Комплексните и променливи алтернативни изоформи в организмите са важни генетични механизми за регулиране на генната експресия и протеиновото разнообразие.Точната идентификация на транскриптните структури е основата за задълбочено изследване на моделите за регулиране на генната експресия.Платформата за секвениране на нанопори успешно доведе транскриптомното изследване до ниво на изоформа.Тази платформа за анализ е проектирана да анализира RNA-Seq данни, генерирани на платформата Nanopore на базата на референтен геном, което постига качествени и количествени анализи както на ниво ген, така и на ниво транскрипти.