-
একক- নিউক্লিয়াস আরএনএ সিকোয়েন্সিং
উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিংয়ের সাথে একক কোষ ক্যাপচারিং এবং পৃথক লাইব্রেরি নির্মাণের কৌশলের অগ্রগতি কোষ-বাই-কোষ ভিত্তিতে জিনের অভিব্যক্তি অধ্যয়নের অনুমতি দেয়।এটি জটিল কোষের জনসংখ্যার উপর একটি গভীর এবং সম্পূর্ণ সিস্টেম বিশ্লেষণ সক্ষম করে, যেখানে এটি সমস্ত কোষের গড় নিয়ে তাদের বৈচিত্র্যের মুখোশ এড়ায়।
যাইহোক, কিছু কোষ একক-কোষ সাসপেনশনে তৈরি করার জন্য উপযুক্ত নয়, তাই অন্যান্য নমুনা তৈরির পদ্ধতি - টিস্যু থেকে নিউক্লিয়াস নিষ্কাশন প্রয়োজন, অর্থাৎ, নিউক্লিয়াস সরাসরি টিস্যু বা কোষ থেকে বের করা হয় এবং একক-নিউক্লিয়াস সাসপেনশনে প্রস্তুত করা হয়। সেল সিকোয়েন্সিং।
BMK 10× Genomics ChromiumTM ভিত্তিক একক-কোষ RNA সিকোয়েন্সিং পরিষেবা প্রদান করে।এই পরিষেবাটি রোগ সম্পর্কিত গবেষণায় ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে, যেমন ইমিউন কোষের পার্থক্য, টিউমারের ভিন্নতা, টিস্যু বিকাশ ইত্যাদি।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম চিপ: 10× জিনোমিক্স
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্ম
-
উদ্ভিদ/প্রাণী পুরো জিনোম সিকোয়েন্সিং
সম্পূর্ণ জিনোম রি-সিকোয়েন্সিং, যা WGS নামেও পরিচিত, সিঙ্গেল নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (SNP), সন্নিবেশ মুছে ফেলা (InDel), স্ট্রাকচার ভ্যারিয়েশন (SV), এবং কপি নম্বর ভেরিয়েশন (CNV) সহ সমগ্র জিনোমে সাধারণ এবং বিরল উভয় মিউটেশন প্রকাশ করতে সক্ষম করে। )SVs SNPs-এর তুলনায় ভিন্নতার ভিত্তির একটি বৃহত্তর অংশ তৈরি করে এবং জিনোমের উপর বেশি প্রভাব ফেলে, যা জীবন্ত প্রাণীর উপর উল্লেখযোগ্য প্রভাব ফেলে।দীর্ঘ-পড়া রিকোয়েন্সিং বড় টুকরো এবং জটিল বৈচিত্রগুলির আরও সুনির্দিষ্ট সনাক্তকরণের অনুমতি দেয় কারণ দীর্ঘ পঠনগুলি জটিল অঞ্চলগুলি যেমন ট্যান্ডেম পুনরাবৃত্তি, GC/AT-সমৃদ্ধ অঞ্চল এবং হাইপার-ভেরিয়েবল অঞ্চলগুলির উপর ক্রোমোসোমাল অতিক্রম করাকে আরও সহজ করে তোলে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা, প্যাকবিও, ন্যানোপুর
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স বৈজ্ঞানিক উদ্ভাবনের সর্বাগ্রে অবস্থান করে, গবেষকদের তাদের স্থানিক প্রেক্ষাপট সংরক্ষণ করার সময় টিস্যুগুলির মধ্যে জটিল জিন প্রকাশের ধরণগুলি খুঁজে বের করার ক্ষমতা দেয়৷বিভিন্ন প্ল্যাটফর্মের মধ্যে, BMKGene গর্ব করে BMKManu S1000 Spatial Transcriptome চিপ তৈরি করেছেউন্নত রেজল্যুশন5µM এর, উপকোষীয় পরিসরে পৌঁছানো এবং সক্ষম করাবহু-স্তরের রেজোলিউশন সেটিংস.S1000 চিপ, প্রায় 2 মিলিয়ন দাগ সমন্বিত, স্থানিকভাবে বারকোডেড ক্যাপচার প্রোবের সাথে লোড করা পুঁতির স্তরযুক্ত মাইক্রোওয়েল নিয়োগ করে।একটি সিডিএনএ লাইব্রেরি, স্থানিক বারকোড দিয়ে সমৃদ্ধ, S1000 চিপ থেকে প্রস্তুত করা হয় এবং পরবর্তীতে ইলুমিনা নোভাসেক প্ল্যাটফর্মে ক্রমানুসারে তৈরি করা হয়।