-
BSA
Платформата Bulked Segregant Analysis се състои от стандартен анализ в една стъпка и разширен анализ с персонализирана настройка на параметри.BSA е техника, използвана за бързо идентифициране на генетични маркери, свързани с фенотип.Основният работен процес на BSA включва: 1. избор на две групи индивиди с изключително противоположни фенотипове;2. обединяване на ДНК, РНК или SLAF-seq (разработено от Biomarker) на всички индивиди за образуване на две големи части от ДНК;3. Идентифициране на диференциални последователности срещу референтен геном или между тях, 4. Предсказване на кандидат-свързани региони чрез ED и SNP-индекс алгоритъм;5. Функционален анализ и обогатяване на гени в региони кандидати и т.н. По-усъвършенствано извличане на данни, включително скрининг на генетични маркери и дизайн на праймер също са налични.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Платформата Amplicon (16S/18S/ITS) е разработена с дългогодишен опит в анализа на проекти за микробно разнообразие, който съдържа стандартизиран основен анализ и персонализиран анализ: основният анализ обхваща основното съдържание на анализ на настоящите микробни изследвания, съдържанието на анализа е богато и изчерпателно, и резултатите от анализа се представят под формата на доклади по проекта;Съдържанието на персонализирания анализ е разнообразно.Пробите могат да се избират и параметрите могат да се задават гъвкаво според основния доклад за анализ и изследователската цел, за да се реализират персонализирани изисквания.Операционна система Windows, проста и бърза.
-
Еволюционна генетика
Еволюционната генетика е пакетирана услуга за секвениране, предназначена за предоставяне на цялостна интерпретация на еволюционната информация на дадени материали въз основа на генетични вариации, включително SNP, InDels, SV и CNV.Той предоставя всички фундаментални анализи, необходими за описване на еволюционните промени и генетичните характеристики на популациите, като структура на популацията, генетично разнообразие, филогенни връзки и т.н. Той също така съдържа изследвания върху потока на гени, което дава възможност за оценка на ефективния размер на популацията, времето на дивергенция.
-
Сравнителна геномика
Сравнителната геномика буквално означава сравняване на пълните геномни последователности и структури на различни видове.Тази дисциплина има за цел да разкрие еволюцията на видовете, генната функция, генния регулаторен механизъм на ниво геном чрез идентифициране на структурите на последователностите и елементите, които са запазени или диференцирани в различни видове.Типичното сравнително геномно изследване включва анализи в генно семейство, еволюционно развитие, дублиране на целия геном, селективен натиск и др.
-
Еволюционна генетика
Платформата за популационен и еволюционен генетичен анализ е създадена на базата на масивен опит, натрупан от години в екипа за научноизследователска и развойна дейност на BMK.Това е удобен за потребителя инструмент, особено за изследователи, които не се занимават с биоинформатика.Тази платформа позволява основен основен анализ, свързан с еволюционната генетика, включително изграждане на филогенетично дърво, анализ на неравновесието на връзката, оценка на генетичното разнообразие, анализ на селективно почистване, анализ на родството, PCA, анализ на популационната структура и др.
-
Hi-C базирано сглобяване на генома
Hi-C е метод, предназначен за улавяне на хромозомна конфигурация чрез комбиниране на сондиране на базирани на близост взаимодействия и високопроизводително секвениране.Смята се, че интензивността на тези взаимодействия е отрицателно свързана с физическото разстояние на хромозомите.Следователно, Hi-C данните биха могли да ръководят групирането, подреждането и ориентирането на сглобени последователности в проект на геном и закрепването им върху определен брой хромозоми.Тази технология дава възможност за сглобяване на геном на ниво хромозома при липса на генетична карта, базирана на населението.Всеки един геном се нуждае от Hi-C.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Секвениране на генома De Novo на растения/животини
Де Новосеквенирането се отнася до изграждането на целия геном на даден вид с помощта на технологии за секвениране, напр. PacBio, Nanopore, NGS и т.н., при липса на референтен геном.Забележителното подобрение в дължината на четене на технологиите за секвениране от трето поколение донесе нови възможности за сглобяване на сложни геноми, като тези с висока хетерозиготност, високо съотношение на повтарящи се региони, полиплоиди и т.н. С дължина на четене на ниво десетки килобази, тези секвенционни четения позволяват разрешаване на повтарящи се елементи, региони с необичайно съдържание на GC и други силно сложни региони.
Платформа: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвениране на целия човешки екзом
Секвенирането на целия екзом (WES) се счита за рентабилна стратегия за секвениране за идентифициране на мутации, причиняващи заболяване.Въпреки че екзоните заемат само приблизително 1,7% от целия геном, той представлява профила на общите белтъчни функции директно.В човешкия геном се съобщава, че повече от 85% от свързаните с болестта мутации се появяват в кодиращия протеин регион.
BMKGENE предлага всеобхватни и гъвкави услуги за секвениране на целия човешки екзом с различни стратегии за улавяне на екзони, налични за постигане на различни изследователски цели.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Секвениране на усилен фрагмент със специфичен локус (SLAF-Seq)
Генотипизирането с висока производителност, особено при широкомащабна популация, е фундаментална стъпка в изследванията на генетичните асоциации, която осигурява генетична основа за функционално откриване на гени, еволюционен анализ и т.н. Вместо дълбоко повторно секвениране на целия геном, секвениране на геном с намалено представяне (RRGS ) се въвежда, за да се минимизират разходите за секвениране на проба, като същевременно се поддържа разумна ефективност при откриването на генетични маркери.Това обикновено се постига чрез извличане на рестрикционен фрагмент в рамките на даден размерен диапазон, който се нарича библиотека с намалено представяне (RRL).Секвенирането на усилен фрагмент със специфичен локус (SLAF-Seq) е самостоятелно разработена стратегия за SNP генотипиране със или без референтен геном.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq -
Illumina и BGI
Технологията за секвениране на Illumina, базирана на секвениране чрез синтез (SBS), е глобално възприета NGS иновация, отговорна за генерирането на над 90% от данните за секвениране в света.Принципът на SBS включва изобразяване на флуоресцентно маркирани обратими терминатори, когато всеки dNTP се добавя и впоследствие се разцепва, за да позволи включването на следващата база.С всичките четири обратими dNTP, свързани с терминатора, присъстващи във всеки цикъл на секвениране, естествената конкуренция минимизира пристрастието при включване.Тази многофункционална технология поддържа както библиотеки за еднократно четене, така и библиотеки с двоен край, обслужвайки набор от геномни приложения.Високопроизводителните възможности и прецизността на секвенирането на Illumina го позиционират като крайъгълен камък в геномните изследвания, давайки възможност на учените да разгадаят тънкостите на геномите с несравними детайли и ефективност.
DNBSEQ, разработена от BGI, е друга иновативна NGS технология, която успя да намали допълнително разходите за последователност и да увеличи пропускателната способност.Подготовката на DNBSEQ библиотеки включва фрагментиране на ДНК, подготовка на ssDNA и амплификация на въртящ се кръг за получаване на ДНК нанотопки (DNB).След това те се зареждат върху твърда повърхност и впоследствие се секвенират чрез комбинаторен синтез на сонда-котва (cPAS).
Нашата предварително създадена услуга за секвениране на библиотеки улеснява клиентите при подготовката на техните библиотеки за секвениране от различни източници (иРНК, цял геном, ампликон, между другото).Впоследствие тези библиотеки могат да бъдат изпратени до нашите центрове за секвениране за контрол на качеството и секвениране в платформи Illumina или BGI.
