পণ্য

*এখানে দেখানো ডেমো ফলাফল সবই Biomarker Technologies এর সাথে প্রকাশিত জিনোম থেকে

1.LTR সন্নিবেশের সময় অনুমান: চিত্রটি অন্যান্য প্রজাতির তুলনায় ওয়েইনিং রাই জিনোমে LTR-RTs সন্নিবেশের সময়ে একটি অনন্য বিমোডাল বিতরণ দেখানো হয়েছে।সবচেয়ে সাম্প্রতিক শিখরটি প্রায় 0.5 মিলিয়ন বছর আগে উপস্থিত হয়েছিল।

লি গুয়াং এট আল।,প্রকৃতি জেনেটিক্স, 2021

2. চায়োট (সেচিয়াম এডুল) এর ফিলোজেনি এবং জিন ফ্যামিলি অ্যানালাইসিস : জিন ফ্যামিলিতে চায়োট এবং অন্যান্য 13টি সম্পর্কিত প্রজাতির বিশ্লেষণ করে, সাপের লাউ (ট্রাইকোস্যান্থেস অ্যাঙ্গুইনা) এর সাথে চায়োট সবচেয়ে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত ছিল।27-45 মায়ায় সাপের লাউ থেকে প্রাপ্ত Chayote এবং সমগ্র জিনোম ডুপ্লিকেশন (WGD) 25±4 Mya সালে chayote-এ পরিলক্ষিত হয়, যা cucuibitaceae-তে তৃতীয় WGD ঘটনা।

ফু এ এট আল।,উদ্যানতত্ত্ব গবেষণা, 2021

3.Synteny বিশ্লেষণ: ফলের বিকাশে ফাইটোহরমোনের সাথে সম্পর্কিত কিছু জিন চায়োট, স্নেক গার্ড এবং স্কোয়াশে পাওয়া গেছে।চায়োট এবং স্কোয়াশের মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্ক ছ্যাওট এবং সাপের লাউয়ের তুলনায় কিছুটা বেশি।

ফু এ এট আল।,উদ্যানতত্ত্ব গবেষণা, 2021

4.জিন পরিবার বিশ্লেষণ: G.thurberi এবং G.davidsonii জিনোমে জিন পরিবারের সম্প্রসারণ এবং সংকোচনের উপর KEGG সমৃদ্ধকরণ দেখায় যে স্টেরয়েড জৈব সংশ্লেষণ এবং ব্রাসিনোস্টেরয়েড জৈব সংশ্লেষণ সম্পর্কিত জিনগুলি প্রসারিত হয়েছিল।

ইয়াং জেড এট আল।,বিএমসি জীববিদ্যা, 2021

5. পুরো জিনোম ডুপ্লিকেশন বিশ্লেষণ: 4DTV এবং Ks ডিস্ট্রিবিউশন বিশ্লেষণে পুরো জিনোম ডুপ্লিকেশন ইভেন্ট দেখানো হয়েছে।অন্তঃপ্রজাতির শিখরগুলি ডুপ্লিকেশন ইভেন্টগুলি দেখানো হয়েছে৷আন্তঃপ্রজাতির শিখরে প্রজাতির ঘটনা দেখানো হয়েছে।বিশ্লেষণটি ইঙ্গিত করেছে যে অন্যান্য তিনটি ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত প্রজাতির সাথে তুলনা করে, ও. ইউরোপিয়া সম্প্রতি একটি বড় আকারের জিনের অনুলিপির মধ্য দিয়ে গেছে।

রাও জি এট আল।,উদ্যানতত্ত্ব গবেষণা, 2021

বিএমকে কেস

কাঁটা ছাড়া গোলাপ: আর্দ্রতা অভিযোজনের সাথে যুক্ত জিনোমিক অন্তর্দৃষ্টি

প্রকাশিত: জাতীয় বিজ্ঞান পর্যালোচনা, 2021

সিকোয়েন্সিং কৌশল:

'বাসে'সকাঁটাবিহীন' (আর।উইচুরাইনান) জিনোম:
প্রায়.93 X PacBio + প্রায়90 X ন্যানোপোর + 267 X ইলুমিনা

মূল ফলাফল

1.উচ্চ মানের R.wichuraiana জিনোম দীর্ঘ-পঠিত সিকোয়েন্সিং কৌশল ব্যবহার করে তৈরি করা হয়েছিল, যা 530.07 Mb এর সমাবেশ দেয় (প্রবাহ সাইটোমেট্রি দ্বারা আনুমানিক জিনোমের আকার ছিল প্রায় 525.9 Mb এবং জিনোম জরিপ দ্বারা 525.5) প্রায় 3% হেটেরোজে।BUSCO আনুমানিক স্কোর ছিল 93.9%।"ওল্ড ব্লাশ" (haploOB) এর সাথে তুলনা করে, এই জিনোমের গুণমান এবং সম্পূর্ণতা বেস একক-বেস নির্ভুলতা এবং LTR সমাবেশ সূচক (LAI=20.03) দ্বারা নিশ্চিত করা হয়েছিল।R.wichuraiana জিনোমে 32,674টি প্রোটিন কোডিং জিন রয়েছে।

2. মাল্টি-ওমিক্স যৌথ বিশ্লেষণ, তুলনামূলক জিনোমিক্স, ট্রান্সক্রিপ্টমিক্স, জিনগত জনসংখ্যার QTL বিশ্লেষণ সমন্বিত, আর. উইচুরায়ানা এবং রোজা চিনেনসিসের মধ্যে গুরুত্বপূর্ণ প্রজাতির প্রকাশ করেছে।এছাড়াও, QTL-তে সম্পর্কিত জিনের অভিব্যক্তির বৈচিত্রটি স্টেম প্রিকেল প্যাটার্নিংয়ের সাথে যুক্ত হওয়ার সম্ভাবনা ছিল।

সিন্টেনি বিশ্লেষণ, জিন ফ্যামিলি ক্লাস্টার, সম্প্রসারণ এবং সংকোচন বিশ্লেষণ সহ বাসেয়ের থর্নলেস এবং রোসা চিনেনসিসের মধ্যে তুলনামূলক জিনোমিক্স বিশ্লেষণ, প্রচুর পরিমাণে বৈচিত্র্য প্রকাশ করেছে, যা গোলাপের গুরুত্বপূর্ণ বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে সম্পর্কিত।NAC এবং FAR1/FRS জিন পরিবারের অনন্য সম্প্রসারণ কালো দাগের প্রতিরোধের সাথে যুক্ত হওয়ার সম্ভাবনা ছিল।

Zhong, M., et al."কাঁটা ছাড়া গোলাপ: আর্দ্রতা অভিযোজনের সাথে যুক্ত জিনোমিক অন্তর্দৃষ্টি"জাতীয় বিজ্ঞান পর্যালোচনা, 2021;, nwab092।