স্থানিকভাবে বারকোডযুক্ত নমুনা এবং UMI-এর সংমিশ্রণ উৎপন্ন ডেটার নির্ভুলতা এবং নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে।BMKManu S1000 চিপের অনন্য বৈশিষ্ট্যটি এর বহুমুখীতার মধ্যে রয়েছে, এটি বহু-স্তরের রেজোলিউশন সেটিংস অফার করে যা বিভিন্ন টিস্যু এবং বিশদ স্তরের সাথে সূক্ষ্মভাবে টিউন করা যেতে পারে।এই অভিযোজনযোগ্যতা ন্যূনতম শব্দের সাথে সুনির্দিষ্ট স্থানিক ক্লাস্টারিং নিশ্চিত করে বিভিন্ন স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স অধ্যয়নের জন্য একটি অসামান্য পছন্দ হিসাবে চিপটিকে অবস্থান করে।
BMKManu S1000 চিপ এবং অন্যান্য স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্স প্রযুক্তি ব্যবহার করে, গবেষকরা কোষের স্থানিক সংগঠন এবং টিস্যুগুলির মধ্যে ঘটে যাওয়া জটিল আণবিক মিথস্ক্রিয়া সম্পর্কে আরও ভাল ধারণা অর্জন করতে পারে, বিস্তৃত ক্ষেত্র সহ জৈবিক প্রক্রিয়াগুলির অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে অমূল্য অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। অনকোলজি, নিউরোসায়েন্স, ডেভেলপমেন্টাল বায়োলজি, ইমিউনোলজি এবং বোটানিক্যাল স্টাডিজ।
প্ল্যাটফর্ম: BMKManu S1000 চিপ এবং Illumina NovaSeq
-
10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোম
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স হল একটি অত্যাধুনিক প্রযুক্তি যা গবেষকদের তাদের স্থানিক প্রসঙ্গ সংরক্ষণ করার সময় টিস্যুগুলির মধ্যে জিনের প্রকাশের ধরণগুলি তদন্ত করতে দেয়।এই ডোমেনের একটি শক্তিশালী প্ল্যাটফর্ম হল 10x জিনোমিক্স ভিজিয়াম এবং ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং।10X ভিজিয়ামের নীতিটি একটি বিশেষ চিপের উপরে একটি মনোনীত ক্যাপচার এলাকা যেখানে টিস্যু বিভাগগুলি স্থাপন করা হয়।এই ক্যাপচার এলাকায় বারকোডযুক্ত দাগ রয়েছে, প্রতিটি টিস্যুর মধ্যে একটি অনন্য স্থানিক অবস্থানের সাথে সম্পর্কিত।টিস্যু থেকে বন্দী আরএনএ অণুগুলিকে তারপরে বিপরীত প্রতিলিপি প্রক্রিয়া চলাকালীন অনন্য আণবিক সনাক্তকারী (UMIs) দিয়ে লেবেল করা হয়।এই বারকোডযুক্ত দাগ এবং UMIগুলি একটি একক-কোষ রেজোলিউশনে সুনির্দিষ্ট স্থানিক ম্যাপিং এবং জিনের অভিব্যক্তির পরিমাণ নির্ধারণ করতে সক্ষম করে।স্থানিকভাবে বারকোডযুক্ত নমুনা এবং UMI-এর সংমিশ্রণ উৎপন্ন ডেটার নির্ভুলতা এবং নির্দিষ্টতা নিশ্চিত করে।এই স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স প্রযুক্তি ব্যবহার করে, গবেষকরা কোষের স্থানিক সংগঠন এবং টিস্যুগুলির মধ্যে ঘটে যাওয়া জটিল আণবিক মিথস্ক্রিয়া সম্পর্কে গভীর উপলব্ধি অর্জন করতে পারেন, অনকোলজি, নিউরোসায়েন্স, উন্নয়নমূলক জীববিদ্যা, ইমিউনোলজি সহ একাধিক ক্ষেত্রে জৈবিক প্রক্রিয়ার অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়াগুলির অমূল্য অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। , এবং বোটানিক্যাল স্টাডিজ।
