● Голям опит: Над 200 000 проби са обработени в BMK, обхващащи различни типове проби, включително клетъчни култури, тъкани, телесни течности и т.н. и над 7 000 затворени mRNA-Seq проекта, обхващащи различни изследователски области.
● Строга система за контрол на качеството: Основните точки за контрол на качеството през всички стъпки, включително подготовка на проби, подготовка на библиотека, секвениране и биоинформатика, са под внимателно наблюдение, за да се осигурят висококачествени резултати.
● Множество бази данни, достъпни за анотация на функции и проучвания за обогатяване за изпълнение на различни изследователски цели.
● Следпродажбени услуги: Следпродажбени услуги, валидни за 3 месеца след завършване на проекта, включително проследяване на проекта, отстраняване на неизправности, резултати, въпроси и отговори и т.н.
Библиотека | Стратегия за последователност | Препоръчителни данни | Контрол на качеството |
Поли А обогатен | Ilumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Нуклеотиди:
Конц. (ng/μl) | Количество (μg) | Чистота | Интегритет |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Ограничено или никакво протеиново или ДНК замърсяване, показано на гела. | За растения: RIN≥6.5; За животни: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ограничено или никакво повишение на базовата линия |
Кърпа: Тегло (суха):≥1 g
*За тъкани, по-малки от 5 mg, препоръчваме да изпратите бързо замразена (в течен азот) тъканна проба.
Клетъчна суспензия:Брой клетки = 3×106- 1×107
*Препоръчваме да изпратите замразен клетъчен лизат.В случай, че тази клетка е по-малка от 5×105.
Кръвни проби:Обем≥1 мл
Микроорганизъм:Маса ≥ 1 g
Контейнер: центрофужна епруветка от 2 ml (не се препоръчва калаено фолио)
Примерно етикетиране: Групиране+репликат напр. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Пратка:
Биоинформатика
Еукариотни Работен процес на анализ на секвениране на иРНК
Биоинформатика
ØКонтрол на качеството на необработените данни
ØПодреждане на референтния геном
ØАнализ на структурата на транскрипта
ØКоличествено определяне на израза
ØАнализ на диференциален израз
ØФункционално анотиране и обогатяване
1.mRNA Data Saturation curve
2.Диференциален анализ на израза - графика на вулкан
3.KEGG анотация на DEG
4.GO класификация на DEG