহিত মৌলিক প্রক্রিয়াগুলিকে প্রকাশ করার ক্ষমতা দেয়, যা উচ্চতর ইউক্যারিওটিক প্রজাতিতে জিনোমিক গবেষণার জন্য মূল্যবান রেফারেন্স প্রদান করতে পারে।
প্ল্যাটফর্ম:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq প্ল্যাটফর্ম
PacBio সিক্যুয়েল II
-
ছোট আরএনএ
ছোট আরএনএ হল ছোট নন-কোডিং আরএনএর প্রকার যার গড় দৈর্ঘ্য 18-30 এনটি, যার মধ্যে miRNA, siRNA এবং piRNA।এই ছোট আরএনএগুলি ব্যাপকভাবে বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়া যেমন mRNA অবক্ষয়, অনুবাদ প্রতিরোধ, হেটেরোক্রোমাটিন গঠন ইত্যাদির সাথে জড়িত বলে জানা গেছে। ছোট আরএনএ সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণ প্রাণী/উদ্ভিদ বিকাশ, রোগ, ভাইরাস ইত্যাদির উপর গবেষণায় ব্যাপকভাবে প্রয়োগ করা হয়েছে। সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ এবং উন্নত ডেটা মাইনিং নিয়ে গঠিত।RNA-seq ডেটার ভিত্তিতে, স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ miRNA সনাক্তকরণ এবং ভবিষ্যদ্বাণী, miRNA লক্ষ্য জিন পূর্বাভাস, টীকা এবং অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ অর্জন করতে পারে।উন্নত বিশ্লেষণ কাস্টমাইজড miRNA অনুসন্ধান এবং নিষ্কাশন, ভেন ডায়াগ্রাম জেনারেশন, miRNA এবং টার্গেট জিন নেটওয়ার্ক বিল্ডিং সক্ষম করে।
-
NGS-WGS (ইলুমিনা/বিজিআই)
NGS-WGS হল একটি সম্পূর্ণ জিনোম রি-সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম, যা বায়োমার্কার টেকনোলজিতে সমৃদ্ধ অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে তৈরি করা হয়েছে।এই সহজে-ব্যবহারের প্ল্যাটফর্মটি কেবলমাত্র কয়েকটি মৌলিক প্যারামিটার সেট করে একটি সমন্বিত বিশ্লেষণ কর্মপ্রবাহ দ্রুত জমা দেওয়ার অনুমতি দেয়, যা ইলুমিনা প্ল্যাটফর্ম এবং বিজিআই সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম উভয় থেকে তৈরি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটার জন্য উপযুক্ত।এই প্ল্যাটফর্মটি উচ্চ কার্যকারিতা কম্পিউটিং সার্ভারে স্থাপন করা হয়েছে, যা অত্যন্ত সীমিত সময়ের মধ্যে অত্যন্ত দক্ষ ডেটা বিশ্লেষণকে শক্তিশালী করে।পরিবর্তিত জিন কোয়েরি, পিসিআর প্রাইমার ডিজাইন ইত্যাদি সহ স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণের ভিত্তিতে ব্যক্তিগতকৃত ডেটা মাইনিং উপলব্ধ।
-
mRNA(রেফারেন্স)
