BMKGENE предостави услуги за секвениране на пространствени транскриптоми за проучването „STEEL позволява очертаване с висока разделителна способност на пространствено-времеви транскриптомни данни“, което беше публикувано в Briefings in Bioinformatics.
Това проучване предлага неконтролиран и многообразен алгоритъм, базиран на обучение, пространствено транскриптомно клетъчно клъстериране (STEEL), който идентифицира домейни от пространствен транскриптом чрез клъстериране на перли, показващи както много сходни профили на генна експресия, така и близко пространствено разстояние по начина на графики.
Цялостната оценка на STEEL върху масиви от пространствени транскриптомични данни от платформата 10X Visium демонстрира, че не само постига висока разделителна способност за характеризиране на фините структури на мозъка на мишката, но също така позволява интегрирането на множество тъканни слайдове, анализирани индивидуално в по-голям.
С напредването на технологиите за пространствени транскриптоми, нашият метод ще има голяма приложимост при идентификация на домейн и реконструкция на атлас на генна експресия.
Кликнететукза да научите повече за това проучване.
Време на публикуване: 20 октомври 2023 г