1000 টিরও বেশি প্রজাতির জন্য জিনোম সিকোয়েন্সিংয়ের ব্যাপক অভিজ্ঞতা।
4000 টির বেশি একটি পুঞ্জীভূত প্রভাব ফ্যাক্টর সহ 800 টিরও বেশি প্রকাশিত মামলা।
বৈচিত্র কলিং এবং ফাংশন বিশ্লেষণের উপর ব্যাপক বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণ।
প্ল্যাটফর্ম | লাইব্রেরি | প্রস্তাবিত seq গভীরতা | |
ইলুমিনা | PE 150 | SNP এর জন্য, InDel কলিং ≥ 10x SV, CNY কলিং ≥ 30x এর জন্য
| |
ন্যানোপুর
| 8 kb | SV এর জন্য, CNY কলিং ≥ 20x | |
প্যাকবিও | সিসিএস | 15 কেবি | SNP, InDel, SV, CNY কলিং ≥ 10x এর জন্য |
প্ল্যাটফর্ম | কনক.(ng/μL)
| পরিমাণ (এনজি)
| বিশুদ্ধতা
| আগারোজ জেল
| ||
OD260/280 | OD260/230 | 1. কোন বা সীমিত সঙ্গে পরিষ্কার প্রধান ব্যান্ডজেলে অবক্ষয় পরিলক্ষিত হয়। 2. নেই বা সীমিত আরএনএ বা প্রোটিন দূষণ
| ||||
ইলুমিনা | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
ন্যানোপুর
| ≥30 | ডেটা ফলনের উপর নির্ভর করে 10μg/কোষ | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
প্যাকবিও | সিসিএস | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 |
1) জিনোম ম্যাপিং এর পরিসংখ্যান
সারণী 1 ম্যাপিং ফলাফল পরিসংখ্যান
চিত্র 1 সন্নিবেশ আকার বিতরণ এবং কভারেজ রিড.
2) বৈচিত্র্য সনাক্তকরণ
চিত্র 2 নমুনার মধ্যে SNP/INDEL/SV-এর পরিসংখ্যান এবং টীকা
চিত্র 3 জিনোম-ব্যাপী ভ্যাটিয়েশনের বিতরণ
3) বৈচিত্রের কার্যকরী টীকা
2019 | প্রকৃতি যোগাযোগ | সম্পূর্ণ-জিনোম রিকোয়েন্সিং এর উন্নতিতে জড়িত ব্রাসিকা ন্যাপাস উৎপত্তি এবং জেনেটিক লোকি প্রকাশ করে |
2020 | পিএনএএস | গোল্ডফিশের বিবর্তনীয় উত্স এবং গৃহপালিত ইতিহাস (ক্যারাসিয়াস অরাটাস) |
2021 | উদ্ভিদ বায়োটেকনোলজি জার্নাল | দুটি চাষকৃত পাটের প্রজাতির রেফারেন্স জিনোম |
2021 | উদ্ভিদ বায়োটেকনোলজি জার্নাল | উদ্ভিজ্জ এবং তৈলবীজের জিনোমিক স্বাক্ষর অ্যালোপলিপ্লয়েড ব্রাসিকাজুন্সিয়া এবং জিনগত লোকি যা গ্লুকোসিনোলেটস জমা নিয়ন্ত্রণ করে |
2019 | আণবিক উদ্ভিদ | রেপসিড অ্যাক্সেসের বিশ্বব্যাপী সংগ্রহের সম্পূর্ণ-জিনোম রিকোয়েন্সিং তাদের ইকোটাইপ বিচ্যুতির জেনেটিক ভিত্তি প্রকাশ করে |
2022 | উদ্যানতত্ত্ব গবেষণা | জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ তরমুজের বীজের আকারের প্রাকৃতিক পরিবর্তনের আণবিক অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে |
2021 | জার্নাল অফ এক্সপেরিমেন্টাল বোটানি | জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি GhSAD1 এর রূপগুলিকে চিহ্নিত করে যা তুলায় ঠান্ডা সহনশীলতা প্রদান করে |
2021 | জার্নাল অফ এক্সপেরিমেন্টাল বোটানি | জিনোম-ওয়াইড অ্যাসোসিয়েশন স্টাডি এবং ট্রান্সক্রিপ্টোম তুলনা উপন্যাস QTL এবং প্রার্থী জিন প্রকাশ করে যা রেপসিডে পাপড়ির আকার নিয়ন্ত্রণ করে |