Една важна градинарска характеристика, която отличава портокалите от пъпа от другите обикновени сортове сладки портокали, е наличието на пъп върху плода.Тази характеристика също е важен критерий за класификацията на сортовете сладки портокали в градината.
Клиентите на BMKGENE използваха собствено разработената SLAF технология за секвениране на BMKGENE, за да проведат проучване, озаглавено „Копаене на гени, свързани с качеството на плодовете в сладки портокали, на базата на секвениране на специфичен локус усилен фрагмент.“
Проучването включва секвениране на 240 ресурса на зародишна плазма от сладък портокал с голямо генетично разнообразие и различен географски произход, което води до 497,82 Mb данни за кратко четене.Анализът на данните дава 1 467 968 SNP генотипа в целия геном.Чрез използване на Fst анализ, проучването идентифицира 6 кандидат-гена, свързани с наличието на пъп, тегло на плода и титруема киселинност, осигурявайки основа за целенасочено подобряване на сортовете сладки портокали.
За широкомащабно секвениране на популации, секвенирането на специфичен локус с усилен фрагмент (SLAF) е по-рентабилно и високоефективно в сравнение със секвенирането на целия геном (WGS).
Кликнететукза да научите повече за това проучване.
Време на публикуване: 05 декември 2023 г