প্ল্যাটফর্ম: 10X জিনোমিক্স ভিজিয়াম এবং ইলুমিনা নোভাসেক
-
পূর্ণ-দৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং-ন্যানোপোর
যদিও এনজিএস-ভিত্তিক এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং জিনের প্রকাশের পরিমাণ নির্ধারণের জন্য একটি বহুমুখী হাতিয়ার হিসাবে কাজ করে, তবে সংক্ষিপ্ত পাঠের উপর এর নির্ভরতা জটিল ট্রান্সক্রিপ্টমিক বিশ্লেষণে এর কার্যকারিতা সীমাবদ্ধ করে।অন্যদিকে, ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং দীর্ঘ-পঠিত প্রযুক্তি ব্যবহার করে, পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের এমআরএনএ প্রতিলিপিগুলির সিকোয়েন্সিং সক্ষম করে।এই পদ্ধতিটি বিকল্প স্প্লিসিং, জিন ফিউশন, পলি-অ্যাডিনাইলেশন এবং এমআরএনএ আইসোফর্মের পরিমাণ নির্ধারণের একটি ব্যাপক অনুসন্ধানের সুবিধা দেয়।
ন্যানোপোর সিকোয়েন্সিং ন্যানোপোর একক-অণু রিয়েল-টাইম বৈদ্যুতিক সংকেতের উপর নির্ভর করে।মোটর প্রোটিন দ্বারা পরিচালিত, ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ একটি বায়োফিল্মে এম্বেড করা ন্যানোপোর প্রোটিনের সাথে আবদ্ধ হয়, এটি ভোল্টেজের পার্থক্যের অধীনে ন্যানোপোর চ্যানেলের মধ্য দিয়ে যাওয়ার সময় বন্ধ হয়ে যায়।ডিএনএ স্ট্র্যান্ডের বিভিন্ন ঘাঁটি দ্বারা উত্পন্ন স্বতন্ত্র বৈদ্যুতিক সংকেতগুলি সনাক্ত করা হয় এবং রিয়েল-টাইমে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়, যা সঠিক এবং অবিচ্ছিন্ন নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্সিংয়ের সুবিধা দেয়।এই উদ্ভাবনী পদ্ধতিটি স্বল্প-পঠিত সীমাবদ্ধতাগুলি অতিক্রম করে এবং জটিল জিনোমিক বিশ্লেষণের জন্য একটি গতিশীল প্ল্যাটফর্ম প্রদান করে, এতে জটিল ট্রান্সক্রিপ্টমিক অধ্যয়ন অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।
প্ল্যাটফর্ম: Nanopore Promethion P48
-
পূর্ণ-দৈর্ঘ্য mRNA সিকোয়েন্সিং -PacBio
যদিও এনজিএস-ভিত্তিক এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং জিনের অভিব্যক্তির পরিমাণ নির্ধারণের জন্য একটি বহুমুখী হাতিয়ার, সংক্ষিপ্ত পাঠের উপর এর নির্ভরতা জটিল ট্রান্সক্রিপ্টমিক বিশ্লেষণে এর ব্যবহারকে সীমাবদ্ধ করে।অন্যদিকে PacBio সিকোয়েন্সিং (Iso-Seq), দীর্ঘ-পঠিত প্রযুক্তি ব্যবহার করে, পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের mRNA ট্রান্সক্রিপ্টের সিকোয়েন্সিং সক্ষম করে।এই পদ্ধতিটি বিকল্প স্প্লিসিং, জিন ফিউশন এবং পলি-অ্যাডিনাইলেশনের একটি ব্যাপক অনুসন্ধানের সুবিধা দেয় যদিও এটি জিন এক্সপ্রেশন কোয়ান্টিফিকেশনের জন্য প্রাথমিক পছন্দ নয়, প্রয়োজনীয় পরিমাণে ডেটার কারণে।
