জিনোম বিবর্তন
প্রকৃতি
যোগাযোগ
জিনোম সিকোয়েন্সগুলি বিশ্বব্যাপী ছড়িয়ে পড়ার পথ প্রকাশ করে এবং সমুদ্রের ঘোড়া বিবর্তনে অভিসারী জেনেটিক অভিযোজনের পরামর্শ দেয়
PacBio |ইলুমিনা |হাই-সি |WGS |জেনেটিক বৈচিত্র্য |জনসংখ্যার ইতিহাস |জিন প্রবাহ
প্যাকবিও সিকোয়েন্সিং, জিনোম ডি নভো সমাবেশ এবং টীকা পরিষেবাগুলি বায়োমার্কার টেকনোলজিস দ্বারা সরবরাহ করা হয়েছিল।
হাইলাইট
1. একটি উচ্চ মানের ক্রোমোজোম-স্তরের সমুদ্র ঘোড়া (হিপ্পোক্যাম্পাস ইরেক্টাস) 15.5 Mb এর কন্টিগ N50 সহ জিনোম পাওয়া গেছে।
2. বিশ্বব্যাপী 21টি সামুদ্রিক ঘোড়া প্রজাতির মোট 358টি জিনোম পুনরায় সংযোজন করা হয়েছিল।
3. অলিগোসিনের শেষের দিকে বিকশিত সামুদ্রিক ঘোড়া এবং পরবর্তী সার্কাম-বৈশ্বিক উপনিবেশের পথ চিহ্নিত করা হয়েছে এবং সমুদ্রের স্রোত এবং প্যালিওটেম্পোরাল সমুদ্রপথ খোলার গতিশীলতার পরিবর্তনের সাথে যুক্ত
4. পুনরাবৃত্ত "অস্থি কাঁটা" অভিযোজিত ফেনোটাইপের জেনেটিক ভিত্তি একটি মূল উন্নয়নমূলক জিনের স্বাধীন প্রতিস্থাপনের সাথে যুক্ত।
5.সমুদ্রের স্রোতের মাধ্যমে রাফটিং দুর্বল বিচ্ছুরণের জন্য ক্ষতিপূরণ দেয় এবং দ্রুত অভিযোজন নতুন বাসস্থান উপনিবেশের সুবিধা দেয়
অর্জন
চিত্র 1 জিনগত বৈচিত্র্য এবং 358টি সামুদ্রিক ঘোড়ার নমুনার ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক
ক22টি ক্রোমোজোম জুড়ে 21টি সামুদ্রিক ঘোড়া প্রজাতির নিউক্লিওটাইড বৈচিত্র্যের (π) প্যাটার্ন সহ নমুনাযুক্ত সমুদ্র ঘোড়াগুলির জন্য ভৌগলিক নমুনা স্থান।b 358টি সামুদ্রিক ঘোড়ার জিনোম-ওয়াইড এসএনপি দিয়ে নির্মিত প্রতিবেশী গাছ।(a) এর অবস্থান পিন চিহ্ন এবং (b) শাখার পটভূমি একে অপরের সাথে মিলে যায়।
চিত্র 2 সামুদ্রিক ঘোড়ার উপনিবেশ এবং জনসংখ্যার ইতিহাস
ক21টি সামুদ্রিক ঘোড়া প্রজাতির জন্য ফাইলোজেনেটিক গাছ এবং বিচ্যুতি সময় অনুমান।শাখা লাইনের পুরুত্ব জনসংখ্যার আকারের অনুমানের সাথে মিলে যায় (Ne) এবং রং বিভিন্ন বংশ নির্দেশ করে।I-III চিহ্নগুলি ক্রমাঙ্কন পয়েন্টগুলি নির্দেশ করে।b–d বিচ্যুতি সময়, বন্টন, ভিকারিয়েন্স ইভেন্ট এবং সমুদ্রের স্রোত (সাদা তীর) এর উপর ভিত্তি করে সমুদ্র ঘোড়াগুলির পূর্বাভাসিত উপনিবেশিক রুট (রঙিন তীর)।b ইন্দো-অস্ট্রেলিয়ান দ্বীপপুঞ্জ ছিল হিপ্পোক্যাম্পাস প্রজাতির উৎপত্তির কেন্দ্র (লাল চিহ্ন) সমুদ্র ঘোড়া বৈচিত্র্যময় এবং বিশ্বব্যাপী 18-23 মাএ ছড়িয়ে পড়ার আগে।c সামুদ্রিক ঘোড়ারা প্রাথমিকভাবে টেথিয়ান সমুদ্রপথের মাধ্যমে আটলান্টিক মহাসাগরে উপনিবেশ স্থাপন করেছিল, যেটি বন্ধ হওয়ার পর (7-13 Ma এর সময় টার্মিনাল ঘটনা), এই টেথিয়ান বংশকে তার ভারত মহাসাগরের বোন বংশ থেকে পৃথক করেছিল।পরেরটি, পরবর্তীকালে আরব সাগরে দ্রুত বৈচিত্র্য (হলুদ চিহ্নিতকরণ) সামুদ্রিক ঘোড়া বৈচিত্র্যের দ্বিতীয় কেন্দ্র স্থাপন করে।d আটলান্টিক মহাসাগরের একটি দ্বিতীয় সামুদ্রিক ঘোড়া উপনিবেশের ঘটনাটি ভারত মহাসাগর থেকে প্রায় 5Ma দক্ষিণ আফ্রিকার অগ্রভাগ অতিক্রম করে এবং অবশেষে প্রায় 3.6 Ma এ এখনও উন্মুক্ত পানামা সমুদ্রপথ দিয়ে পূর্ব প্রশান্ত মহাসাগরে পৌঁছায়।
