Изследването на асоциациите в целия геном (GWAS) има за цел да идентифицира генетични варианти (генотип), които са свързани със специфични черти (фенотип).Проучванията на GWA изследват генетичните маркери, пресичащи целия геном на голям брой индивиди и прогнозират асоциациите генотип-фенотип чрез статистически анализ на популационно ниво.Повторното секвениране на целия геном може потенциално да открие всички генетични варианти.Свързване с фенотипни данни, GWAS може да бъде обработено за идентифициране на свързани с фенотипа SNPs, QTLs и кандидат-гени, което силно подкрепя съвременното развъждане на животни/растения.SLAF е самостоятелно разработена опростена стратегия за секвениране на генома, която открива разпределени в целия геном маркери, SNP.Тези SNP, като молекулярни генетични маркери, могат да бъдат обработени за асоциативни изследвания с целеви черти.Това е рентабилна стратегия за идентифициране на сложни черти, свързани с генетични вариации.
