Геномен асоциативен анализ
1. Предимства на услугата
● Изобилие от случаи на проекти: от създаването си през 2009 г. BMKGENE е завършила стотици проекти за видове в изследването на популацията на GWAS, подпомогна изследователите да публикуват повече от 100 статии и кумулативният импакт фактор достигна 500.
● Професионални анализатори.
● Кратък цикъл на анализ.
● Точно извличане на данни.
2. Сервизни спецификации
| Тип | Мащаб на населението | Стратегия за последователност и дълбочина |
| SLAF-GWAS | Номер на пробата ≥200 | Размер на генома < 400M, с реф-геном, WGS се препоръчва |
| Размер на генома ≤ 1G, 100K тагове и 10X | ||
| 1G ≤ размер на генома ≤ 2G, 200K тагове и 10X | ||
| Размер на генома > 2G, 300K тагове и 10X | ||
| WGS-GWAS | Номер на пробата ≥200 | 10X за всяка проба |
3. Избор на материал
Различни сортове, подвидове, местни сортове/генни банки/смесени семейства/диви ресурси
Различни сортове, подвидове, местни сортове
Семейство с полу-братя/семейство с пълни братя/диви ресурси
4. Биоинформационен анализ
● Геномен асоциационен анализ
● Анализ и скрининг на значим SNP
● Функционална анотация на кандидат ген
5. Работен поток на услугата
Дизайн на експеримента
Доставка на мостри
Екстракция на РНК
Изграждане на библиотека
Секвениране
Анализ на данни
Следпродажбени услуги
а.Фенотип QC
Хистограма на честотното разпределение
Фенотипна статистика
b.Анализ на асоциацията (Модел: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ сюжет
Парцел в Манхатън
| година | Журнал | IF | Заглавие |
| 2022 г | NC | 17,69 | Геномна основа на гига-хромозомите и гига-генома на дървесния божур Paeonia ostii |
| 2015 г | NP | 7.43 | Отпечатъците на опитомяването закотвят геномни региони от агрономическо значение в соята |
| 2018 г | MP | 9.32 | Повторното секвениране на целия геном на световна колекция от рапични семена разкрива генетична основа на тяхната екотипова дивергенция |
| 2022 г | HR | 7.29 | Геномният асоциационен анализ предоставя молекулярна представа за естествената вариация на размера на семките на динята |
