Секвениране на малка РНК-Illumina
Характеристика
● Избор на размер на РНК преди подготовката на библиотеката
● Биоинформационен анализ, съсредоточен около прогнозирането на miRNA и техните цели
Предимства на услугата
●Цялостен биоинформатичен анализ:позволяващи идентифицирането както на известни, така и на нови miRNAs, идентифициране на miRNAs мишени и съответната функционална анотация и обогатяване с множество бази данни (KEGG, GO)
●Строг контрол на качеството: ние прилагаме основни контролни точки на всички етапи, от подготовката на пробата и библиотеката до секвенирането и биоинформатиката.Този щателен мониторинг гарантира предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
●Следпродажбена поддръжка: Нашият ангажимент се простира отвъд завършването на проекта с 3-месечен период на следпродажбено обслужване.През това време ние предлагаме проследяване на проекта, помощ при отстраняване на проблеми и сесии с въпроси и отговори, за да отговорим на всякакви въпроси, свързани с резултатите.
●Обширен експертен опит: с опит в успешното приключване на множество sRNA проекти, обхващащи над 100 вида в различни изследователски области, нашият екип внася богат опит във всеки проект.
Примерни изисквания и доставка
| Библиотека | Платформа | Препоръчителни данни | Данни QC |
| Избран размер | Illumina SE50 | 10M-20M четения | Q30≥85% |
Примерни изисквания:
Нуклеотиди:
| Конц. (ng/μl) | Количество (μg) | Чистота | Интегритет |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничено или никакво протеиново или ДНК замърсяване, показано на гела. | RIN≥6,5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ограничено или никакво повишение на базовата линия |
● Растения:
Корен, стъбло или венчелистче: 450 mg
Листа или семена: 300 mg
Плодове: 1,2 g
● Животно:
Сърце или черва: 450 mg
Вътрешни органи или мозък: 240 mg
Мускули: 600 мг
Кости, коса или кожа: 1,5 g
● Членестоноги:
Насекоми: 9гр
Ракообразни: 450 мг
● Цяла кръв: 2 тръби
● Клетки: 106 клетки
● Серум и плазма:6 мл
Препоръчителна доставка на мостри
Контейнер:
2 ml центрофужна епруветка (не се препоръчва калаено фолио)
Примерно етикетиране: Групиране+репликат напр. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Пратка:
1. Сух лед: Пробите трябва да бъдат опаковани в торби и заровени в сух лед.
2. РНК стабилни епруветки: РНК пробите могат да бъдат изсушени в РНК стабилизираща епруветка (напр. RNAstable®) и изпратени при стайна температура.
Работен поток на услугата
Дизайн на експеримента
Доставка на мостри
Екстракция на РНК
Изграждане на библиотека
Секвениране
Анализ на данни
Следпродажбени услуги
Биоинформатика
Идентифициране на miRNA: структура и дълбочина
Диференциална експресия на miRNA - йерархично групиране
Функционална анотация на целта на диференциално експресирани miPHKs
Разгледайте изследователския напредък, улеснен от услугите за секвениране на sRNA на BMKGene чрез подбрана колекция от публикации.
Chen, H. et al.(2023) „Вирусните инфекции инхибират биосинтезата на сапонин и фотосинтезата в Panax notoginseng“, Физиология и биохимия на растенията, 203, стр.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) „Протеинът FREE1, съдържащ растителния домен FYVE, се свързва с микропроцесорни компоненти за потискане на биогенезата на miPHK“, доклади на EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) „МикроРНК Ame-Bantam-3p контролира развитието на какавидите на ларвите чрез насочване към гена 8, подобен на епидермален растежен фактор (megf8) в медоносната пчела, Apis mellifera“, Международен журнал за молекулярни науки, 24(6), стр. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) „Интегриран анализ на MiRNA и гени, свързани с качеството на месото, разкрива, че Gga-MiR-140-5p влияе върху интрамускулното отлагане на мазнини при пилета“, Клетъчна физиология и биохимия, 46 (6), стр. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.
