-
Секвениране на едноядрена РНК
Напредъкът в улавянето на единична клетка и техниката за конструиране на индивидуална библиотека, комбинирана с високопроизводително секвениране, позволява изследвания на генната експресия на база клетка по клетка.Той дава възможност за по-задълбочен и пълен системен анализ на сложни клетъчни популации, при който до голяма степен избягва маскирането на тяхната хетерогенност чрез вземане на средна стойност за всички клетки.
Въпреки това, някои клетки не са подходящи за приготвяне на едноклетъчна суспензия, така че са необходими други методи за приготвяне на проби – извличане на ядра от тъкани, т.е. ядрото се извлича директно от тъканите или клетката и се приготвя в едноядрена суспензия за единични клетъчно секвениране.
BMK предоставя 10× Genomics ChromiumTM базирана услуга за секвениране на РНК на една клетка.Тази услуга е широко използвана в проучвания на изследвания, свързани със заболявания, като диференциация на имунни клетки, туморна хетерогенност, развитие на тъкани и др.
Пространствен транскриптомен чип: 10 × Genomics
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
BMKMANU S1000 пространствен транскриптом
Пространствената транскриптомика стои в челните редици на научните иновации, като дава възможност на изследователите да се впуснат в сложни модели на генна експресия в тъканите, като същевременно запазват техния пространствен контекст.Сред различни платформи BMKGene разработи BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, който се гордее сподобрена резолюцияот 5 µM, достигайки субклетъчния обхват и позволявайкимногостепенни настройки за резолюция.Чипът S1000, включващ приблизително 2 милиона петна, използва микроямки, наслоени с перли, заредени с пространствено баркодирани улавящи сонди.cDNA библиотека, обогатена с пространствени баркодове, се приготвя от чипа S1000 и впоследствие се секвенира на платформата Illumina NovaSeq.Комбинацията от пространствено баркодирани проби и UMI гарантира точността и специфичността на генерираните данни.Уникалният атрибут на чипа BMKManu S1000 се крие в неговата гъвкавост, предлагайки многостепенни настройки за разделителна способност, които могат да бъдат фино настроени към различни тъкани и нива на детайлност.Тази адаптивност позиционира чипа като изключителен избор за разнообразни пространствени транскриптомични изследвания, осигурявайки прецизно пространствено групиране с минимален шум.
Използвайки чипа BMKManu S1000 и други технологии за пространствена транскриптомия, изследователите могат да разберат по-добре пространствената организация на клетките и сложните молекулярни взаимодействия, които се случват в тъканите, предоставяйки безценна представа за механизмите, които са в основата на биологичните процеси в широк спектър от области, включително онкология, неврология, биология на развитието, имунология и ботанически изследвания.
Платформа: BMKManu S1000 чип и Illumina NovaSeq
-
10x пространствен транскриптом на Genomics Visium
Пространствената транскриптомика е авангардна технология, която позволява на изследователите да изследват моделите на генна експресия в тъканите, като същевременно запазват техния пространствен контекст.Една мощна платформа в тази област е 10x Genomics Visium, съчетана със секвениране на Illumina.Принципът на 10X Visium се основава на специализиран чип с определена зона за улавяне, където се поставят тъканни срезове.Тази зона за улавяне съдържа петна с баркод, всяко от които съответства на уникално пространствено местоположение в тъканта.След това уловените РНК молекули от тъканта се маркират с уникални молекулни идентификатори (UMI) по време на процеса на обратна транскрипция.Тези петна с баркод и UMI позволяват прецизно пространствено картографиране и количествено определяне на генната експресия при разделителна способност на една клетка.Комбинацията от пространствено баркодирани проби и UMI гарантира точността и специфичността на генерираните данни.Използвайки тази технология Spatial Transcriptomics, изследователите могат да придобият по-задълбочено разбиране за пространствената организация на клетките и сложните молекулярни взаимодействия, протичащи в тъканите, предлагайки безценна представа за механизмите, лежащи в основата на биологичните процеси в множество области, включително онкология, невронауки, биология на развитието, имунология и ботанически изследвания.
Платформа: 10X Genomics Visium и Illumina NovaSeq
