BMKCloud Log in
条形банер-03

Новини

Секвениране на транскриптоми с пълна дължина на базата на нанопори

Секвенирането на нанопори се отличава от другите платформи за секвениране по това, че нуклеотидите се четат директно без ДНК синтез и генерира дълги четения при десетки килобази.Това дава възможност за директно четене на транскрипти с пълна дължина и справяне с предизвикателствата в транскриптомичните изследвания.

√ Ниско отклонение, специфично за последователността

√ Отчитане на пълна дължина на cDNA за изследвания на генната структура

√ Необходими са по-малко данни за покриване на същия брой преписи

√ Идентифициране на множество изоформи на ген

√ Количествено определяне на експресия на ниво изоформа

нанопора-1

Типичен тръбопровод за биоинформатика

Пълен размер-trans-bix-1024x254

Последни успешни случаи с биомаркерни технологии

1. Сравнителни анализи на транскриптоми с пълна дължина разкриват динамиката на развитие на стъблото на Gnetum luofuense

Вестник: Граници в генетиката

Публикувано: март 2021 г

Ключови думи: MinION |Алтернативно снаждане |APA |lncRNA |Диференциално изразени транскрипти

Прочетете пълния текст

2. Еднопосочно движение на малки РНК от издънки към корени в междувидови хетерографти

Вестник: Природни растения

Публикувано: януари 2021 г

Ключови думи: Нанопор |Илюмина |откриване на мобилна иРНК в пълна дължина

3. Пълен транскриптомен анализ на корени от аспержи разкрива молекулярния механизъм на солева толерантност, предизвикана от арбускуларни микоризни гъбички

Вестник: Екологична и експериментална ботаника

Публикувано: януари 2021 г

Ключови думи: MinION |Диференциално изразени транскрипти |Транскрипционни фактори |Алтернативно снаждане

4. Промени в физиологичните характеристики и транскриптом с пълна дължина на корените и листата на роза (Rosa chinensis) в отговор на стреса от суша

Вестник: Физиология на растенията и клетките

Публикувано: октомври 2020 г

Ключови думи: PromethION |Диференциално изразени транскрипти |Функционална прогноза |Сплайсирани изоформи |TF и lncRNA

5. Анализ и цялостно сравнение на PacBio и базирано на нанопори РНК секвениране на транскриптома на Arabidopsis

Вестник: Растителен метод

Публикувано: април 2020 г

Ключови думи: GridION |PromethION |Продължение на PacBio |Illumina NovaSeq |Подреждане на генома |Идентификация на препис |Алтернативно снаждане |SSR |LncRNA |Количествено определяне на изоформата

Новини и Акценти има за цел да сподели най-новите успешни случаи с Biomarker Technologies, да улови нови научни постижения, както и видни техники, приложени по време на проучването.


Време на публикуване: 8 януари 2022 г

Изпратете вашето съобщение до нас: