●Платформи:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten и BGI-DNB-T7
●Режими на последователност:PE50, PE100, PE150, PE250
●Контрол на качеството на библиотеките преди секвениране
●Подреждане на доставка на данни и QC:доставка на QC отчет и необработени данни във формат fastq след демултиплексиране и филтриране на Q30 четения.
●Гъвкавост на услугите за секвениране:клиентът може да избере последователност по лента, поточна клетка или количество данни.
●Универсалност на платформите:DNB библиотеките могат да бъдат прехвърлени към платформите на Illumina
●Обширен опит в платформата за секвениране на Illumina:с хиляди затворени проекти с различни видове.
●Доставка на QC доклад за секвениране:с показатели за качество, точност на данните и цялостно изпълнение на проекта за секвениране.
●Зрял процес на секвениране:с кратко време за изпълнение.
●Строг контрол на качеството: прилагаме строги изисквания за контрол на качеството, за да гарантираме предоставянето на постоянно висококачествени резултати.
Количество данни (X) | Концентрация (qPCR/nM) | Сила на звука |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Платформа | Концентрация (qPCR/nM) | Сила на звука |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
В допълнение към концентрацията и общото количество е необходим и подходящ пиков модел.
Предоставя се отчет за качеството на библиотеката преди секвениране, оценка на количеството на библиотеката и фрагментиране.
Таблица 1. Статистически данни за секвениране на данни.
Примерен идентификатор | BMKID | Сурови четения | Сурови данни (bp) | Чисто четене (%) | Q20 (%) | Q30(%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Фигура 1. Разпределение на качеството по отчитанията във всяка проба
Фигура 2. Базово разпределение на съдържанието
Фигура 3. Разпределение на прочетеното съдържание в данните за последователност