চিত্র 3 কার্যকর জনসংখ্যার আকারে জিন প্রবাহ এবং ওঠানামা
কদক্ষিণ আটলান্টিক মহাসাগরে বসবাসকারী প্রজাতির মধ্যে জিন প্রবাহ সনাক্ত করা হয়েছে।জিন প্রবাহকে জি-ফোসিএস দ্বারা অনুমান করা মাইগ্রেশন হার হিসাবে সাদা লাইনের কাছাকাছি দেখানো হয়েছে।তীরের বেধ এবং দিক যথাক্রমে জিন প্রবাহের হার এবং দিকনির্দেশের সাথে মিলে যায়।b PSMC দ্বারা কার্যকর জনসংখ্যার আকারের ওঠানামা।x অক্ষ বর্তমানের আগের বছরগুলিতে সময়কে উপস্থাপন করে যখন y অক্ষ কার্যকর জনসংখ্যার আকারকে উপস্থাপন করে।চার্টগুলি মূলত বিভিন্ন বন্টন এলাকা সহ প্রতিটি প্রজাতির ভৌগলিক বন্টন অনুসারে সংগঠিত হয়।c বিগত 1 মিলিয়ন বছরে সমুদ্রপৃষ্ঠের মিটারে পরিবর্তন হয়েছে33।হলুদ রেখাটি শেষ গ্লোবাল ইন্টারগ্লাসিয়াল পিক নির্দেশ করে যখন সায়ান শেড শেষ হিমবাহের সর্বোচ্চ সময়কাল নির্দেশ করে।
চিত্র 4 মেরুদণ্ডের বিবর্তন।
কবাঁদিকে, সামুদ্রিক ঘোড়ায় মেরুদণ্ডের স্বাধীন বিবর্তন প্রদর্শন করে প্রজাতির গাছ।শাখার দৈর্ঘ্য প্রতি সাইটে প্রতিস্থাপনের সংখ্যা নির্দেশ করে।চারটি কাঁটাযুক্ত সামুদ্রিক ঘোড়া নীল রঙে হাইলাইট করা হয়েছে।মোটা শাখাগুলি bmp3 জিনের জন্য সমার্থক-থেকে-সমার্থক প্রতিস্থাপনের (dN/dS) উচ্চ হারের সাথে মিলে যায়।bmp3 জিনের জন্য ক্যানোনিকাল এবং জেনারালাইজড ম্যাকডোনাল্ড এবং ক্রিটম্যান পরীক্ষা (MKT) তিনটি পেয়ারওয়াইজ বোন প্রজাতির জন্য সঞ্চালিত হয়েছিল ভিন্ন ভিন্ন স্পাইনি এবং নন-স্পাইনি বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে ব্যাকগ্রাউন্ডের রঙ দ্বারা হাইলাইট করা হয়েছে, যার তাত্পর্য স্তরগুলি যথাক্রমে নীল এবং লাল ফন্ট সহ p মান দ্বারা নির্দেশিত হয়েছিল।ঠিক আছে, bmp3 প্রোটিনে অ্যামিনো অ্যাসিড প্রতিস্থাপনের তুলনা, কাঁটাযুক্ত সমুদ্রের ঘোড়াগুলিতে পলিমরফিক এবং স্থির প্রতিস্থাপন যথাক্রমে লাল এবং নীল বৃত্ত দিয়ে নির্দেশিত হয়।b নন-স্পাইনি প্রজাতির তুলনায় কাঁটাযুক্ত সামুদ্রিক ঘোড়াগুলিতে bmp3 তে dN/dS মান বিতরণ।c bmp3 দ্বারা এনকোড করা প্রোটিনের জন্য পুনর্গঠিত ফাইলোজেনেটিক গাছের স্বাধীন বিবর্তন।d হিপ্পোক্যাম্পাস ইরেক্টাসে bmp3 এর সিটু হাইব্রিডাইজেশনে পুরো মাউন্ট।
রেফারেন্স
লি সি এট আল।জিনোম সিকোয়েন্সগুলি বিশ্বব্যাপী ছড়িয়ে পড়ার পথ প্রকাশ করে এবং সমুদ্রের ঘোড়া বিবর্তনে অভিসারী জেনেটিক অভিযোজনের পরামর্শ দেয়।ন্যাট কমুন।2021 ফেব্রুয়ারী 17;12(1):1094।
খবর এবং হাইলাইট বায়োমার্কার টেকনোলজিসের সাথে সাম্প্রতিক সফল ঘটনাগুলি ভাগ করে নেওয়ার লক্ষ্য, অভিনব বৈজ্ঞানিক সাফল্যের পাশাপাশি গবেষণার সময় প্রয়োগ করা বিশিষ্ট কৌশলগুলি ক্যাপচার করা।
পোস্টের সময়: জানুয়ারি-০৬-২০২২