PacBio-транскриптом с пълна дължина (нереферентен)
Вземайки данни за секвениране на изоформи на Pacific Biosciences (PacBio) като вход, това приложение може да идентифицира последователности на преписи в пълна дължина (без сглобяване).Чрез картографиране на последователности с пълна дължина срещу референтен геном, транскриптите могат да бъдат оптимизирани чрез известни гени, транскрипти, кодиращи региони и т.н. В този случай може да се постигне по-точна идентификация на mRNA структури, като алтернативно снаждане и т.н.Съвместният анализ с данните за секвениране на NGS транскриптоми позволява по-изчерпателна анотация и по-точно количествено определяне на експресията на ниво транскрипт, което до голяма степен облагодетелства диференциалната експресия надолу по веригата и функционалния анализ.