BMKCloud Log in
条形банер-03

Продукти

Еукариотно иРНК секвениране-Illumina

Секвенирането на иРНК позволява профилиране на всички иРНК, транскриптирани от клетки при специфични условия.Това е мощна технология за разкриване на профил на генна експресия, генни структури и молекулярни механизми на определени биологични процеси.Към днешна дата секвенирането на иРНК се използва широко във фундаментални изследвания, клинична диагностика, разработване на лекарства и др.

Платформа: Платформа Illumina NovaSeq


Подробности за услугата

Биоинформатика

Демо резултати

Предимства

● Голям опит: Над 200 000 проби са обработени в BMK, обхващащи различни типове проби, включително клетъчни култури, тъкани, телесни течности и т.н. и над 7 000 затворени mRNA-Seq проекта, обхващащи различни изследователски области.

● Строга система за контрол на качеството: Основните точки за контрол на качеството през всички стъпки, включително подготовка на проби, подготовка на библиотека, секвениране и биоинформатика, са под внимателно наблюдение, за да се осигурят висококачествени резултати.

● Множество бази данни, достъпни за анотация на функции и проучвания за обогатяване за изпълнение на различни изследователски цели.

● Следпродажбени услуги: Следпродажбени услуги, валидни за 3 месеца след завършване на проекта, включително проследяване на проекта, отстраняване на неизправности, резултати, въпроси и отговори и т.н.

Примерни изисквания и доставка

Библиотека Стратегия за последователност Препоръчителни данни Контрол на качеството
Поли А обогатен Ilumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Примерни изисквания:

Нуклеотиди:

Конц. (ng/μl)

Количество (μg)

Чистота

Интегритет

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Ограничено или никакво протеиново или ДНК замърсяване, показано на гела.

За растения: RIN≥6.5;

За животни: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

ограничено или никакво повишение на базовата линия

Кърпа: Тегло (суха):≥1 g
*За тъкани, по-малки от 5 mg, препоръчваме да изпратите бързо замразена (в течен азот) тъканна проба.

Клетъчна суспензия:Брой клетки = 3×106- 1×107
*Препоръчваме да изпратите замразен клетъчен лизат.В случай, че тази клетка е по-малка от 5×105.

Кръвни проби:Обем≥1 мл

Микроорганизъм:Маса ≥ 1 g

Препоръчителна доставка на мостри

Контейнер: центрофужна епруветка от 2 ml (не се препоръчва калаено фолио)

Примерно етикетиране: Групиране+репликат напр. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Пратка:

  1. Сух лед: Пробите трябва да бъдат опаковани в торби и заровени в сух лед.
  2. РНК стабилни епруветки: РНК пробите могат да бъдат изсушени в РНК стабилизираща епруветка (напр. RNAstable®) и изпратени при стайна температура.

Работен поток на услугата

Примерен QC

Дизайн на експеримента

доставка на проби

Доставка на мостри

Пилотен експеримент

Екстракция на РНК

Подготовка на библиотеката

Изграждане на библиотека

Секвениране

Секвениране

Анализ на данни

Анализ на данни

Следпродажбени услуги

Следпродажбени услуги


  • Предишен:
  • Следващия:

  • Биоинформатика

    wps_doc_10

    Еукариотни Работен процес на анализ на секвениране на иРНК

    Биоинформатика

    ØКонтрол на качеството на необработените данни

    ØПодреждане на референтния геном

    ØАнализ на структурата на транскрипта

    ØКоличествено определяне на израза

    ØАнализ на диференциален израз

    ØФункционално анотиране и обогатяване

    1.mRNA Data Saturation curve

    3(1)

    2.Диференциален анализ на израза - графика на вулкан

    4(1)

    3.KEGG анотация на DEG

    5(1)

    4.GO класификация на DEG

    6(1)

    получите оферта

    Напишете вашето съобщение тук и ни го изпратете

    Изпратете вашето съобщение до нас: