BMKCloud Log in
条形 ব্যানার-03

পণ্য

16S/18S/ITS অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিং-প্যাকবিও

16S এবং 18S rRNA-এর সাবইউনিটটি অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং হাইপার-ভেরিয়েবল উভয় অঞ্চলে প্রোক্যারিওটিক এবং ইউক্যারিওটিক জীব সনাক্তকরণের জন্য একটি নিখুঁত আণবিক আঙুলের ছাপ।সিকোয়েন্সিংয়ের সুবিধা গ্রহণ করে, এই অ্যামপ্লিকনগুলিকে সংরক্ষিত অংশের উপর ভিত্তি করে লক্ষ্যবস্তু করা যেতে পারে এবং অণুজীব বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ, শ্রেণীবিন্যাস, ফাইলোজেনি ইত্যাদি অধ্যয়নে অবদান রাখার জন্য মাইক্রোবায়াল সনাক্তকরণের জন্য হাইপার-ভেরিয়েবল অঞ্চলগুলিকে সম্পূর্ণরূপে চিহ্নিত করা যেতে পারে। একক-অণু রিয়েল-টাইম (SMRT) ) PacBio প্ল্যাটফর্মের সিকোয়েন্সিং অত্যন্ত নির্ভুল দীর্ঘ রিড পেতে সক্ষম করে, যা পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের অ্যামপ্লিকন (প্রায় 1.5 Kb) কভার করতে পারে।জিনগত ক্ষেত্রের প্রশস্ত দৃষ্টিভঙ্গি ব্যাকটেরিয়া বা ছত্রাক সম্প্রদায়ের প্রজাতির টীকাতে রেজোলিউশনকে ব্যাপকভাবে উন্নত করেছে।

প্ল্যাটফর্ম:PacBio সিক্যুয়েল II


পরিষেবার বিবরণ

ডেমো ফলাফল

কেস স্টাডি

পরিষেবার সুবিধা

1

● দীর্ঘ-পঠিত 16S/18S/ITS-এর পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের ক্রম প্রকাশ করে

● PacBio CCS মোড সিকোয়েন্সিং সহ অত্যন্ত নির্ভুল বেস কলিং

● OTU/ASV টীকাতে প্রজাতি-স্তরের রেজোলিউশন

● সর্বশেষ QIIME2 ডাটাবেস, টীকা, OTU/ASV এর পরিপ্রেক্ষিতে বিভিন্ন বিশ্লেষণের সাথে বিশ্লেষণের প্রবাহ।

● বিভিন্ন অণুজীব সম্প্রদায় অধ্যয়নের জন্য প্রযোজ্য

● BMK 100,000-এর বেশি নমুনা/বছর, মাটি, জল, গ্যাস, স্লাজ, মল, অন্ত্র, ত্বক, গাঁজন ঘোল, পোকামাকড়, গাছপালা ইত্যাদির সাথে বিস্তৃত অভিজ্ঞতার মালিক।

● BMKCloud 45টি ব্যক্তিগতকৃত বিশ্লেষণ সরঞ্জাম সহ ডেটা ব্যাখ্যার সুবিধা

পরিষেবা নির্দিষ্টকরণ

সিকোয়েন্সিংপ্ল্যাটফর্ম

লাইব্রেরি

প্রস্তাবিত ডেটা

টার্নরাউন্ড টাইম

PacBio সিক্যুয়েল II

SMRT-ঘণ্টা

5K/10K/20K ট্যাগ

44 কর্মদিবস

বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণ

● কাঁচা ডেটা মান নিয়ন্ত্রণ

● OTU ক্লাস্টারিং/ডি-নোইজ(ASV)

● OTU টীকা

● আলফা বৈচিত্র্য

● বিটা বৈচিত্র্য

● আন্তঃগ্রুপ বিশ্লেষণ

● পরীক্ষামূলক কারণের বিরুদ্ধে অ্যাসোসিয়েশন বিশ্লেষণ

● ফাংশন জিন পূর্বাভাস

16sPacbio

নমুনা প্রয়োজনীয়তা এবং ডেলিভারি

নমুনা প্রয়োজনীয়তা:

জন্যডিএনএ নির্যাস:

নমুনার ধরন

পরিমাণ

একাগ্রতা

বিশুদ্ধতা

ডিএনএ নির্যাস

1 μg

20 ng/μl

OD260/280= 1.6-2.5

পরিবেশগত নমুনার জন্য:

নমুনার ধরন

প্রস্তাবিত নমুনা পদ্ধতি

মাটি

নমুনার পরিমাণ: প্রায়।5 গ্রাম;অবশিষ্ট শুকনো পদার্থ পৃষ্ঠ থেকে অপসারণ করা প্রয়োজন;বড় টুকরা পিষে এবং 2 মিমি ফিল্টার মাধ্যমে পাস;সংরক্ষণের জন্য জীবাণুমুক্ত EP-টিউব বা সাইরোটিউবে অ্যালিকোট নমুনা।

মল

নমুনার পরিমাণ: প্রায়।5 গ্রাম;সংরক্ষণের জন্য জীবাণুমুক্ত ইপি-টিউব বা ক্রায়োটিউবে নমুনা সংগ্রহ এবং অ্যালিকোট করুন।

অন্ত্রের বিষয়বস্তু

অ্যাসেপটিক অবস্থার অধীনে নমুনাগুলি প্রক্রিয়া করা দরকার।PBS সঙ্গে সংগৃহীত টিস্যু ধোয়া;পিবিএসকে সেন্ট্রিফিউজ করুন এবং ইপি-টিউবে প্রিপিপিট্যান্ট সংগ্রহ করুন।

কর্দম

নমুনার পরিমাণ: প্রায়।5 গ্রাম;সংরক্ষণের জন্য জীবাণুমুক্ত ইপি-টিউব বা ক্রায়োটিউবে অ্যালিকোট স্লাজের নমুনা সংগ্রহ করুন

পানি শরীর

সীমিত পরিমাণে মাইক্রোবিয়ালের নমুনার জন্য, যেমন ট্যাপের জল, কূপের জল, ইত্যাদি, কমপক্ষে 1 লিটার জল সংগ্রহ করুন এবং ঝিল্লিতে মাইক্রোবিয়ালকে সমৃদ্ধ করতে 0.22 μm ফিল্টারের মধ্য দিয়ে যান।জীবাণুমুক্ত টিউবে ঝিল্লি সংরক্ষণ করুন।

চামড়া

জীবাণুমুক্ত তুলো সোয়াব বা সার্জিক্যাল ব্লেড দিয়ে ত্বকের পৃষ্ঠকে সাবধানে স্ক্র্যাপ করুন এবং জীবাণুমুক্ত টিউবে রাখুন।

প্রস্তাবিত নমুনা বিতরণ

নমুনাগুলিকে তরল নাইট্রোজেনে 3-4 ঘন্টার জন্য হিমায়িত করুন এবং তরল নাইট্রোজেন বা -80 ডিগ্রিতে দীর্ঘমেয়াদী সংরক্ষণে সংরক্ষণ করুন।শুষ্ক-বরফ সহ নমুনা শিপিং প্রয়োজন।

সার্ভিস ওয়ার্ক ফ্লো

নমুনা বিতরণ

নমুনা বিতরণ

লাইব্রেরি প্রস্তুতি

গ্রন্থাগার নির্মাণ

সিকোয়েন্সিং

সিকোয়েন্সিং

তথ্য বিশ্লেষণ

তথ্য বিশ্লেষণ

পরে বিক্রয় সেবা

পরে বিক্রয় সেবা


  • আগে:
  • পরবর্তী:

  • 1. V3+V4(ইলুমিনা)-ভিত্তিক মাইক্রোবিয়াল কমিউনিটি প্রোফাইলিং বনাম পূর্ণ-দৈর্ঘ্য (PacBio)-ভিত্তিক প্রোফাইলিং-এর টীকা হার।
    (30টি এলোমেলোভাবে বাছাই করা প্রকল্পের ডেটা পরিসংখ্যানের জন্য প্রয়োগ করা হয়েছিল)

    3

    2.বিভিন্ন নমুনা প্রকারে প্রজাতি-স্তরে পূর্ণ-দৈর্ঘ্যের অ্যামপ্লিকন সিকোয়েন্সিংয়ের টীকা হার

    4

    3. প্রজাতি বিতরণ

    5
    4.ফাইলোজেনেটিক গাছ

    6

    বিএমকে কেস

    আর্সেনিক এক্সপোজার অন্ত্রের বাধা ক্ষতি এবং এর ফলে অন্ত্র-লিভার অক্ষের সক্রিয়তা প্ররোচিত করে যা হাঁসের মধ্যে লিভারের প্রদাহ এবং পাইরোপ্টোসিসের দিকে পরিচালিত করে

    প্রকাশিত:মোট পরিবেশের বিজ্ঞান,2021

    সিকোয়েন্সিং কৌশল:

    নমুনা: নিয়ন্ত্রণ বনাম 8 মিলিগ্রাম/কেজি ATO উন্মুক্ত গ্রুপ
    সিকোয়েন্সিং ডেটা ইল্ড: মোট 102,583 কাঁচা CCS সিকোয়েন্স
    নিয়ন্ত্রণ: 54,518 ± 747 কার্যকর সিসিএস
    ATO- উন্মুক্ত : 45,050 ± 1675 কার্যকরী CCS

    মূল ফলাফল

    আলফা বৈচিত্র্য:ATO এক্সপোজার উল্লেখযোগ্যভাবে হাঁসের মধ্যে অন্ত্রের মাইক্রোবিয়াল সমৃদ্ধি এবং বৈচিত্র্য পরিবর্তন করেছে।

    মেটাস্ট্যাট বিশ্লেষণ:
    ফাইলাম স্তরে: 2টি ব্যাকটেরিয়া ফাইলা শুধুমাত্র নিয়ন্ত্রণ গ্রুপে সনাক্ত করা হয়েছে
    জিনাস স্তরে: 6টি জেনার আপেক্ষিক প্রাচুর্যের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা পাওয়া গেছে
    প্রজাতির স্তরে: মোট 36টি প্রজাতি শনাক্ত করা হয়েছিল, যার মধ্যে 6টি রিলেভিভ প্রাচুর্যে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা

    রেফারেন্স

    Thingholm, LB, et al."টাইপ 2 ডায়াবেটিস সহ এবং ছাড়া স্থূল ব্যক্তিরা বিভিন্ন অন্ত্রের মাইক্রোবিয়াল কার্যকরী ক্ষমতা এবং গঠন দেখায়।"সেল হোস্ট এবং মাইক্রোব26.2 (2019)।

    একটি উদ্ধৃতি পেতে

    এখানে আপনার বার্তা লিখুন এবং আমাদের পাঠান

    আমাদের কাছে আপনার বার্তা পাঠান: