Докато базираното на NGS mRNA секвениране служи като универсален инструмент за количествено определяне на генната експресия, неговото разчитане на кратки четения ограничава неговата ефикасност при сложни транскриптомични анализи.Секвенирането на PacBio (Iso-Seq), от друга страна, използва технология за дълго четене, което позволява секвенирането на транскрипти на мРНК с пълна дължина.Този подход улеснява цялостно изследване на алтернативен сплайсинг, генни сливания и полиаденилиране, въпреки че не е основният избор за количествено определяне на генната експресия.Комбинацията 2+3 преодолява празнината между Illumina и PacBio, като разчита на PacBio HiFi четения за идентифициране на пълния набор от изоформи на транскрипт и NGS секвениране за количествено определяне на същите изоформи.
Платформи: PacBio Sequel II и Illumina NovaSeq