ট্রান্সক্রিপ্টোম হল জিনোমিক জেনেটিক তথ্য এবং জৈবিক ফাংশনের প্রোটিওমের মধ্যে সংযোগ।ট্রান্সক্রিপশনাল লেভেল রেগুলেশন হল জীবের সবচেয়ে গুরুত্বপূর্ণ এবং সবচেয়ে ব্যাপকভাবে অধ্যয়ন করা রেগুলেশন মোড।ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং ট্রান্সক্রিপ্টোমকে যেকোনো সময়ে বা যেকোনো অবস্থার অধীনে সিকোয়েন্স করতে পারে, একটি একক নিউক্লিওটাইডের সঠিক রেজোলিউশন সহ। এটি গতিশীলভাবে জিন ট্রান্সক্রিপশনের স্তরকে প্রতিফলিত করতে পারে, একই সাথে বিরল এবং সাধারণ ট্রান্সক্রিপ্টগুলি সনাক্ত করতে এবং পরিমাপ করতে পারে এবং এর কাঠামোগত তথ্য প্রদান করতে পারে। নমুনা নির্দিষ্ট প্রতিলিপি।
বর্তমানে, ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি কৃষিবিদ্যা, ঔষধ এবং অন্যান্য গবেষণার ক্ষেত্রে ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে, যার মধ্যে রয়েছে প্রাণী ও উদ্ভিদ উন্নয়ন নিয়ন্ত্রণ, পরিবেশগত অভিযোজন, ইমিউন মিথস্ক্রিয়া, জিন স্থানীয়করণ, প্রজাতির জেনেটিক বিবর্তন এবং টিউমার এবং জেনেটিক রোগ সনাক্তকরণ।
-
মেটাজেনমিক্স (এনজিএস)
এই বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মটি বছরের অভিজ্ঞতার ভিত্তিতে শটগান মেটাজেনমিক ডেটা বিশ্লেষণের জন্য ডিজাইন করা হয়েছে।এতে ডেটা প্রসেসিং, প্রজাতি-স্তরের অধ্যয়ন, জিন ফাংশন-স্তরের অধ্যয়ন, মেটাজেনোম বিনিং, ইত্যাদি সহ সাধারণভাবে প্রয়োজনীয় বিভিন্ন মেটাজেনোমিক্স বিশ্লেষণ সহ সমন্বিত কর্মপ্রবাহ রয়েছে। উপরন্তু, জিন এবং প্রজাতির ক্যোয়ারী সহ স্ট্যান্ডার্ড বিশ্লেষণ কর্মপ্রবাহের উপর কাস্টমাইজড ডেটা মাইনিং টুল উপলব্ধ রয়েছে। , প্যারামিটার সেটিং, ব্যক্তিগতকৃত চিত্র তৈরি করা ইত্যাদি।
-
LncRNA
লং নন-কোডিং RNAs (lncRNA) হল এক ধরনের ট্রান্সক্রিপ্ট যার দৈর্ঘ্য 200 nt এর বেশি, যা প্রোটিন কোড করতে অক্ষম।সঞ্চিত প্রমাণগুলি পরামর্শ দেয় যে বেশিরভাগ lncRNA কার্যকরী হওয়ার সম্ভাবনা খুব বেশি।উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি এবং বায়োইনফরম্যাটিক বিশ্লেষণ সরঞ্জামগুলি আমাদেরকে আরও দক্ষতার সাথে lncRNA সিকোয়েন্স এবং পজিশনিং তথ্য প্রকাশ করার ক্ষমতা দেয় এবং গুরুত্বপূর্ণ নিয়ন্ত্রক ফাংশনগুলির সাথে lncRNA আবিষ্কার করতে পরিচালিত করে।BMKCloud দ্রুত, নির্ভরযোগ্য এবং নমনীয় lncRNA বিশ্লেষণ অর্জনের জন্য আমাদের গ্রাহকদের lncRNA সিকোয়েন্সিং বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্ম প্রদান করতে পেরে গর্বিত।
-
জিডব্লিউএএস
জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি (জিডব্লিউএএস) নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্য (ফেনোটাইপ) এর সাথে সম্পর্কিত জেনেটিক বৈকল্পিক (জিনোটাইপ) সনাক্ত করা লক্ষ্য করে।জিডব্লিউএ অধ্যয়নগুলি জেনেটিক মার্কারগুলি বিপুল সংখ্যক ব্যক্তির সম্পূর্ণ জিনোম অতিক্রম করে এবং জনসংখ্যার স্তরে পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণের মাধ্যমে জিনোটাইপ-ফেনোটাইপ অ্যাসোসিয়েশনগুলির পূর্বাভাস দেয়।সম্পূর্ণ-জিনোম রিকোয়েন্সিং সম্ভাব্যভাবে সমস্ত জেনেটিক বৈকল্পিক আবিষ্কার করতে পারে।ফিনোটাইপিক ডেটার সাথে মিলিত হয়ে, জিডব্লিউএএসকে ফিনোটাইপ সম্পর্কিত SNP, QTL এবং প্রার্থী জিন সনাক্ত করতে প্রক্রিয়া করা যেতে পারে, যা আধুনিক প্রাণী/উদ্ভিদের প্রজননকে শক্তিশালীভাবে ব্যাক আপ করে।SLAF হল একটি স্ব-উন্নত সরলীকৃত জিনোম সিকোয়েন্সিং কৌশল, যা জিনোম-ওয়াইড ডিস্ট্রিবিউটেড মার্কার, SNP আবিষ্কার করে।এই এসএনপিগুলি, আণবিক জেনেটিক মার্কার হিসাবে, লক্ষ্যযুক্ত বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে অ্যাসোসিয়েশন স্টাডির জন্য প্রক্রিয়া করা যেতে পারে।এটি জটিল বৈশিষ্ট সম্পর্কিত জেনেটিক বৈচিত্র সনাক্তকরণে একটি সাশ্রয়ী কৌশল।
-
ন্যানোপুর পূর্ণ দৈর্ঘ্যের প্রতিলিপি
জীবের জটিল এবং পরিবর্তনশীল বিকল্প আইসোফর্মগুলি জিনের প্রকাশ এবং প্রোটিন বৈচিত্র্য নিয়ন্ত্রণের জন্য গুরুত্বপূর্ণ জেনেটিক প্রক্রিয়া।ট্রান্সক্রিপ্ট স্ট্রাকচারের সঠিক শনাক্তকরণ হল জিন এক্সপ্রেশন রেগুলেশন প্যাটার্নের গভীরভাবে অধ্যয়নের ভিত্তি।ন্যানোপুর সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম সফলভাবে ট্রান্সক্রিপ্টমিক অধ্যয়নকে আইসোফর্ম-স্তরে নিয়ে এসেছে।এই বিশ্লেষণ প্ল্যাটফর্মটি রেফারেন্স জিনোমের ভিত্তিতে ন্যানোপুর প্ল্যাটফর্মে উত্পন্ন RNA-Seq ডেটা বিশ্লেষণ করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে, যা জিন স্তর এবং ট্রান্সক্রিপ্ট উভয় স্তরেই গুণগত এবং পরিমাণগত বিশ্লেষণ অর্জন করে।
-
সার্ক-আরএনএ
সার্কুলার RNA(circRNA) হল এক ধরনের নন-কোডিং আরএনএ, যা সম্প্রতি উন্নয়নশীল, পরিবেশগত প্রতিরোধ, ইত্যাদির সাথে জড়িত নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলিতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে দেখা গেছে। সার্কআরএনএ-এর প্রান্তগুলি একত্রে যুক্ত হয়ে একটি বৃত্তাকার কাঠামো তৈরি করে, যা তাদের এক্সোনুক্লিজের হজম থেকে বাঁচায় এবং বেশিরভাগ রৈখিক আরএনএর চেয়ে বেশি স্থিতিশীল।সার্কআরএনএ জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণে বিভিন্ন ফাংশন রয়েছে বলে পাওয়া গেছে।CircRNA ceRNA হিসাবে কাজ করতে পারে, যা miRNA কে প্রতিযোগিতামূলকভাবে আবদ্ধ করে, যা miRNA স্পঞ্জ নামে পরিচিত।সার্কআরএনএ সিকোয়েন্সিং অ্যানালাইসিস প্ল্যাটফর্ম সার্কআরএনএ গঠন এবং অভিব্যক্তি বিশ্লেষণ, লক্ষ্য ভবিষ্যদ্বাণী এবং অন্যান্য ধরনের আরএনএ অণুর সাথে যৌথ বিশ্লেষণকে শক্তিশালী করে।
