-
Имунопреципитационно секвениране на хроматин (ChIP-seq)
ChIP-Seq осигурява профилиране в целия геном на ДНК цели за модификация на хистони, транскрипционни фактори и други свързани с ДНК протеини.Той съчетава селективността на имунопреципитацията на хроматин (ChIP) за възстановяване на специфични комплекси протеин-ДНК със силата на секвенирането от следващо поколение (NGS) за високопроизводително секвениране на възстановената ДНК.Освен това, тъй като комплексите протеин-ДНК се възстановяват от живи клетки, местата на свързване могат да бъдат сравнени в различни типове клетки и тъкани или при различни условия.Приложенията варират от регулация на транскрипцията до пътища на развитие до механизми на заболяването и не само.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Бисулфитно секвениране на целия геном
Метилирането на ДНК на петата позиция в цитозина (5-mC) има фундаментално влияние върху генната експресия и клетъчната активност.Анормалните модели на метилиране са свързани с няколко състояния и заболявания, като рак.WGBS се превърна в златен стандарт за изучаване на метилиране в целия геном при разделителна способност с една база.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
-
Анализ за транспозаза-достъпен хроматин с високопроизводително секвениране (ATAC-seq)
ATAC-seq е високопроизводителен метод за секвениране за анализ на достъпността на хроматина в целия геном, което е важно за глобалния епигенетичен контрол на генната експресия.Секвениращите адаптери се вмъкват в отворени хроматинови региони чрез хиперактивна Tn5 транспозаза.След PCR амплификация се конструира библиотека за секвениране.Всички отворени хроматинови региони могат да бъдат получени при специфични пространствено-времеви условия, не само ограничени до местата на свързване на транскрипционен фактор или определен хистоново модифициран регион.
-
Секвениране на бисулфит с намалено представяне (RRBS)
Изследванията на ДНК метилирането винаги са били гореща тема в изследванията на болестите и са тясно свързани с генната експресия и фенотипичните черти.RRBS е точен, ефикасен и икономичен метод за изследване на ДНК метилиране.Обогатяването на промоторни и CpG островни региони чрез ензимно разцепване (Msp I), комбинирано с бисулфитно секвениране, осигурява откриване на ДНК метилиране с висока разделителна способност.
Платформа: Платформа Illumina NovaSeq
