প্ল্যাটফর্ম | সিকোয়েন্সিং মোড | অ্যাপ্লিকেশন |
ইলুমিনা নোভা সিস্টেম | SE50 PE50 PE150 PE250 | 1. পুরো জিনোমগুলিকে দ্রুত ক্রম করুন 2. গভীরভাবে ক্রম লক্ষ্য অঞ্চলে জুম করুন৷ 3. RNA সিকোয়েন্সিং (RNA-Seq) ব্যবহার করুন অভিনব RNA ভেরিয়েন্ট এবং স্প্লাইস সাইটগুলি আবিষ্কার করতে, অথবা জিন এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণের জন্য mRNAs পরিমাপ করুন 4. জিনোম-ওয়াইড ডিএনএ মিথিলেশন এবং ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়াগুলির মতো এপিজেনেটিক কারণগুলি বিশ্লেষণ করুন 5. বিরল সোমাটিক ভেরিয়েন্ট, টিউমার সাবক্লোন এবং আরও অনেক কিছু অধ্যয়নের জন্য সিকোয়েন্স ক্যান্সারের নমুনাগুলি মানুষ বা পরিবেশে অণুজীব বৈচিত্র অধ্যয়ন করুন |
● ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্মে বিভিন্ন প্রজাতির সাথে হাজার হাজার বন্ধ প্রকল্পের ব্যাপক অভিজ্ঞতা।
● পরিপক্ক সিকোয়েন্সিং প্রক্রিয়া অল্প সময়ের সাথে ঘুরে।
● সম্পূর্ণ ডাউনস্ট্রিম বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণ পরিষেবাগুলি।
● কঠোর মান নিয়ন্ত্রণ ব্যবস্থা: সিকোয়েন্সিং ডেটার কঠোর QC মান।
সিকোয়েন্সিং প্ল্যাটফর্ম এবং সিকোয়েন্সিং কৌশল | ডেটা পরিমাণ |
একাগ্রতা
| আয়তন | পরিমাণ | QC ফলাফল |
নোভাসেক সিস্টেম, পেয়ারড-এন্ড 150bp | X≤30Gb | ≥1ng/μl | ≥20 μl | ≥20ng | যোগ্য |
30Gb < X≤100Gb | ≥1ng/μl | ≥25 μl | ≥30ng | ||
X>100 জিবি | ≥2ng/μl | ≥25 μl | ≥50ng |
ঘনত্ব এবং মোট পরিমাণ ছাড়াও, একটি উপযুক্ত শিখর প্যাটার্নও প্রয়োজন।
প্ল্যাটফর্ম
|
একাগ্রতা
| আয়তন | QC ফলাফল |
HiseqXten | ≥2.5nM | ≥20μL | যোগ্য |
NovaSeq 6000 S4 | ≥2nM | ≥30μL | |
NovaSeg 6000 SP | ≥2nM | ≥30μL |
আরএনএ নমুনার ডেটা গুণমান মূল্যায়ন
সারণী 1. সিকোয়েন্সিং ডেটার পরিসংখ্যান।
নমুনা আইডি | বিএমকেআইডি | কাঁচা পড়ে | কাঁচা ডেটা (বিপি) | ক্লিন রিডস (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | ৬,৮৬১,০৩৬,০০০ | ৯৬.৪৮ | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | ৯৮.৯৫ | 93.89 | 37.08 |
চিত্র 1. প্রতিটি নমুনায় পড়া বরাবর গুণমান বিতরণ
চিত্র 2. বেস বিষয়বস্তু বিতরণ
চিত্র 3. সিকোয়েন্সিং ডেটাতে পঠিত বিষয়বস্তুর বিতরণ