প্ল্যাটফর্ম | লাইব্রেরির আকার | তাত্ত্বিক ডেটা ফলন (প্রতি সেল) | একক-বেস নির্ভুলতা | অ্যাপ্লিকেশন |
ন্যানোপুর | 8Kb, 10kb, 20kb, আল্ট্রালং, cDNA-PCR | 70-90Gb/সেল | 85-92% | এসভি কলিং, ডি নভো, পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের সিকোয়েন্সিং, আইসো-সেক, জিন টীকা, ডিএনএ মেথিলেশন সনাক্তকরণ |
● বিভিন্ন প্রজাতির সাথে হাজার হাজার বন্ধ প্রকল্প সহ PacBio সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মে 5 বছরের বেশি অভিজ্ঞতা।
● BMKGENE দ্বৈত প্ল্যাটফর্ম RNA/DNA সার্টিফিকেশন সহ অক্সফোর্ড ন্যানোপুরের একটি অফিসিয়াল অংশীদার।
● সম্পূর্ণ সরঞ্জাম এবং পর্যাপ্ত সিকোয়েন্সিং থ্রুপুট সহ সিকোয়েন্সারের মূলধারার মডেল রয়েছে।
● ন্যানোপুর প্ল্যাটফর্মের উপর ভিত্তি করে, 10 টিরও বেশি প্রাণী ও উদ্ভিদ ডেনোভো গবেষণা আন্তর্জাতিকভাবে বিখ্যাত জার্নালে প্রকাশিত হয়েছে।
নমুনার ধরন | পরিমাণ | ঘনত্ব (কিউবিট ®) | আয়তন | বিশুদ্ধতা | অন্যান্য |
জিনোমিক ডিএনএ | ডেটা প্রয়োজনীয়তার উপর নির্ভর করে | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; 260 nm এ পরিষ্কার শিখর, কোন দূষণ নেই | ঘনত্ব Qubit এবং Qubit/Nanopore ≤ 2 দ্বারা পরিমাপ করা প্রয়োজন |
মোট আরএনএ | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5;কোন দূষণ নেই | RIN মান ≥7.5 |
ডিএনএ নমুনার ডেটা গুণমান মূল্যায়ন
সারণি 1. পরিচ্ছন্ন তথ্যের পরিসংখ্যান।
বিএমকেআইডি | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | ক্লিনসামবেস | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
আরএনএ নমুনার ডেটা গুণমান মূল্যায়ন
সারণি 1. পরিচ্ছন্ন তথ্যের পরিসংখ্যান।
ফাইলের নাম | ক্লায়েন্টআইডি | ReadNum | BaseNum | N50 | গড় দৈর্ঘ্য | সর্বোচ্চ দৈর্ঘ্য | মানেকিউস্কোর |
RNA_BMK001 | C2 | ৮,৯৪৭,৭০৮ | ৪,০৪৭,২৩০,০৮৩ | 398 | 452 | 129,227 | প্রশ্ন ১২ |
চিত্র 1. দৈর্ঘ্য বিতরণ পড়ুন
চিত্র 2. পরিষ্কার ডেটার গুণমান স্কোর বিতরণ
চিত্র 3. পরিষ্কার ডেটার দৈর্ঘ্য এবং গুণমান স্কোর বিতরণ