PacBio সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি একক-অণু, রিয়েল-টাইম (SMRT) সিকোয়েন্সিংয়ের উপর নির্ভর করে, পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের mRNA ট্রান্সক্রিপ্ট ক্যাপচার করার ক্ষেত্রে একটি স্বতন্ত্র সুবিধা প্রদান করে।এই উদ্ভাবনী পদ্ধতিতে জিরো-মোড ওয়েভগাইড (ZMWs), মাইক্রোফ্যাব্রিকেটেড কূপ ব্যবহার করা জড়িত যা সিকোয়েন্সিংয়ের সময় DNA পলিমারেজ কার্যকলাপের রিয়েল-টাইম পর্যবেক্ষণ সক্ষম করে।এই ZMWs-এর মধ্যে, PacBio-এর DNA পলিমারেজ DNA-এর একটি পরিপূরক স্ট্র্যান্ডকে সংশ্লেষিত করে, দীর্ঘ পাঠ তৈরি করে যা সম্পূর্ণ mRNA ট্রান্সক্রিপ্টকে বিস্তৃত করে।সার্কুলার কনসেনসাস সিকোয়েন্সিং (CCS) মোডে PacBio অপারেশন একই অণুকে বারবার সিকোয়েন্স করে নির্ভুলতা বাড়ায়।জেনারেট করা হাইফাই রিডগুলির এনজিএস-এর সাথে তুলনীয় নির্ভুলতা রয়েছে, যা জটিল ট্রান্সক্রিপ্টমিক বৈশিষ্ট্যগুলির একটি ব্যাপক এবং নির্ভরযোগ্য বিশ্লেষণে আরও অবদান রাখে।প্ল্যাটফর্ম: PacBio সিক্যুয়েল II
-
ইউক্যারিওটিক এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে কোষের মধ্যে সমস্ত এমআরএনএ ট্রান্সক্রিপ্টের ব্যাপক প্রোফাইলিংয়ের ক্ষমতা দেয়।এই অত্যাধুনিক প্রযুক্তি একটি শক্তিশালী হাতিয়ার হিসেবে কাজ করে, জটিল জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল, জিন গঠন এবং বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়ার সাথে যুক্ত আণবিক প্রক্রিয়া উন্মোচন করে।মৌলিক গবেষণা, ক্লিনিকাল ডায়াগনস্টিকস এবং ড্রাগ ডেভেলপমেন্টে ব্যাপকভাবে গৃহীত, এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং সেলুলার গতিবিদ্যা এবং জেনেটিক নিয়ন্ত্রণের জটিলতার অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক এক্স
-
নন-রেফারেন্স ভিত্তিক mRNA সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং নির্দিষ্ট অবস্থার অধীনে কোষের মধ্যে সমস্ত এমআরএনএ ট্রান্সক্রিপ্টের ব্যাপক প্রোফাইলিংয়ের ক্ষমতা দেয়।এই অত্যাধুনিক প্রযুক্তি একটি শক্তিশালী হাতিয়ার হিসেবে কাজ করে, জটিল জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল, জিন গঠন এবং বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়ার সাথে যুক্ত আণবিক প্রক্রিয়া উন্মোচন করে।মৌলিক গবেষণা, ক্লিনিকাল ডায়াগনস্টিকস এবং ড্রাগ ডেভেলপমেন্টে ব্যাপকভাবে গৃহীত, এমআরএনএ সিকোয়েন্সিং সেলুলার গতিবিদ্যা এবং জেনেটিক নিয়ন্ত্রণের জটিলতার অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক এক্স
-
দীর্ঘ নন-কোডিং সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
লং নন-কোডিং RNAs (lncRNAs) হল 200 টি নিউক্লিওটাইডের চেয়ে দীর্ঘ RNA যেগুলি ন্যূনতম কোডিং সম্ভাবনার অধিকারী এবং নন-কোডিং RNA-এর মধ্যে মূল উপাদান।নিউক্লিয়াস এবং সাইটোপ্লাজমে পাওয়া যায়, এই আরএনএগুলি এপিজেনেটিক, ট্রান্সক্রিপশনাল এবং পোস্ট-ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেশনে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে, সেলুলার এবং আণবিক প্রক্রিয়া গঠনে তাদের তাত্পর্যকে আন্ডারস্কোর করে।LncRNA সিকোয়েন্সিং হল কোষের পার্থক্য, অন্টোজেনেসিস এবং মানব রোগের একটি শক্তিশালী হাতিয়ার।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক
-
ছোট আরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
ছোট আরএনএ (sRNA) অণু, সাধারণত 200 নিউক্লিওটাইডের কম দৈর্ঘ্যের মধ্যে রয়েছে মাইক্রোআরএনএ (miRNAs), ছোট হস্তক্ষেপকারী RNAs (siRNAs), এবং piwi-interacting RNAs (piRNAs)।এর মধ্যে, miRNAs, প্রায় 20-24 নিউক্লিওটাইড দীর্ঘ, বিভিন্ন সেলুলার প্রক্রিয়াগুলিতে তাদের প্রধান নিয়ন্ত্রক ভূমিকার জন্য বিশেষভাবে উল্লেখযোগ্য।টিস্যু-নির্দিষ্ট এবং পর্যায়-নির্দিষ্ট এক্সপ্রেশন প্যাটার্ন সহ, miRNAs বিভিন্ন প্রজাতি জুড়ে উচ্চ সংরক্ষণ প্রদর্শন করে।
প্ল্যাটফর্ম: ইলুমিনা নোভাসেক
-
সার্কআরএনএ সিকোয়েন্সিং-ইলুমিনা
বৃত্তাকার RNA সিকোয়েন্সিং (circRNA-seq) হল বৃত্তাকার RNAs প্রোফাইল এবং বিশ্লেষণ করা, RNA অণুর একটি শ্রেণী যা নন-ক্যানোনিকাল স্প্লিসিং ইভেন্টের কারণে বন্ধ লুপ গঠন করে, এই RNAগুলিকে বর্ধিত স্থিতিশীলতা প্রদান করে।যদিও কিছু সার্কআরএনএগুলিকে মাইক্রোআরএনএ স্পঞ্জ হিসাবে কাজ করতে দেখা গেছে, মাইক্রোআরএনএগুলিকে পৃথক করে এবং তাদের লক্ষ্য এমআরএনএগুলিকে নিয়ন্ত্রণ করতে বাধা দেয়, অন্যান্য সার্কআরএনএগুলি প্রোটিনের সাথে যোগাযোগ করতে পারে, জিনের অভিব্যক্তি পরিবর্তন করতে পারে বা সেলুলার প্রক্রিয়াগুলিতে ভূমিকা রাখতে পারে।সার্কআরএনএ এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ এই অণুগুলির নিয়ন্ত্রক ভূমিকা এবং বিভিন্ন সেলুলার প্রক্রিয়া, বিকাশের পর্যায় এবং রোগের অবস্থার মধ্যে তাদের তাত্পর্য সম্পর্কে অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে, যা জিনের অভিব্যক্তির প্রেক্ষাপটে আরএনএ নিয়ন্ত্রণের জটিলতা সম্পর্কে গভীরভাবে বোঝার জন্য অবদান রাখে।
-
সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং - ইলুমিনা
সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্টোম সিকোয়েন্সিং কোডিং (mRNA) এবং নন-কোডিং RNAs (lncRNA, circRNA, এবং miRNA) উভয়কে অন্তর্ভুক্ত করে বিভিন্ন RNA অণুর প্রোফাইল করার জন্য একটি ব্যাপক পদ্ধতির প্রস্তাব করে।এই কৌশলটি একটি নির্দিষ্ট মুহুর্তে নির্দিষ্ট কোষের সম্পূর্ণ ট্রান্সক্রিপ্ট ক্যাপচার করে, যা সেলুলার প্রক্রিয়াগুলির একটি সামগ্রিক বোঝার জন্য অনুমতি দেয়।এটি "টোটাল আরএনএ সিকোয়েন্সিং" নামেও পরিচিত, এটির লক্ষ্য ট্রান্সক্রিপ্টম স্তরে জটিল নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলি উন্মোচন করা, যাতে প্রতিযোগী অন্তঃসত্ত্বা RNA (ceRNA) এবং যৌথ RNA বিশ্লেষণের মতো গভীর বিশ্লেষণ সক্ষম করা।এটি কার্যকরী চরিত্রায়নের দিকে প্রাথমিক পদক্ষেপ চিহ্নিত করে, বিশেষ করে সার্কআরএনএ-মিআরএনএ-এমআরএনএ-ভিত্তিক ceRNA মিথস্ক্রিয়া জড়িত নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলিকে উদ্ঘাটনে।
